鼠视网膜VEGF家族靶点基因相关性分析
发布时间:2021-04-15 14:33
目的比较鼠视网膜Vegf家族几个主要目标基因之间功能和作用途径的异同。方法利用Genenetwork数据库中BXD鼠基因数据对两类抗VEGF药物作用的小鼠Vegf家族靶点基因进行分析比较。采用基因表达水平、目标基因间比较、与目标基因相关的基因间比较、表达量性状位点(e QTL)等多种方法和统计策略,对C57BL/6J XDBA/2J(BXD)重组小鼠近交系(RI)群体的视网膜全基因组表达谱数据中Vegf家族不同靶基因(VegfA、VegfB、VegfC和Pgf)的分子通路或潜在功能的异同进行了比较和研究。结果 Vegf A2在所有VegfA三个基因探针中的表达水平最高。在总体比较中,Vegf A1和Vegf A2的表达水平呈正相关(r=0.541),VegfB与VegfC之间的相关性较弱(r=0.360),Vegf C与Pgf的表达水平也呈弱相关性(r=0.324)。在进一步对目标基因高度相关基因间的比较中,各基因最为相关的50个基因与其他基因之间相互关系均较弱。r值之间的比较中,Vegf B与Vegf A2之间呈现负相关性(R50ab=0.3129,R50ba=-0. 42758),...
【文章来源】:齐齐哈尔医学院学报. 2019,40(17)
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
一、材料和方法
1. 材料:
2. 方法:
3. 评价指标:
4. 统计学方法:
二、结果
1. VEGFA、VEGFB、VEGFC和Pgf在小鼠视网膜中的表达水平:
2. 各基因间相关性的总体比较:
3. 调节小鼠视网膜VegfA、Vegfb、VegfC和Pgf表达水平的eQTLs分析:
本文编号:3139520
【文章来源】:齐齐哈尔医学院学报. 2019,40(17)
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
一、材料和方法
1. 材料:
2. 方法:
3. 评价指标:
4. 统计学方法:
二、结果
1. VEGFA、VEGFB、VEGFC和Pgf在小鼠视网膜中的表达水平:
2. 各基因间相关性的总体比较:
3. 调节小鼠视网膜VegfA、Vegfb、VegfC和Pgf表达水平的eQTLs分析:
本文编号:3139520
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