三穗鸭IP3R3基因SNP位点鉴定及其对蛋壳品质的影响

发布时间：2025-01-14 22:00

　　 【目的】明确IP3R3对蛋壳性状的效应机制及其在蛋壳品质改良中的应用价值,为开展蛋壳品质改良分子标记育种提供参考依据,也为深入研究IP3R3基因的生物学功能打下基础。【方法】以288羽三穗鸭为研究对象,收集45周龄母鸭生产的鸭蛋,测定蛋重、蛋形指数、蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋壳重;采用DNA直接测序法对三穗鸭IP3R3基因SNP位点进行鉴定,使用SHEsis进行单倍型及连锁不平衡分析,通过RNAfold预测不同单倍型的mRNA二级结构和自由能,并以SPSS 18.0中的一般线性模型（GLM）对三穗鸭IP3R3基因SNP位点与蛋壳品质进行关联分析。【结果】在三穗鸭IP3R3基因外显子上发现2个SNPs位点,分别位于第49外显子的g.35195T>C和g.35207G>A,均属于同义突变,且均存在3种基因型,对应的多肽信息含量（PIC）分别为0.330和0.276,属于中度多态位点（0.25C和g.35207G>A位点产生的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（χ²-HWE<5.991）,但2个S...

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【部分图文】：

图1 三穗鸭IP3R3基因SNP位点鉴定结果

利用设计的5对特异性引物对三穗鸭IP3R3基因进行PCR扩增，每个样品均单独直接测序和序列比对分析，结果如图1所示。在三穗鸭IP3R3基因外显子上发现2个SNPs位点，分别位于第49外显子的g.35195T>C和g.35207G>A，且均未引起编码氨基酸发生改变，属于同义突变。2....

图2 3种单倍型的m RNA二级结构及其最小自由能

采用RNAfold对所构建的3种单倍型mRNA二级结构进行预测分析，结果（图2）显示，3种单倍型的mRNA二级结构存在一定差异（圆圈部分），对应的mRNA二级结构最小自由能也不同，其中，单倍型H1的mRNA二级结构最小自由能为-475.50kJ/mol，单倍型H2的为-476.....

本文编号：4027178