鸡TGF-β2基因启动子区多态性分析
本文关键词:鸡TGF-β2基因启动子区多态性分析
【摘要】:为了研究鸡TGF-β2基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用PCR-SSCP方法对16个鸡种的TGF-β2启动子区的554~824 bp(即3号染色体的19 433 476~19 433 746 bp)进行基因分型,经测序,共检测到3个有效的SNPs位点,分别是679位点的C/G,699位点的G/A,774位点的T/C。其中大骨鸡和太湖鸡在3个位点均检测到SNP存在,AA鸡在3个位点都没有发现SNPs。分别利用生物信息学软件JASPAR和Meth Primer预测TGF-β2基因启动子区转录因子结合位点和Cp G岛,发现SNP位点可改变转录因子结合位点且位于Cp G岛上,表明TGF-β2启动子区SNPs可能通过不同方式影响基因表达调控。
【作者单位】: 扬州大学动物科学与技术学院;
【关键词】: 鸡 TGF-β 启动子 SNP
【基金】:江苏省六大人才高峰项目资助(2015-NY-019) 江苏省农业科技支撑(BE2013392)
【分类号】:S831.2
【正文快照】: 转化生长因子β(TGF-β)是一类具有多种重要生物活性功能的细胞因子,主要由淋巴细胞、单核细胞和巨噬细胞所释放[1],在调控生物体免疫、创伤愈合、血管生成等生理过程,组织纤维化和癌症等疾病的发生、发展中发挥着重要调控作用[2-3]。TGF-β信号通路中包括50多个与结构相关的
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 Quan R;刘丹;;猪IL-10启动子的克隆及特性分析[J];中国畜牧兽医;2012年07期
2 石元;陈伟;曾勇庆;祝洪磊;徐正刚;张哲;杨云;张天阳;;猪CuZnSOD基因启动子的克隆鉴定及分析[J];生物工程学报;2014年02期
3 孙岩岩;罗卫星;谢海强;宋桃伟;刘彬;蔡惠芬;;贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析[J];生物技术;2014年04期
4 杜巍;李树峰;佟慧丽;杨翠翠;刘丹;严云勤;;牛结蛋白基因启动子的克隆及功能的初步分析[J];畜牧兽医学报;2014年01期
5 王秋华;曹允考;李树峰;佟慧丽;兴孝友;李光鹏;严云勤;;牛MyoG基因启动子的克隆及功能的初步分析[J];畜牧兽医学报;2012年01期
6 李辉;应诗家;施振旦;;猪TREM-1基因的克隆与启动子分析[J];江苏农业学报;2013年05期
7 李朋辉;肖启玲;闫秉芳;王喜亮;肖运才;李自力;刘梅;毕丁仁;石德时;;猪PLE1基因启动子克隆及序列分析[J];中国兽医学报;2014年02期
8 孙岩岩;罗卫星;谢海强;宋桃伟;刘彬;蔡惠芬;;贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析[J];广东农业科学;2014年12期
9 马超锋;梁小娟;王明玉;徐永杰;;猪hnRNPK基因启动子的克隆及序列分析[J];信阳师范学院学报(自然科学版);2014年01期
10 孟仁;陈创夫;张辉;王远志;郭飞;鲁芝子;李瑞芳;;布鲁氏菌2308ery基因启动子缺失株的构建及鉴定[J];生物技术;2012年02期
中国重要会议论文全文数据库 前6条
1 杜爱芳;庞林海;周前进;侯玉慧;高翔;;含肌动蛋白启动子Act-1的单双启动子真核表达载体的构建及表达研究比较[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第九次学术研讨会论文摘要集[C];2006年
2 谢莹;莫德林;陈瑶生;;猪PNAS-4基因启动子调控特征分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
3 赵晓;莫德林;李安宁;陈卫权;张宗武;张之晟;肖书奇;覃丽梅;牛玉娜;陈瑶生;;猪TMOD4基因的克隆、组织表达谱、亚细胞定位以及启动子分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
4 王林杰;熊远著;左波;徐德全;任竹青;雷明刚;;猪AMPD1基因的转录调控研究及其启动子区域的SNP的发掘[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
5 曹瑞兵;顾金燕;张羽;陈溥言;;PCV2 Rep基因启动子区vISRE突变株的生物学特性研究[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集(上册)[C];2009年
6 王春生;余刚;张立新;安铁洙;;绵羊毛发角蛋白结合蛋白启动子的克隆及其在成纤维细胞中的活性分析[A];中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第十四次学术研讨会论文集[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前3条
1 马诚太;不同启动子和插入位点表达AIV-H9 HA抗原的重组马立克氏病病毒的构建和比较研究[D];山东农业大学;2014年
2 韦光辉;徐淮山羊Sox2、c-Myc和Oct4基因启动子功能的初步研究[D];扬州大学;2014年
3 袁晶;经济性状基因CRABP2、TOB1和TIM4功能的初步研究[D];华中农业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前8条
1 牛婷;表达IBV S1蛋白抗原表位的含鸡源启动子的真核表达质粒的构建及其免疫原性检测[D];四川农业大学;2014年
2 赫秋亚;西农萨能奶山羊超长链脂肪酸延伸酶6(ELOVL6)基因启动子转录调控机理研究[D];西北农林科技大学;2016年
3 田家伟;猪PDK4基因启动子的克隆及其活性分析[D];西南大学;2012年
4 夏明秀;鸡Piwill启动子区转录调控元件的初步研究[D];扬州大学;2014年
5 唐澜;兔OCT4基因启动子驱动RFP表达载体的构建及验证[D];东北林业大学;2014年
6 王明明;牛MYOZ1、MYOZ2基因启动子活性分析[D];西北农林科技大学;2015年
7 李君;西农萨能羊脂肪酸合酶(FASN)基因启动子结构和功能研究[D];西北农林科技大学;2011年
8 周计丹;猪O3FAR1基因启动子的克隆及转录调控分析[D];华中农业大学;2014年
,本文编号:529652
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/529652.html