广东人群SLC25A13基因高频突变的熔解曲线分析法筛查

发布时间：2017-05-18 23:09

  本文关键词：广东人群SLC25A13基因高频突变的熔解曲线分析法筛查，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：背景和目的Citrin缺陷病(Citrin deficiency, CD)是SLC25A13基因突变导致的常染色体隐性遗传病，而Citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症(NeonatalIntrahepatic Cholestasis caused by Citrin Deficiency, NICCD,#605814)是当前CD主要的儿科临床表型。本课题组先前的研究发现，我国NICCD患者SLC25A13基因高频突变为851_854del, IVS6+5GA,1638_1660dup, IVS16ins3kb,和g.1399CT，但广东人群中这些突变类型的携带率有待深入研究。熔解曲线分析是近几年发展起来的一种方便、准确、快速的SLC25A13基因突变筛查方法。本研究旨在应用熔解曲线分析法对广东人群SLC25A13基因高频突变进行筛查，为计算该人群的高频突变携带率及CD患病率提供分子流行病学数据。 对象和方法收集2011年4月至2013年3月期间广东省不同城市常住健康体检者血样2428份，其中珠三角地区广州599份，深圳306份，中山240份，惠州190份，佛山223份；珠三角外周地区梅州213份，河源197份，湛江260份，清远200份。应用全血DNA试剂盒提取血样DNA，然后应用熔解曲线分析方法对SLC25A13基因高频突变进行筛查。根据携带者数量和筛查标本数量计算高频突变的携带率，再根据Hardy－Weinberg定律计算广东人群的CD理论患病率。按照标本来源地分组，以P0.05为显著性标准，应用卡方检验比较不同城市人群高频突变携带率的差异。 结果1.本研究共筛查到52个SLC25A13基因突变携带者，其中851_854del携带者41人, IVS6+5GA携带者5人,1638_1660dup携带者2人, IVS16ins3kb携带者2人,另外发现新突变g.1420GA (V474M)携带者2人,但未发现g.1399CT突变携带者。2.广东人群SLC25A13高频基因突变携带率为1/47(52/2428)，理论患病率为1/8800。其中珠三角地区人群高频突变携带率为1/60(26/1558)，理论患病率为1/14400，而珠三角外周人群高频突变携带率为1/33(26/870)，理论患病率为1/4400。3.按照筛查标本来源城市统计，广州、深圳、佛山、惠州、中山、梅州、河源、湛江和清远人群的SLC25A13高频突变携带率分别为1/54，1/61，1/56，1/95，1/60，1/107，1/20、1/33和1/33，而根据Hardy－Weinberg定律推算，以上各城市人群CD理论患病率分别为1/11700，1/14800，1/12500，1/36100，1/14400，，1/45800，1/1600、1/4400和1/4400。 4.珠三角地区与珠三角外围地区人群SLC25A13基因高频突变携带率的差异具有显著性意义，珠三角外围地区高于珠三角地区（2=4.639，P0.05）。珠三角外围城市河源的人群SLC25A13基因高频突变携带率高于珠三角大部分城市(其中广州与河源：2=6.058，P0.05，深圳与河源：2=4.908，P0.05，惠州与河源：2=5.211，P0.05，中山与河源：2=4.056，P0.05)。河源与同样为珠三角外周城市的梅州比较，其SLC25A13基因高频突变携带率的差异具有显著性意义(2=6.166，P0.05)，但与湛江、清远比较，SLC25A13基因高频突变携带率的差异无显著性意义(其中河源与湛江：2=1.184，P0.05，河源与清远：2=1.106，P0.05)。珠三角各城市之间人群的SLC25A13基因高频突变携带率均不存在显著性差异。 结论1.熔解曲线分析方法是一种方便、准确、快速的SLC25A13基因突变筛查方法，而且有助于发现新的基因突变类型。而突变g.1420GA(p.V474M)的发现进一步扩展了SLC25A13基因的突变谱。2.广东省珠三角外周地区人群的SLC25A13基因高频突变携带率高于珠三角地区。3.按照本文筛查结果和最新人口统计数据推算，广东省现有CD患者至少为11800人，其诊断治疗值得重视。4.本研究通过较大样本量的SLC25A13基因高频突变调查，为广东人群CD危害评估提供了初步的分子流行病学数据。
【关键词】：Citrin缺陷病 SLC25A13基因 高频突变 熔解曲线分析
【学位授予单位】：暨南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R394
【目录】：

• 中文摘要3-5
• Abstract5-7
• 目录7-8
• 1 前言8-12
• 2 研究对象与材料12-14
• 2.1 研究对象12
• 2.2 主要试剂12-13
• 2.3 主要实验仪器13-14
• 3 研究方法14-20
• 3.1 基因组 DNA 提取14-15
• 3.2 应用熔解曲线分析方法进行 SLC25A13 基因高频突变筛查15-18
• 3.3 广东不同地区 SLC25A13 基因高频突变携带率和理论患病率18-20
• 4 结果20-28
• 4.1 对熔解曲线分析方法诊断 Citrin 缺陷病的评价20-21
• 4.2 广东地区 SLC25A13 基因高频突变筛查结果21-25
• 4.3 广东地区 SLC25A13 基因高频突变携带率及理论患病率25-26
• 4.4 SLC25A13 基因高频突变携带率地区分布比较26-28
• 5 讨论28-32
• 5.1 熔解曲线分析是一种高效的 SLC25A13 基因突变筛查工具28-29
• 5.2 SLC25A13 基因高频突变筛查结果29-30
• 5.3 SLC25A13 基因高频突变携带率及其地理分布特征30-31
• 5.4 应用熔解曲线分析进行 SLC25A3 基因高频突变筛查意义31-32
• 6 结论32-33
• 7 参考文献33-40
• 主要缩略词中英对照表40-41
• 在校期间发表文章及摘要情况41-42
• 致谢42

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前6条

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  本文关键词：广东人群SLC25A13基因高频突变的熔解曲线分析法筛查，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：377315