中国登革Ⅲ型和Ⅳ型病毒分离株及登革Ⅳ型病毒减毒株特性研究
本文关键词:中国登革Ⅲ型和Ⅳ型病毒分离株及登革Ⅳ型病毒减毒株特性研究
更多相关文章: 登革4型病毒 毒力 序列分析 基因型 登革4型病毒 减毒株 毒力 免疫原性 空斑纯化 毒力位点 登革3型病毒 二级结构 亚型 进化树
【摘要】:Ban18株于1981年分离于我国西双版纳地区,将Ban18株和国际标准株H241株分别在Vero细胞和乳鼠脑内传代,用空斑法在Vero细胞单层上进行病毒滴度测定,结果表明两株病毒均对Vero细胞有致细胞病变作用,可以形成肉眼可见的空斑,病毒滴度分别为2.0×105PFU/mL和5.1×107PFU/mL。根据GenBank上已经提交的其它登革4型病毒全基因组序列,设计扩增Ban18株和H241株全基因组的引物,测定两株病毒的基因组序列,并进行比对。测序结果表明,两株病毒全长均为10664nt,含一个开放阅读框,,编码3387个氨基酸,两株病毒核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为99.7%和99.4%,全基因组中共有6个核苷酸差异位点和3个氨基酸差异位点。采用E基因区段序列对两株病毒进行基因分型,两株病毒均为基因Ⅰ型。 将登革4型病毒Ban18株及其在原代地鼠肾细胞上传代的减毒株(Ban18HK20和Ban18HK30株)在Vero细胞传代后进行生物学特征和基因序列特征的研究。结果表明,三株病毒均能被登革4型特异性腹水有效中和,中和指数1000,提示三株病毒均为登革4型病毒。Ban18HK20株和Ban18HK30株在Vero细胞上形成的空斑形态较其母株大且模糊。二者对9~11g小鼠的脑内lg(PFU/LD50)均4.5,而Ban18株的lg(PFU/LD50)为0.4,且二者对2~4日龄乳鼠的致病力也明显低于其母株Ban18株,说明表明Ban18株在传代过程中毒力逐渐减弱。将三株病毒稀释到106PFU/mL后免疫小鼠,两周后用国际标准株H241株进行脑内攻击,结果表明Ban18株和Ban18HK20株对H241脑内攻击的保护指数约为100,而Ban18HK30株对H241的脑内攻击基本没有保护作用,说明前二者的免疫原性较好。同时,为了获得毒力更低的毒株,本实验将两株减毒株Ban18HK20株和Ban18HK30株进行空斑纯化,分别挑选9个和5个空斑克隆进行空斑形态和5~6日龄乳鼠脑内毒力的比较,结果表明从Ban18HK20株挑选的9个克隆株中的3个毒株对乳鼠脑内毒力低于Ban18HK20原株,Ban18HK30株的5个克隆株则无明显差别。 比较Ban18株及其减毒株的全基因组序列,结果表明Ban18株和Ban18HK20株有8处核苷酸差异,其中3处引起氨基酸变化,即C111位、E155位、E369位和3’UTR219位,这几位变化可能与病毒毒力密切相关,特别是E155和3’UTR216,E155位会影响E蛋白的糖基化,3’UTR216位会改变3’UTR的二级结构。 桂登-1株(GD-1株)和桂登-11株(GD-11株)分离自1980年广西合浦县的登革热流行中,均为登革3型病毒。本研究将两株病毒在NIH乳鼠脑内传代两次后,病毒滴度达到3×103PFU/mL,同时将国际登革3型标准株标准株H87在乳鼠脑内传代一次,病毒滴度为2.6×105PFU/mL。前二者在Vero细胞单层上形成的空斑形态与H87株有明显差异。测定上述三株病毒的全基因组序列并进行分析,两株病毒全长均为10707nt,与H87株核苷酸同源性为96.0%,氨基酸同源性为98.8%。GD-1株和GD-11株间仅有4个氨基酸差异,二者和H87株分别存在39和41个氨基酸差异。对3’UTR二级结构进行预测,二者与H87株存在较大差异。根据E蛋白基因序列对两株病毒进行进化分析,结果表明二者均属于亚型Ⅱ,与分离自泰国的两株毒株进化关系最近。
【关键词】:登革4型病毒 毒力 序列分析 基因型 登革4型病毒 减毒株 毒力 免疫原性 空斑纯化 毒力位点 登革3型病毒 二级结构 亚型 进化树
【学位授予单位】:中国食品药品检定研究院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:R373
【目录】:
- 第一部分 我国云南分离株(Ban18)与国际登革 4 型标准株(H241 株)的生物学特性和全基因组序列比较研究5-33
- 中文摘要5-6
- 英文摘要6-7
- 前言7-9
- 材料和方法9-18
- 1 实验材料9-11
- 2 实验方法11-18
- 实验结果18-31
- 1 Ban18 株和 H241 株的生物学特征比较18-19
- 1.1 病毒滴度18
- 1.2 两株病毒特异性鉴定18-19
- 1.3 两株病毒脑内致病力比较19
- 2 Ban18 株和 H241 株全基因序列分析19-31
- 2.1 PCR 扩增结果19-20
- 2.2 H241 株和 Ban18 株的全序列比较20-27
- 2.3 Ban18 株与国内外其它登革 4 型病毒的序列比较27-28
- 2.4 Ban18 株系统进化分析28-31
- 讨论31-32
- 参考文献32-33
- 第二部分 云南登革 4 型版 18 株病毒减毒株的生物学特性和基因全序列研究33-61
- 中文摘要33-34
- 英文摘要34-35
- 前言35-38
- 材料和方法38-44
- 1 实验材料38-40
- 2 实验方法40-44
- 实验结果44-55
- 1 生物学特性44-52
- 1.1 Ban18 减毒株与其母株在 Vero 细胞上的生长曲线44-45
- 1.2 Ban18 减毒株与其母株在 Vero 细胞上空斑形成特征45
- 1.3 登革 4 型特异性血清对三株病毒的中和抑制作用45-46
- 1.4 三株病毒对小鼠的脑内致病力46-47
- 1.5 三株病毒的免疫原性比较47-48
- 1.6 Ban HK20 株和 Ban18 HK30 株各空斑克隆的生物学特征48-52
- 2 Ban18 减毒株与其母株的全基因序列比较52-55
- 2.1 两株病毒 PCR 扩增结果52-53
- 2.2 Ban18 减毒株与其母株的全基因序列比较53-55
- 讨论55-59
- 1 生物学特征研究55-57
- 2 基因序列特征分析57-59
- 参考文献59-61
- 第三部分 中国广西登革 3 型病毒分离株与国际 DEN-3 标准株的生物学和基因特征研究61-79
- 中文摘要61-62
- 英文摘要62-63
- 前言63-65
- 材料和方法65-68
- 1 实验材料65
- 2 实验方法65-68
- 实验结果68-76
- 1 病毒滴度和空斑形态68
- 2 PCR 扩增结果68-69
- 3 GD-1 株和 GD-11 株序列特征分析69-76
- 3.1 GD-1 株和 GD-11 株基因组结构特征69-70
- 3.2 两株病毒与国际标准株 H87 株同源性分析70-71
- 3.3 两株病毒与 H87 株的差异位点71-73
- 3.4 两株病毒系统进化分析73-76
- 讨论76-77
- 参考文献77-79
- 登革病毒减毒疫苗研究进展79-89
- 1 传统减毒疫苗79-81
- 2 新型减毒疫苗81-84
- 3 总结84-85
- 参考文献85-89
- 致谢89-90
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本文编号:1100720
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