刚地弓形虫ROP12蛋白的生物信息学分析

发布时间：2018-03-28 16:39

  本文选题：刚地弓形虫　切入点：棒状体蛋白　出处：《中国病原生物学杂志》2015年06期

【摘要】：目的通过在线生物程序分析刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)棒状体蛋白12(ROP12)的生物信息学特性。方法通过在线ProtParam、SOSUI、SOPMA、TMHMM、MotifScan及SYFPEITHI等程序,同时结合DNASTAR、DNAMAN生物信息学软件,分析TgROP12蛋白的生物学特性,如理化性质、二级结构、结构域及抗原表位等。结果TgROP12蛋白含有236个氨基酸,其为分子式C1125H1786N308O360S3,其分子质量和理论等电点分别为25.48ku和4.53。TgROP12蛋白具有信号肽序列和跨膜结构区域,其二级结构中β-转角和无规则卷曲分别占7.20%和44.92%;TgROP12蛋白含有8个亲水性较高(临界值为2.0)的区域,10个表面可及性较高(临界值为1.9)的区域;TgROP12蛋白含有保守结构区域和翻译后修饰位点各6个,并含有9个B细胞抗原表位和6个T细胞抗原表位。结论生物信息学分析显示TgROP12蛋白的免疫原性较好,可作为弓形虫病疫苗候选分子。
[Abstract]:Objective to analyze the bioinformatics characteristics of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii) rodlike protein 12 (ROP12). Methods the bioinformatics of TgROP12 protein was analyzed by using the online program ProtParamia SOPMAI TMHMMMMA motifScan and SYFPEITHI, combined with the DNASTARDNAMAN bioinformatics software, and analyzed the bioinformatics of Toxoplasma gondii (Toxoplasma gondii). Results the TgROP12 protein contains 236 amino acids, which is the molecular formula C1125H1786N308O360S3. Its molecular weight and theoretical isoelectric point are 25.48ku and 4.53.TgROP12 proteins with signal peptide sequence and transmembrane structure region, respectively. In its secondary structure, 尾 -rotation angle and irregular crimp accounted for 7.20% and 44.92%, respectively. TgROP12 protein contained 8 regions with high hydrophilicity (critical value 2.0), and 10 regions with higher surface accessibility (critical value 1.9) and TgROP12 protein with conserved structure. And 6 posttranslational modification sites, There are 9 B cell antigen epitopes and 6 T cell antigen epitopes. Conclusion Bioinformatics analysis shows that TgROP12 protein has good immunogenicity and can be used as candidate molecule for Toxoplasma gondii vaccine.
【作者单位】： 河北北方学院病原生物与免疫学研究所;
【基金】：河北北方学院校级重大课题(No.ZD201312)
【分类号】：R382.5

【参考文献】

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4 姜铮;王芳;何湘;刘大伟;陈宣男;赵红庆;黄留玉;袁静;;蛋白质磷酸化修饰的研究进展[J];生物技术通讯;2009年02期

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10 张晓磊;张丽骞;王春苗;姜文静;贾天军;郭玲玲;张进顺;;弓形虫ROP11核酸疫苗免疫保护作用的研究[J];中国病原生物学杂志;2014年10期

【共引文献】

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6 吕燕波,万瑛,吴玉章;SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测[J];免疫学杂志;2003年06期

7 刘婷;王文礼;姜丽丽;;磷酸化蛋白质组学研究现状[J];内蒙古医学院学报;2007年04期

8 张倩;杨振;安学丽;王爱丽;李巧云;晏月明;;蛋白质的磷酸化修饰及其研究方法[J];首都师范大学学报(自然科学版);2006年06期

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