福氏4c志贺菌的脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型分析

发布时间：2018-01-10 03:01

  本文关键词：福氏4c志贺菌的脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型分析　出处：《中国疾病预防控制中心》2008年硕士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】： 我国福氏4c志贺菌的分离率近年来有升高的趋势。我们使用脉冲场凝胶电泳分型方法对2005—2006年在河南省、安徽省、山西省和甘肃省细菌性痢疾监测点分离到的322株福氏4c志贺菌进行了分析,发现有81种带型,以CNJZXN11.0002、CNJZXN11.0003带型为优势带型。其中,河南省、安徽省、山西省均以CNJZXN11.0003为主要带型,甘肃省的优势带型是CNJZXN11.0002。PFGE型别的分布有地区性差异。我们还使用多位点序列分型技术,对24株河南分离的福氏4c志贺菌、9株河南分离的其他血清型的福氏志贺菌和1株宋内志贺菌进行了分析。结果发现,24株福氏4c志贺菌菌株属于一个序列型,命名为ST91。ST91还包括其他血清型志贺菌,譬如福氏1a志贺菌、福氏2a志贺菌和福氏X变种志贺菌。通过与已经完成基因组分析的6株志贺菌和EcMLST数据库中19株志贺菌序列资料所作的种系发生树显示,ST91志贺菌和24577福氏2a志贺菌的亲缘关系较近。ST91志贺菌是我们首先命名的,可能已经在我国流行多年。
[Abstract]:Our separation of Shigella flexneri 4c rate has increased in recent years. We use the typing method from 2005 to 2006 in Henan Province, Anhui Province, pulsed field gel electrophoresis, Shanxi province and Gansu Province, bacterial dysentery monitoring points of 322 isolated strains of Shigella flexneri 4c was analyzed, hair the existing 81 kinds of band type, with CNJZXN11.0002, CNJZXN11.0003 type was the predominant type. Among them, Henan Province, Anhui Province, Shanxi Province, with CNJZXN11.0003 as the main belt, Gansu province is the predominant type of CNJZXN11.0002.PFGE type distribution has regional differences. We also use multilocus sequence typing, flexneri 4c of 24 strains of Shigella isolated in Henan, 9 strains of Shigella flexneri isolates in Henan and 1 strains of other serotypes of Shigella sonnei were analyzed. The results showed that 24 strains of Shigella flexneri 4c strain belongs to a type named ST91.ST91 sequence, including its serotype of him For example, Shigella, S.flexneri 1a, Shigella flexneri 2a and Shigella flexneri X variants. The tree has been completed and a genome analysis of 6 strains of Shigella and EcMLST database sequence data of 19 strains of Shigella by kin ST91 Shiga and 24577 strains of Shigella flexneri 2a is nearly.ST91 of Shigella is our first name, may have been popular for many years in our country.

【学位授予单位】：中国疾病预防控制中心
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2008
【分类号】：R378;R516

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本文编号：1403554