河西走廊地域分离幽门螺杆菌vacA和cagA基因遗传多样性分析

发布时间：2017-11-07 11:33

  本文关键词：河西走廊地域分离幽门螺杆菌vacA和cagA基因遗传多样性分析

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【摘要】：目的： 1.探讨河西走廊地域流行幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)重要毒力基因vac A和cagA基因遗传多样性和进化特征,进一步探讨当地上消化道疾病高发原因。 2.探讨河西走廊胃癌高发区患者Hp vacA i区基因型的分布,为进一步研究Hp生物学特性、致病性和致病机制、研制有效疫苗打下基础。方法： 1.采用微需氧培养技术,通过观察培养特性结合形态学、快速尿素酶、氧化酶和触酶试验,从河西走廊地域上消化道疾病患者胃粘膜分离和鉴定Hp。 2.从河西走廊地域Hp菌株中选取30株,PCR扩增Hp vacA和cagA全基因序列,并对扩增产物进行测序。 3.利用NCBI数据库及MEGA5.1软件分析河西走廊地域Hp vacA和cagA基因的测序结果,构建遗传进化树进行相似性和进化距离分析,分析河西走廊地域Hp vacA和cagA与临床病理特征及地域的关系。 4.从河西走廊地域及兰州市分离的61株Hp菌株中,PCR扩增Hp vacA基因i区(i1、i)。分析不同的vacA i区基因型与临床病理特征、年龄以及性别的关系。结果： 1.从河西走廊地域的三家医院分离出的30株Hp,经过PCR扩增,成功获得Hp vacA全基因样本22份,Hp cagA全基因26份。所有样本均成功测序,获得了vacA和cagA全基因序列信息。 2.经过同源性分析发现,在建立的进化树中,河西走廊地域分离的Hp vacA进化更趋近于处在其右侧的SNT49India、F30Japan、F32Japan等亚洲菌株,进化树的平均进化距离为2.53747128；河西走廊地域分离的Hp vacA在进化树中呈集中聚集现象。 3.在建立的进化树中河西走廊地域Hp cagA进化更趋近于处在其右侧的F57Japan、F32Japan等亚洲菌株,进化树的平均进化距离为4.2434595460；河西走廊地域Hp cagA在进化树中集中聚集,并且cagA分别在张掖、金昌、武威各地聚集。 4.在建立的进化树中vacA和cagA基因的进化趋势与疾病的临床病理特征不存在明显相关性。 5.61株Hp vac A i1和i2型的构成比分别为86.89%(53/61)和13.11%(8/61)。vac A i1型在0-40岁、41～60岁年龄组、同性别以及相同病理类型的患者中的感染率均显著高于vacA i2(P0.05),同型的vacA i1和f2在不同性别、60岁以下各年龄间和不同病理类型患者间感染率无显著性差别(P0.05)。60岁以上患者中：Hp vac A i2型感染率显著高于60岁以下各年龄段人群(P0.05)。结论： 1.河西走廊地域流行Hp菌株vacA和cagA基因在进化上更趋同于亚洲株系型。 2.河西走廊地域流行Hp菌株cagA较vac A具有更大的变异性。 3.河西走廊地域Hp菌株vacA和cagA在遗传进化上存在地方聚集性,vacA和cagA进化分布与疾病病理类型无关。 4.河西走廊地域流行Hp菌株vacA i区基因均为阳性,以i1型为主。 5.河西走廊地域流行Hp vacA i区基因型分布与患者的疾病类型、性别等无关；Hp vac A i2型感染呈现随年龄增高而上升的趋势。
【学位授予单位】：兰州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R378

【参考文献】

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1 杨兰泽;高静;米建强;谢顺清;杨冬梅;;胃癌及癌前病变组织中幽门螺杆菌感染与p53、p21WAF1、PCNA、cyclinA蛋白表达的相关性研究[J];实用癌症杂志;2007年02期

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本文编号：1152254