RNA-seq转录组测序分析不同季节对槟榔江水牛精液品质的影响

发布时间：2017-07-01 21:16

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【摘要】：本研究旨在利用RNA-seq技术对不同季节槟榔江水牛全血mRNA进行分析,找出不同季节精液品质候选基因。选取5头生长状况相近的3~5岁槟榔江水牛,进行春、夏、秋、冬4个季节的精液品质(鲜精活力、精子畸形率、射精量、精子密度)检测。根据精液品质,选取差异极显著的春(BL)、夏(SBL)两个季节的水牛样品进行RNA-seq转录组测序分析。颈静脉采集全血,抽提mRNA并组内混合制样,利用RNA-seq技术分析不同季节槟榔江水牛全血mRNA差异表达。根据差异倍数1.5,P0.05的标准进行筛选,得到差异基因,再利用DAVID6.7软件对差异基因进行GO和KEGG分析,通过RT-PCR验证基因芯片结果的准确性。结果表明:差异表达基因84个,其中上调基因56个,下调基因28个;GO分析发现,这些差异基因与应激反应、免疫反应有关;KEGG分析表明,差异基因显著富集到肿瘤坏死因子(TNF)和T细胞受体信号通路。其中,神经营养因子受体类似物死亡结构域(NRADD,又叫热休克蛋白因子1(HSF1))、原癌基因FOS和JUN,与精液品质相关性强,可作为进一步研究的靶基因。
【作者单位】： 南京农业大学动物科技学院;
【关键词】： RNA-seq 槟榔江水牛 差异表达基因 精液品质
【基金】：国家自然科学基金项目(31372290) “十二五”国家科技计划项目(2012BAD12B10)
【分类号】：S823.83
【正文快照】： 槟榔江水牛(Betelnut-jiang buffalo)是中国发现唯一的河流型水牛,主产于腾冲槟榔江上游,槟榔江水牛体型较小,饲料消耗较低,而且产奶量相对较高,牛奶营养丰富,是比较好的乳用品种。当前,人工授精技术及冷冻精液的日益普及,具有优良性状的种公牛越来越受到重视。槟榔江水牛作为

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