白蛉的数值分类和基于DNA条形码的分子系统学研究

发布时间：2018-02-25 18:32

  本文关键词： 白蛉亚科 白蛉 生物系统学 数值分类 聚类分析 分子系统学 DNA条形码 COI　出处：《暨南大学》2010年硕士论文　论文类型：学位论文

【摘要】： 【目的】 对中国白蛉进行数值分类研究,探索种间分类关系；并通过分子系统学分析探讨DNA条形码用于白蛉种类鉴定的有效性及系统发育探索的可行性；综合传统分类学、数值分类及DNA条形码的分子系统学,以期补充完善白蛉系统学。 【方法】 1.采用选取中国白蛉40个种作为分类单元、68项形态特征为分类指标,通过SPSS15.0软件进行系统聚类分析,用树状图输出结果。 2.选点采集白蛉标本；以传统分类方法进行种类鉴定；进行COI序列扩增及测序；测序结果通过BioEdit软件进行手工校对,用DNAstar中的Seqman进行序列拼接,经在NCBI中Blast相似性搜索,确保为目标序列：最后用MEGA v4.1软件自带的Clustal W程序进行序列比对,并进行序列组成分析、遗传距离计算和分子系统树的构建。 【结果】 1.聚类分析结果与传统分类中的属级分类及白蛉属的亚属级分类情况完全吻合,显示出分类稳定性较强；而在司蛉属内对个别蛉种分类地位给予了一些启示：应氏司蛉、马来司蛉、南京司蛉、兰洲司蛉和吐鲁番司蛉可能居于亚属水平的一个多种亚属或组的位置；歌乐山司蛉、方亮司蛉、云南司蛉和尼克组,则可能占据着一个新的属级阶元的位置。 2.筠连秦蛉、冷氏白蛉、云胜白蛉、鳞喙司蛉标本的COI序列长度包括引物序列在内皆为709bp,碱基使用频率有明显的A、T偏向性；平均转换颠换比为39／34=1.14；种内距离平均为0.0094,远小于种间距离平均值0.1590；基于邻接法(NJ)、最小进化法(ME)、最大简约法(MP)、非加权组平均法(UPGMA)构建的分子系统树显示各蛉种皆形成高支持率的单系,并具有稳定的拓扑结构,支持传统分类结果。 【结论】 数值分类结果与传统分类大体一致,验证了传统分类的可靠性,并揭示了司蛉属中一些蛉种不确定分类问题；COI序列的遗传距离和分子系统树分析结果显示DNA条形码能够很好的对白蛉进行物种识别和系统发育探索,构建综合多方位资料的白蛉DNA条形码数据库系统具有可行性和重要意义。
[Abstract]:[Objective]
Study on numerical classification of Chinese sandflies, explore interspecific relationship and classification; through molecular phylogenetic analysis of DNA barcode for development effectiveness and feasibility of system identification of the species of sandflies; integrated traditional taxonomy, molecular system of numerical taxonomy and DNA bar code, in order to complement the sandfly system.
[method]
The 1. selected 40 species as China sandfly taxa and 68 morphological characteristics as the classification index, cluster analysis was carried out by SPSS15.0 software, using the tree output.
Collect samples of 2. selected sandfly species identification; in the traditional classification method; COI sequence amplification and sequencing; sequencing results by BioEdit software for manual proofreading of sequence in DNAstar Seqman Blast, the similarity in NCBI search, ensure the target sequence: finally MEGA v4.1 software Clustal W program sequences and sequence analysis, construction of genetic distance calculation and molecular phylogenetic tree.
[results]
1. cluster analysis of subgenus classification classification and genus Phlebotomus results with the traditional classification in the genus completely consistent, showing strong stability and classification; in the genus sergentomyia in individual species classification status has given some enlightenment: Yings sergentomyia, Malaysia sergentomyia, Nanjing sergentomyia, Lan Zhou sergentomyia and Turpan sergentomyia may reside in a variety of subgenus or groups and the location of the subgenus level; Geleshan sergentomyia, Fang Liang sergentomyia, Yunnan sergentomyia and Nicky group, is likely to occupy a new genus level position.
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本文编号：1534679