TTV和有关TTV新变种的基因异质性和TTV在恒河猴实验感染的组织嗜性的研究

发布时间：2020-03-26 21:12

【摘要】： TTV有着不同于其它DNA病毒的不寻常程度的基因异质性。为了研究TTV 的新变种，我们收集了中国大陆不同地区的不同人群的血清，利用TTV原型TA278 的引物，经PCR扩增，得到约3244bp的片段。12株ORF1的核苷酸序列进行最大同源性的对准比较，得到了这12株TTV的无根进化树。按照它们的遗传距离，这 12株分属于8个不同的组（A—H），其中TCHNH1属于TTV基因1a型，TCHNA 与GENEBANK注册的TUS01遗传距离最近，TCHNG2与GENEBANK注册的 SANBAN遗传距离最近。这些TTV新变种与TA278的遗传距离超过0.41（TCHNH1 除外）；TCHNA、TCHNB与TUS01遗传距离分别为0.22、0.41；TCHNF、TCHNG1、 TCHNG2与SANBAN的遗传距离分别是0.36、0.30、0.11；各小组间的遗传距离（TCHNC1与TCHNC2、TCHND1与TCHND2、TCHNE1与TCHNE2、TCHNG1 与TCHNG2）分别为0.30、0.22、0.04、0.30。ORF1编码426～780个氨基酸，ORF2 编码141～156个氨基酸。ORF1 ATG启始密码子附近有类似真核蛋白质翻译起始的共同序列（ACCATGG），ORF1终止密码子的下游都有一个保守的真核mRNA的 polyA加尾信号序列（AATAA）。12株ORF1与TA278的核苷酸序列同源性为 48.3-55.0％（TCHNH1除外）；ORF1氨基酸与TA278的同源性为36.2-48.9％（TCHNH1为96.0％），ORF2氨基酸与TA278的同源性为40.0％-46.2％（TCHNH1 为94.0％），氨基酸同源性低于核苷酸序列同源性。ORF1的前65个氨基酸富含精氨酸，同源性也高达56.5％～70.0％；第286～403氨基酸区域是一高变区，同源性只有17.7％～27.0％；与TA278相比，ORF1氨基酸许多位点存在缺失或者插入，只有 65-273，401-491和611-674位点之间没有缺失或插入。尽管氨基酸同源性非常低，但是所有ORF1蛋白和ORF2蛋白都有非常相似的亲水性特征。所有ORF1蛋白有 1～9个糖基化位点，一个YXXK的复制酶基序（亚单位结构域），多个激酶磷酸化位点，，ORF1蛋白可能为TTV的核衣壳蛋白；而ORF2蛋白有类似CAV ORF2的基序（W-X7-H-X3-C-X1-C-X5-H）。总之，尽管这些序列的高度异质性，但是它们都有相似的基因组结构，相似的阅读框，相似的亲水性特征和共同的基序（亚单位结构域），因此这些不同的TTV或者TTV-like病毒可能属于我们至今仍不甚了解的新的病毒家族。我们曾经报道过TTV可能通过肠道传播引起类似肝炎的疾病暴发，我们也在猴子的实验感染中证实了TTV的肠道传播。为了确定TTV的特异的组织嗜性，在感染了TTV的猴子病毒血症期间，收集猴子的各种组织，通过单/双链探针的斑点杂交，检测病毒DNA在各种组织中的存在形式。由于病毒DNA的极性，正义DNA 可能是病毒的复制中间体。在斑点杂交实验中，我们检测到猴于的肝脏、小肠和骨髓组织有正义 DNA。而且我们检测到肝脏中病毒量是血清中的 13．2～78＊倍。因此肝、骨髓和小肠可能是病毒的复制场所，故TTV可能具嗜肝性。
【学位授予单位】：第一军医大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2001
【分类号】：R373

【共引文献】