多重耐药鲍曼不动杆菌整合子分型及流行病学研究

发布时间：2017-11-03 10:32

  本文关键词：多重耐药鲍曼不动杆菌整合子分型及流行病学研究

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【摘要】：鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii A.ba)是不动杆菌属中最为常见的细菌,属于非发酵菌。它不发酵葡萄糖、非苛养、不运动、严格需氧、触媒阳性、氧化酶阴性,为革兰阴性球杆菌。近年来已成为医院感染的主要病原菌,引起较高的发病率和死亡率。鲍曼不动杆菌广泛分布于医院环境及人体的呼吸道、血液、胸腔积液、泌尿道、手术创伤、CNS、皮肤、眼,可引起医院获得性和呼吸机相关肺炎、菌血症、尿路感染、手术部位的感染,对于ICU病房的患者更易感和致命。鲍曼不动杆菌显著地特点是对抗菌药物耐药越来越严重,并在世界范围内传播和流行。多重耐药和泛耐药的鲍曼不动杆菌已成为一个新兴的全球公共卫生问题,其耐药机制复杂,整合子作为耐药基因的载体使其易于获取外源性耐药元件,产生多种耐药表型。鲍曼不动杆菌以克隆传播方式在世界范围内,主要流行克隆为国际克隆Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型。 本研究利用重庆医科大学附属第二医院2011.1-2011.12间临床分离非重复鲍曼不动杆菌189株,通过对抗生素耐药性分析发现,临床分离的鲍曼不动杆菌对15种检测抗生素耐药率均高于60%。MDR、PDR分别高达93.3%、38.7%。检测抗生素的耐药率分别是哌拉西林(92.7%)、氨苄西林/舒巴坦(84.5%)、替卡西林/克拉维酸(80.4%)、头孢他啶(88.7%)、头孢曲松(90.2%)、头孢噻肟(92.2%)、头孢吡肟(93.8%)、亚胺培南(72.2%)、阿米卡星(78.8%)、庆大霉素(81.4%)、妥布霉素(76.8%)、环丙沙星(89.7%)、加替沙星(62.6%)、左氧氟沙星(67%)和复方新诺明(81.4%)。值得关注的是敏感率大于20%的抗生素仅有碳青霉烯类的亚胺培南和氨基糖苷类的妥布霉素,敏感率分别为26.8%和21.1%。 通过对鲍曼不动杆菌整合子的检测与分析,发现Ⅰ型整合子检出率为76.2%(144/189)。获得的条带大小分别为1.3kb、1.6kb、2kb、2.5kb及3.1kb,经过序列分析发现五种耐药基因盒分别为aadA2-HP-dfrA、aacCl-ORF1-ORF2-aadAl、 arr-3-aacA4、dfrA17-aadA5以及aadB-cat-blaOXA10-aadA1。其中aadA2-HP-dfrA型耐药基因盒所占比例为83.9%(135/161),为本研究鲍曼不动杆菌整合子所包括的主要耐药基因组合形式。Ⅱ型整合子8株样品中扩增得到阳性条带,经过序列分析发现Ⅱ型整合子所包括的基因为pilR以及sulfate adenylytransferase。未检测到Ⅱ型整合子。整合子与耐药的统计分析显示整合子阳性与整合子阴性的鲍曼不动杆菌对15种抗生素的耐药率均呈现显著性差异(P0.01)。尽管喹诺酮耐受相关基因并没有在整合子耐药基因盒中检出,但整合子阳性同样与喹诺酮类药物高耐药水平相关。 对ICU分离鲍曼不动杆菌采用rep-PCR结合多位点序列分型(MultiLocus Sequence Typing, MLST)的方法进行分型。设定相似性80%为阈值,相似性大于80%的菌株被认为是同一菌株,ICU的鲍曼不动杆菌可以分为3个亚群。从3个亚群中选取代表性菌株,通过多位点序列分型,确定重庆医科大学附属第二医院ICU主要流行株为international clone2。ICU鲍曼不动杆菌分离株耐药率明显高于整体A.ba。 通过本研究明确了重庆地区鲍曼不动杆菌临床分离株的分子流行病学特征、耐药特征、整合子的携带情况以及整合子与鲍曼不动杆菌耐药之间的关系,为鲍曼不动杆菌医院感染和流行的控制以及鲍曼不动杆菌感染抗生素的合理应用和减少对抗生素耐药提供科学依据。
【关键词】：鲍曼不动杆菌 整合子 耐药 分子流行病学
【学位授予单位】：西南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R378
【目录】：

• 缩略词表4-8
• 摘要8-10
• Abstract10-12
• 第1章 综述12-28
• 1.1 鲍曼不动杆菌流行与耐药12-15
• 1.2 鲍曼不动杆菌的耐药机制15-17
• 1.2.1 对β-内酰胺类抗生素的耐药机制15-16
• 1.2.2 对氨基糖苷类抗生素的耐药机制16
• 1.2.3 对喹诺酮类抗生素的耐药机制16
• 1.2.4 对四环素类抗生素的耐药机制16
• 1.2.5 对多粘菌素的耐药机制16-17
• 1.3 整合子的结构、分类、功能17-24
• 1.3.1 整合子的结构17-18
• 1.3.2 整合子的分类18-19
• 1.3.3 基因盒(gene cassette)19-20
• 1.3.4 基因盒的结构20-21
• 1.3.5 整合子的功能21-23
• 1.3.6 基因盒表达的调节23-24
• 1.3.7 基因盒的表达24
• 1.3.8 整合子与耐药的关系24
• 1.4 鲍曼不动杆菌耐药性与整合子的关系24-27
• 1.4.1 鲍曼不动杆菌I整合子携带的耐药基因及其编码蛋白24-26
• 1.4.2 鲍曼不动杆菌基因组中整合子元件所包含的耐药基因盒26-27
• 1.5 展望27-28
• 第2章 前言28-29
• 第3章 实验材料和方法29-35
• 3.1 实验材料29-31
• 3.1.1 实验菌株29
• 3.1.2 质控菌株29
• 3.1.3 培养基和主要试剂29-31
• 3.1.4 主要仪器31
• 3.2 实验方法31-35
• 3.2.1 鲍曼不动杆菌的分离培养31
• 3.2.2 鲍曼不动杆菌的鉴定与药敏试验31-32
• 3.2.3 鲍曼不动杆菌的保存与复苏32
• 3.2.4 鲍曼不动杆菌基因组的提取32-33
• 3.2.5 鲍曼不动杆菌流行病学特征检测33
• 3.2.6 鲍曼不动杆菌整合子的检测33-34
• 3.2.7 鲍曼不动杆菌MLST分型34-35
• 第4章 结果与分析35-42
• 4.1 鲍曼不动杆菌的药敏结果35-36
• 4.2 临床分离鲍曼不动杆菌整合子分布与基因盒检测36-37
• 4.3 鲍曼不动杆菌整合子分布与耐药表型分析37-38
• 4.4 重症监护室来源鲍曼不动杆菌分型38-42
• 第5章 结论与展望42-44
• 5.1 结论42-43
• 5.1.1 鲍曼不动杆菌对常用抗生素的耐药性42
• 5.1.2 临床分离鲍曼不动杆菌整合子分布与基因盒分布42
• 5.1.3 鲍曼不动杆菌整合子分布与耐药表型的关系42
• 5.1.4 ICU鲍曼不动杆菌流行、耐药特征42-43
• 5.2 展望43-44
• 5.2.1 鲍曼不动杆菌的耐药性43
• 5.2.2 鲍曼不动杆菌耐药机制43
• 5.2.3 鲍曼不动杆菌的流行43-44
• 参考文献44-51
• 致谢51-52
• 在学期间所发表和撰写的文章52

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