人DMP1结构及功能的生物信息学分析

发布时间：2020-11-04 01:23

　　 目的预测分析人DMP1的结构与功能,为进一步探讨DMP1作用机制提供借鉴。方法生物信息学方法分析DMP1蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区和信号肽、二级结构、三级结构,潜在磷酸化及糖基化位点、蛋白相互作用网络、5’非翻译区潜在转录因子结合位点和DMP1分子的进化保守性等指标。结果人DMP1蛋白是酸性亲水蛋白;信号肽切割位点位于第16与17位氨基酸之间,无跨膜区;主要二级结构形式为无规卷曲;磷酸化位点123个,O-糖基化位点118个、N-糖基化位点8个;DMP1具有利于蛋白间相互作用的结构特点,5’非翻译区存在多种转录因子潜在结合位点,人体各类组织均有表达,且具有在多种亚细胞结构中定位的特征。结论疏松的结构特征、表达的广泛性、丰富的修饰位点及多种转录因子结合位点均提示DMP1具有更为复杂的生物学功能。
【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
2 结果
    2.1 Dmp1基因的编码产物分析
    2.2 DMP1的理化性质分析
    2.3 DMP1蛋白的亚细胞结构定位分析
    2.4 DMP1蛋白的信号肽、核定位信号及跨膜区分析
    2.5 DMP1蛋白的空间结构预测
    2.6 DMP1蛋白磷酸化位点预测
    2.7 DMP1蛋白N-糖基化位点预测分析
    2.8 蛋白质相互作用、Dmp1基因5’非翻译区分析
    2.9 DMP1在人体正常组织中的表达
    2.10 DMP1的系统进化分析
3 讨论

【参考文献】

相关期刊论文 前1条

1 占柳;谢淑娟;潘卫红;;牙本质基质蛋白-1及其特异性表达的研究进展[J];现代口腔医学杂志;2013年01期

【共引文献】

相关期刊论文 前1条

1 高雪峰;刘英群;王锐;吕晶;耿欣;;犬年轻恒牙组织再生后牙本质基质蛋白1的表达[J];临床口腔医学杂志;2014年02期

【二级参考文献】

相关期刊论文 前3条

1 刘冬梅;董福生;王洁;于利洁;;牙本质基质蛋白1基因转染猪体细胞的实验研究[J];现代口腔医学杂志;2007年04期

2 刘冬梅;董福生;王洁;于利洁;顾洪涛;;牙本质基质蛋白1基因转染猪成纤维细胞的实验研究[J];中华口腔医学杂志;2007年06期

3 逄键梁,吴补领,张亚庆,何宇,何文喜,吴纲,郭鹏;牙本质基质蛋白1在人不同龋坏牙齿中的免疫定位[J];实用口腔医学杂志;2003年05期

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 黄燕;裴晋红;李钰娜;栗学清;武翠玲;郑军;王博;宋丽华;;人DMP1结构及功能的生物信息学分析[J];中国骨质疏松杂志;2019年09期

2 付陈增;蔡丽娜;;结核分枝杆菌蛋白Rv0694的生物信息学分析[J];科学中国人;2017年03期

3 蔡立羽;人类基因组计划中的生物信息学[J];国外医学.生物医学工程分册;1998年01期

4 肖革新,代解杰;生物信息学在病毒学研究中的应用[J];国外医学.病毒学分册;2004年04期

5 顾敏;曹永忠;刘秀梵;;生物信息学在A型流感病毒研究中的应用[J];病毒学报;2011年03期

6 刘元宁;常亚萍;李誌;张浩;田明尧;;针对H1N1病毒的多特征siRNA设计[J];吉林大学学报(工学版);2010年03期

7 时伟丽;王鑫;廖世秀;;人类微小RNA-409-3p靶基因预测及生物信息学分析[J];中国优生与遗传杂志;2017年11期

8 李钧;邵铁娟;濮小英;;生物信息学法筛选志贺氏菌疫苗候选抗原[J];微生物学通报;2010年07期

9 雄英;丁聃;赵巍;;生物信息学在包虫基础研究中的应用前景[J];宁夏医科大学学报;2009年04期

10 周小东;万莉;蔡国才;雷行华;;武汉地区丙型肝炎病毒包膜蛋白E1的生物信息学研究[J];华中师范大学学报(自然科学版);2018年03期

相关博士学位论文 前9条

1 胡瀚洋;差异转录组的生物信息学研究体系在小鼠和人类转录组研究中的应用[D];武汉大学;2014年

2 张焕萍;面向基因表达数据的致病基因挖掘方法研究[D];南京航空航天大学;2009年

3 魏成国;基于生物信息学的麻疹病毒分子进化及肠道病毒鉴定分型研究[D];吉林大学;2013年

4 夏荣;白细胞介素—6诱导相关新基因的功能研究[D];中国人民解放军第一军医大学;2003年

5 袁芳;基于基因功能信息预测疾病相关基因[D];华中科技大学;2008年

6 赵文亮;乙型肝炎病毒基因突变检测与分析平台研发[D];第四军医大学;2014年

7 朱才众;布鲁氏菌噬菌体裂解酶基因表达、生物活性鉴定及裂菌动力学研究[D];第三军医大学;2009年

8 于学东;登革4型病毒基因组5’端SLB和cHP二级结构对复制和翻译的调控作用[D];中国人民解放军军事医学科学院;2008年

9 张志平;神经管畸形与正常胚胎脑组织miRNAs差异表达分析及其靶mRNA的功能预测[D];中国协和医科大学;2010年

相关硕士学位论文 前10条

1 叶琳;生物信息学方法对乙型肝炎病毒的分型和重组检测[D];复旦大学;2009年

2 聂付磊;自然处理肽的生物信息学研究[D];电子科技大学;2014年

3 谭晓罗;鼻疽诺卡菌哺乳动物细胞侵袭蛋白生物信息分析及克隆表达与侵袭性研究[D];南华大学;2016年

4 伍海英;鹦鹉热嗜衣原体Ⅲ型分泌系统效应蛋白的预测、鉴定及特性的研究[D];南华大学;2013年

5 尹丽莉;全新抗菌肽基因的功能及相关研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2006年

6 夏西洋;睾丸蛋白质组学数据翻译后修饰再挖掘[D];南京医科大学;2015年

7 赵虹;探讨调控人SND1蛋白表达的分子机制[D];天津医科大学;2012年

8 赵殷奇;细粒棘球绦虫不同发育阶段表达谱的差异分析及特异性诊断抗原筛选的研究[D];宁夏医科大学;2016年

9 张铁娥;刚地弓形虫棒状体蛋白17的生物信息学分析、克隆表达及重组蛋白的免疫保护性研究[D];山西医科大学;2014年

10 金圣华;Affymetrix基因芯片原始数据噪声分析与应用[D];南京航空航天大学;2011年

本文编号：2869390