DNA序列的对称性与真核基因调控元件模块的分析

发布时间：2021-04-26 00:27

　　本文由两大部分组成。首先，我们发现了一些在原核生物及真核生物中存在的DNA对称性现象，并探讨其中的原因；其后，以此为基础建立调控元件模块搜索系统（Cis-Regulatory Module Searching System，CRMSS），部分HLA调控区的搜索结果初步验证了CRMSS系统的正确性和数据管理的可靠性。为清楚起见，背景方法等内容分而表之，而结论部分则概而述之。 DNA序列的对称性 背景 在DNA序列中，对称性似乎是它的一个内在属性。从双链的角度看，A=T，G=C；从单链角度看，也存在A≈T，G≈C的现象。近来的研究表明，不多于9个碱基的寡核苷酸与其互补的寡核苷酸在DNA双链上也存在着对称关系。 为解释单链上的这种现象，Seuoka提出：如果DNA的两条链上在选择压力和自然突变上不存在差异，经过一定的时间后，单核苷酸链上，最终将出现A≈T，G≈C的现象。但从分子生物学实验角度看，在选择压力和自然突变等因素影响下，DNA双链上的基因在复制、转录、修复的过程中存在着各种差异。 目的 1．比较DNA双链编码区及密码子位置上碱基的分布频率，比较氨基... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：113 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
主要缩写词中英文对照表
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 细菌（原核生物）基因组的对称性
    一、 数据和方法
    二、 结果
    三、 讨论
第二部分 酵母（真核生物）基因组的对称性
    一、 数据和方法
    二、 结果
    三、 讨论
第三部分 CRMSS系统的建立
    一、 生物学基础
    二、 数学模型及算法
    三、 CRMSS系统的设计
第四部分 CRMSS系统的初步应用
    一、 数据和方法
    二、 结果
    三、 讨论
回顾与展望
综述 调控元件模块预测方法研究概述
博士期间的工作
致谢



本文编号：3160376