1株快速增殖的HAV分离株基因型分析

发布时间：2017-10-23 12:09

  本文关键词：1株快速增殖的HAV分离株基因型分析

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【摘要】：目的确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点。方法提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件对其进行序列分析和基因型比对。结果 HAV302株VP1/2A区基因序列与Gen Bank中收录的HAVⅠ型中的ⅠB亚型MBB株核苷酸同源性最高(99.4%)。进化树分析显示,HAV302株与MBB株亲缘最近。与MBB株相比,非结构蛋白编码区中的2B和2C区在整个病毒的编码区中变异最大。结论 HAV302株属于HAVⅠ型中的ⅠB亚型,其2B和2C区的变异可能是导致病毒快速增殖的原因之一。
【作者单位】： 解放军第三0二医院实验技术研究保障中心;
【关键词】： 序列分析 甲型肝炎病毒 基因型
【基金】：国家自然基金面上项目(81271846)
【分类号】：R373
【正文快照】： HAV属于小RNA病毒科嗜肝病毒属,其基因组为单股正链RNA,全长约7500个核苷酸。HAV开放读码框架编码一个大的前体蛋白,在病毒蛋白酶的作用下裂解产生11个不同大小的具有不同功能的蛋白,包括结构蛋白VP1、VP2、VP3、VP4以及非结构蛋白2A、2B、2C。一般HAV毒株在细胞培养中增殖缓

【参考文献】

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本文编号：1083321