鼠疫耶尔森菌YopJ蛋白的基因密码子优化及异源表达纯化
发布时间:2020-12-15 08:07
目的优化鼠疫耶尔森菌YopJ蛋白基因密码子并在大肠埃希菌中进行异源表达纯化。方法依据大肠埃希菌密码子偏好性对鼠疫耶尔森菌YopJ基因进行全基因序列优化,并设计引物。分别以密码子优化前后的鼠疫耶尔森菌YopJ蛋白的基因为模板,将包含YopJ(22aa-288aa)和YopJ(22aa-250aa)的基因片段连接到载体pGI01中。重组质粒转化到大肠埃希菌BL21菌株中,扩大培养后,IPTG诱导目的蛋白表达。提取大肠埃希菌表达蛋白并使用镍离子柱进行纯化。结果鼠疫耶尔森菌YopJ密码子优化前YopJ(22aa-288aa)及YopJ(22aa-250aa)在大肠埃希菌内表达水平较低,密码子优化后YopJ(22aa-288aa)及YopJ(22aa-250aa)在大肠埃希菌内大量表达可溶性YopJ蛋白。结论对鼠疫耶尔森菌YopJ蛋白进行基因密码子优化能够提高其在大肠埃希菌内的表达量。获得的鼠疫耶尔森菌YopJ蛋白具有可溶性,为进一步研究其结构和功能奠定了基础。
【文章来源】:中国病原生物学杂志. 2019年09期 北大核心
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
图1密码子优化前鼠疫耶尔森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization
f、w、e进行SDS-PAGE电泳检测。结果1密码子优化前后鼠疫耶尔森菌YopJ基因序列比较密码子优化前后鼠疫耶尔森菌YopJ基因序列见图1和图2。根据大肠杆菌的密码子偏好性,对YopJ的DNA序列进行优化,保持氨基酸的序列不变,替换了174个碱基。图1密码子优化前鼠疫耶尔森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization图2密码子优化后鼠疫耶尔森菌YopJDNA序列Fig.2TheDNAsequenceofYersiniaYopJaftercodonoptimization2目的基因的鉴定用密码子优化前后各两组引物分别将鼠疫耶尔森菌YopJ22aa-288aa基因及YopJ22aa-250aa基因进行扩增,将PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定,大小分别801bp和687bp(图3)。3重组蛋白的鉴定将含有重组质粒的表达菌分别接种到LB培养基中进行扩大培养,当A600值为0.6~0.8时,16℃降温1h,加入IPTG低温诱导过夜,离心收集菌,破碎,离心得到可溶蛋白,经镍离子亲和层析柱纯化后进行SDS-PAGE,YopJ蛋白相对分子质量约为32×103。其中密码子优化前YopJ22aa-288aa基因无可溶性YopJ蛋白表达,YopJ22aa-250aa基因表达可溶性YopJ蛋白的量较少(图4)。密码子优化后两组基因可溶性
YopJ蛋白表达,YopJ22aa-250aa基因表达可溶性YopJ蛋白的量较少(图4)。密码子优化后两组基因可溶性YopJ蛋白表达水平较密码子优化前有显著提升(图5)。MDNA标志物(DL200)1优化前YopJ22aa-288aa基因PCR产物2优化前YopJ22aa-250aa基因PCR产物3优化后YopJ22aa-288aa基因PCR产物4优化后YopJ22aa-250aa基因PCR产物图3PCR扩增目的基因片段MDNAmarker1YopJ22aa-288aagenebeforeoptimization2YopJ22aa-250aagenebeforeoptimization3YopJ22aa-288aageneafteroptimization4YopJ22aa-250aageneafteroptimizationFig.3IdentificationofPCRproducts·6010·中国病原生物学杂志JournalofPathogenBiology2019年9月第14卷第9期Sep.2019,Vol.14,No.9
本文编号:2917954
【文章来源】:中国病原生物学杂志. 2019年09期 北大核心
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图1密码子优化前鼠疫耶尔森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization
f、w、e进行SDS-PAGE电泳检测。结果1密码子优化前后鼠疫耶尔森菌YopJ基因序列比较密码子优化前后鼠疫耶尔森菌YopJ基因序列见图1和图2。根据大肠杆菌的密码子偏好性,对YopJ的DNA序列进行优化,保持氨基酸的序列不变,替换了174个碱基。图1密码子优化前鼠疫耶尔森菌YopJDNA序列Fig.1TheDNAsequenceofYersiniaYopJbeforecodonoptimization图2密码子优化后鼠疫耶尔森菌YopJDNA序列Fig.2TheDNAsequenceofYersiniaYopJaftercodonoptimization2目的基因的鉴定用密码子优化前后各两组引物分别将鼠疫耶尔森菌YopJ22aa-288aa基因及YopJ22aa-250aa基因进行扩增,将PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定,大小分别801bp和687bp(图3)。3重组蛋白的鉴定将含有重组质粒的表达菌分别接种到LB培养基中进行扩大培养,当A600值为0.6~0.8时,16℃降温1h,加入IPTG低温诱导过夜,离心收集菌,破碎,离心得到可溶蛋白,经镍离子亲和层析柱纯化后进行SDS-PAGE,YopJ蛋白相对分子质量约为32×103。其中密码子优化前YopJ22aa-288aa基因无可溶性YopJ蛋白表达,YopJ22aa-250aa基因表达可溶性YopJ蛋白的量较少(图4)。密码子优化后两组基因可溶性
YopJ蛋白表达,YopJ22aa-250aa基因表达可溶性YopJ蛋白的量较少(图4)。密码子优化后两组基因可溶性YopJ蛋白表达水平较密码子优化前有显著提升(图5)。MDNA标志物(DL200)1优化前YopJ22aa-288aa基因PCR产物2优化前YopJ22aa-250aa基因PCR产物3优化后YopJ22aa-288aa基因PCR产物4优化后YopJ22aa-250aa基因PCR产物图3PCR扩增目的基因片段MDNAmarker1YopJ22aa-288aagenebeforeoptimization2YopJ22aa-250aagenebeforeoptimization3YopJ22aa-288aageneafteroptimization4YopJ22aa-250aageneafteroptimizationFig.3IdentificationofPCRproducts·6010·中国病原生物学杂志JournalofPathogenBiology2019年9月第14卷第9期Sep.2019,Vol.14,No.9
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