中国2011年Ⅲ型脊髓灰质炎病毒基因特征分析
本文关键词:中国2011年Ⅲ型脊髓灰质炎病毒基因特征分析
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【摘要】:目的研究中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2011年急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例粪便标本中分离到的Ⅲ型(Type 3)脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Poliovirus,PV)(PV_Ⅲ)分子生物学特征,为中国维持无脊灰提供实验室依据。方法采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Pogymerase Chain Reaction,RT-PCR)对PV_Ⅲ的衣壳蛋白VP_1编码区基因进行扩增,并对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,对VP_1编码区的核苷酸神经毒力位点和突变热点进行分析,并建立亲缘关系进化树,分析毒株间的进化关系。结果中国2011年从AFP病例粪便标本中,共分离到159株PV_Ⅲ,包括149株疫苗类似株PV和10株免疫缺陷相关的疫苗衍生(Immunodeficiency-associated Vaccine-derived)PV(i_VDPV),未发现Ⅲ型野生型(Wild Type)PV(WPV_Ⅲ)。15株PV_Ⅲ均在VP_1编码区基因已知的神经毒力位点核苷酸2493发生突变。结论突变热点的存在说明PV_Ⅲ的VP_1编码区的核苷酸变异并不是随机分布的,PV_Ⅲ的VP_1编码区基因突变热点可能与PV_Ⅲ的生物学特性有一定的关系。从宁夏回族自治区发现的10株i_VDPVs与以往发现的i_VDPV基因进化上无相关性,证明是新发现的i_VDPV。对VP1编码区的检测为继续维持中国无脊灰状态,为及时发现VDPCs传播和WPV的输入性爆发提供实验室依据。
【作者单位】: 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室 世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室;泰山护理职业学院;泰山医学院;
【关键词】: Ⅲ型脊髓灰质炎病毒 VP_编码区 基因特征 突变热点
【基金】:国家自然科学基金:面上项目Ⅰ型脊髓灰质炎病毒在新疆维吾尔自治区高免疫覆盖人群中传播内在机制的研究(编号:81373049),Ⅱ和Ⅲ型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒在免疫缺陷患者体内复制过程的动态改变课题(编号:81101303) 国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治重大专项病原体网络化检测技术研究——传染病传播的相关环境因素检测和预警框架系统(编号:2008ZX1004-008);传染病及病媒生物控制适宜技术研究——维持无脊髓灰质炎时期外环境脊髓灰质炎病毒检测技术的应用(编号:2008BA156B02)
【分类号】:R373
【正文快照】: 生物控制适宜技术研究——维持无脊髓灰质炎时期外环境脊髓灰质炎病毒检测技术的应用(编号:2008BA156B02)脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Poliovirus,PV)属于无包膜病毒,病毒颗粒是由4个(VP1、VP2、VP3、VP4)包绕衣壳蛋白(Capsid Protein)组成的正20面体的立体结构,内部包裹了一条长约7
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