H19通过干扰hnRNPU-actin复合物抑制RNA聚合酶介导的转录
本文关键词:H19通过干扰hnRNPU-actin复合物抑制RNA聚合酶介导的转录,,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:H19作为最早被发现和研究的少数几个长链非编码RNA分子之一,大量的研究提示H19与肿瘤的发生密切相关。然而H19的具体生物学功能及调控机制,尤其是对转录过程是否存在调节作用尚不清楚。因此探讨H19可能的生物学功能及其具体作用的分子机制可以为H19在生理及病理环境中的重要作用提供线索,带着这些问题我们展开了本课题的研究。 首先,我们进行了RNA pulldown实验,将H19全长及其反义链构建到pSPTl9载体上,体外转录获得H19正义链和反义链RNA后,检测浓度符合要求后冷冻保存。另外,收集肝癌细胞Hep3B和Huh-7的全蛋白待用。利用准备好的上述样品进行最终的RNA pulldown实验,对比正义链和反义链的差异蛋白条带做质谱鉴定后,结果显示H19的相互作用蛋白为核不均一核糖核蛋白(heterogeneous ribonucleopro-tein) hnRNP U。对质谱鉴定的结果通过Western blotting、RIP验证。在两者的结合确定后,为了进一步探明H19的哪个区域与hnRNP U结合,我们H19构建了H19不同区域截短体,通过截短体实验证明与hnRNP U结合的区域位于H19的5’端882nt。 在确定与H19相互作用的蛋白为hnRNP U后,接下来我们便从hnRNP U这个RNA/DNA结合蛋白切入,探索H19的生理、病理学功能及其作用机制。在查阅相关文献后发现,hnRNP U能与不同的转录因子结合发挥不同的功能。而更加值得关注的是hnRNPU在RNA聚合酶Ⅱ介导的转录中也发挥重要的功能。研究报道,hnRNP U和actin结合通过促进RNA聚合酶Ⅱ CTD的磷酸化进而促进RNA聚合酶Ⅱ的转录。基于以上的研究结果的提示,我们首先想证实H19对RNA聚合酶Ⅱ介导的转录是否有调控作用。在Hep3B和Huh-7细胞中进行了EU掺入实验,实验结果表明相对于对照组过表达H19组EU掺入减少,以上结果提示H19抑制了RNA聚合酶Ⅱ介导的转录。 在得出以上实验结果后新的问题需要我们去证实:H19通过怎样的机制抑制RNA聚合酶Ⅱ介导的转录,H19是否会对hnRNP U-actin复合物有影响。我们利用IP实验对以上假设进行检验,在Hep3B和Huh-7细胞中过表达H19,随着H19浓度的升高hnRNP U和actin勺结合呈下降趋势。以上结果说明H19干扰了hnRNP U-actin复合物。那么H19对RNA聚合酶Ⅱ CTD的磷酸化过程是否有调控作用,因此我们分别用RNA聚合酶Ⅱ CTD2位、5位丝氨酸磷酸化及RNA聚合酶Ⅱ总CTD的抗体,相对于对照检测过表达H19对这几种形式蛋白的影响,Western blotting的结果显示H19抑制RNA聚合酶Ⅱ CTD的5位丝氨酸的磷酸化。而在过表达hnRNPU的基础上同时过表达H19时,以上的生物学效应明显减弱,这说明H19的以上生物学功能是依赖hnRNPU实现的。 综上所述,本课题研究对H19在肝癌细胞的生物学功能进行了检测,探讨了H19与hnRNP U的结合及其在肝癌细胞中的抑制RNA聚合酶Ⅱ转录的作用,进一步完善了H19在肝癌细胞中的功能及其作用的机制研究,可能为H19的进一步研究提供线索和依据。
【关键词】:CTD磷酸化 EU掺入 H19 hnRNP U 转录抑制
【学位授予单位】:第二军医大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:R3411
【目录】:
- 摘要5-7
- Abstract7-9
- 缩略词表9-11
- 前言11-13
- 材料和方法13-34
- 一、实验试剂13-15
- 二、主要材料15-16
- 三、实验方法16-34
- 结果34-43
- 一、H19的相互作用蛋白为hnRNP U34-36
- 二、H19的5’端882 nt对与hnRNPU的结合是必需的36-37
- 三、肝癌细胞中H19抑制RNA聚合酶Ⅱ介导的转录37-38
- 四、H19干扰hnRNP U-actin的结合38-39
- 五、H19抑制RNA聚合酶ⅡCTD Ser5磷酸化39-40
- 六、H19下调部分RNA聚合酶Ⅱ转录基因表达水平40-41
- 七、hnRNP U对于H19介导的转录抑制是必需的41-43
- 讨论43-44
- 附录44-50
- 综述50-63
- 参考文献59-63
- 在读期间发表论文和参加科研工作情况说明63-64
- 致谢64
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 Tianzhi Huang;Angel Alvarez;Bo Hu;Shi-Yuan Cheng;;Noncoding RNAs in cancer and cancer stem cells[J];Chinese Journal of Cancer;2013年11期
2 Wenwen Jia;Wen Chen;Jiuhong Kang;;The Functions of MicroRNAs and Long Non-coding RNAs in Embryonic and Induced Pluripotent Stem Cells[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2013年05期
3 Shi-Ping Liu;Jia-Xin Yang;Dong-Yan Cao;Keng Shen;;Identification of differentially expressed long non-coding RNAs in human ovarian cancer cells with different metastatic potentials[J];Cancer Biology & Medicine;2013年03期
4 薛梅;李旭;陈葳;;人UCA1基因转录调控的生物信息学分析与鉴定[J];南方医科大学学报;2013年11期
5 李业;罗朝辉;杨欢;;长链非编码RNA的生物学功能及在神经系统疾病中的作用[J];国际神经病学神经外科学杂志;2013年Z1期
6 韩涛;郭宏骞;;长链非编码RNA与前列腺癌的研究进展[J];临床泌尿外科杂志;2013年06期
7 李慧丽;黄艳;程龙海;;胆管细胞癌中CBX7的表达及临床意义[J];临床与实验病理学杂志;2013年08期
8 李宏;赵雯;陈旭;王荣;赵小庆;;线粒体上核糖核蛋白基因内含子与相应编码序列的相互作用分析[J];内蒙古大学学报(自然科学版);2013年05期
9 郭杏莉;高琳;刘永轩;党合萱;王羽;杨晓飞;罗海涛;;长非编码RNA生物特征研究与分析[J];科学通报;2013年27期
10 QI WenChuan;SONG Xu;LI Ling;;Long non-coding RNA-guided regulation in organisms[J];Science China(Life Sciences);2013年10期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 陈红凯;酵母转录因子Cdc73的结构生物学研究[D];中国科学技术大学;2013年
2 高国振;宿主因子Cyclin T1和Sam68在Ⅰ型人免疫缺陷型病毒生活周期中的功能研究[D];武汉大学;2012年
3 赵小庆;剪切后内含子与相应mRNA的相互作用分析[D];内蒙古大学;2013年
4 陈弘;小RNA诱导INTS6基因激活对去势抵抗性前列腺癌的作用及机制研究[D];浙江大学;2013年
5 张馨予;盐敏感高血压干预新靶标的探索性研究[D];北京协和医学院;2013年
6 何谐;核受体PPARγ和FXR的抗炎机制研究[D];第三军医大学;2013年
7 李昱辰;青春期前双酚A暴露对大鼠卵泡发育的影响及其相关基因的表达与调控[D];福建医科大学;2013年
8 张立国;水稻显性矮秆基因Epi-df的图位克隆、表观修饰特征分析及功能研究[D];南京农业大学;2012年
9 郭杏莉;基于网络模型的基因相关预测问题算法研究[D];西安电子科技大学;2013年
10 杨洁;Sema4C通过介导血管新生和巨噬细胞募集调控肿瘤血管生成的研究[D];华中科技大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘静;P16基因高表达对细胞衰老的调控作用[D];郑州大学;2013年
2 杨继涛;低能激光照射对大鼠梗死心肌组织中氧自由基和心室重塑的影响[D];郑州大学;2013年
3 宋智海;长链非编码RNA TUG1、GAS5在结直肠癌组织中表达差异的研究[D];河北医科大学;2013年
4 车建花;RERT-lncRNA中的一个4bp插入/缺失多态与多种肿瘤易感的关联性分析[D];苏州大学;2013年
5 任晓律;表观遗传调控对人胰腺癌细胞PANC-1增殖和基因表达的影响[D];内蒙古大学;2013年
6 刘永轩;基于MRF的长非编码RNA功能预测方法[D];西安电子科技大学;2013年
7 党合萱;基于多特征的长非编码RNA识别方法[D];西安电子科技大学;2013年
8 包雯;长链非编码RNA-HOTAIRM1、TP53TG1在人神经胶质瘤中的表达分析以及与糖代谢关系的初探[D];北京协和医学院;2013年
9 李睿夫;慢病毒载体稳定转染人角质形成细胞克隆的基因表达谱和蛋白谱分析[D];第三军医大学;2013年
10 张晓姣;长非编码RNA HOTAIR单核苷酸多态性与中国人群肝癌易感性[D];北京化工大学;2013年
本文关键词:H19通过干扰hnRNPU-actin复合物抑制RNA聚合酶介导的转录,由笔耕文化传播整理发布。
本文编号:274117
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/shiyanyixue/274117.html