猪流行性腹泻病毒感染PK-15细胞miRNA的差异表达分析

发布时间：2017-09-28 19:12

  本文关键词：猪流行性腹泻病毒感染PK-15细胞miRNA的差异表达分析

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【摘要】：为研究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diahorrea virus,PEDV)对猪肾传代细胞PK-15miRNA表达谱的影响,将PEDV感染PK-15细胞后,提取总RNA,进行高通量测序,构建感染与未感染PEDV的PK-15细胞的miRNA表达谱,并进行差异性分析,对表达差异显著的miRNA进行heatmap聚类分析及GO(Gene ontology,GO)分子功能(Molecular function,MF)分析,选取10个显著性差异表达的miRNA通过RT-qPCR进行了验证。结果发现,显著性差异表达的miRNA有214个,其中175个miRNA表达上调,39个miRNA表达下调。Heatmap聚类分析表明,病毒组绝大部分差异表达的miRNA较对照组表达量上调,少部分下调。GO分析表明,miRNA广泛参与结合、蛋白结合、蛋白激酶活性、转移酶活性、含磷基团转移、磷酸转移酶活性等生物作用。RT-qPCR验证的各miRNA的表达趋势与高通量测序结果一致。结果表明,猪流行性腹泻病毒感染对PK-15细胞编码的miRNA表达水平有显著影响,从而对进一步研究治疗PEDV的miRNA制剂提供新思路。
【作者单位】： 四川农业大学动物生物技术中心;四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室;
【关键词】： 猪流行性腹泻病毒 miRNA表达谱 PK-细胞
【基金】：教育部长江学者和创新团队发展计划(编号:IRT13083);教育部新世纪优秀人才支持计划(编号:NCET11-1059)
【分类号】：S852.651
【正文快照】： 猪流行性腹泻(Porcine epidemic diahorrea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic di-ahorrea virus,PEDV)引起的猪的一种高度接触性肠道传染病[1],该病目前不仅成为危害我国养猪业的重要疾病之一,而且对全世界的养猪业都危害极大,给养猪业造成了巨大的经济损失。自1976

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1 姜成刚;刘荻，

本文编号：937580