基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

发布时间：2017-08-09 05:22

  本文关键词：基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

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【摘要】：本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序,按照97%的相似度归类操作分类单元(OTUs),去除序列数量少的OTUs(n2),然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明:1)共获得424 062条tags,并归类于1 002个非单OTUs,样品平均tags为(28 271±8 855)条,平均OTUs为(261±82)个。2)所有样品共含有20个菌门,160个菌属。其中,共享核心菌门4个,分别是厚壁菌门(85.35%)、变形菌门(6.09%)、蓝细菌门(2.15%)和放线菌门(0.16%);共享核心菌属19个,占样品微生物总量的93.75%。3)鸡回肠样品预测得出328个功能。从前20个功能热图可知,各样品的效能存在差异。由此可见,鸡回肠微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供了参考依据。
【作者单位】： 四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心;
【关键词】： 肉鸡 回肠 高通量测序 核心菌群 PICRUSt
【基金】：四川省科技厅国际合作项目(2013HH0055)
【分类号】：S831
【正文快照】： 鸡的肠道是一个巨大的生态系统,肠道微生物对鸡的营养、免疫等功能有着重要的影响。鸡肠道的不同部位具有不同的作用,其中回肠是营养物质吸收的关键部位,且微生物多样性较高被人们广泛关注[1]。鸡肠道微生物多样性的研究方法有很多,早期主要采用传统培养的方法[2],但肠道中厌，

本文编号：643716