研究TET1蛋白在体细胞重编程过程中的作用
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【摘要】:TET蛋白(Ten Eleven Translocation,TET)是一种加氧酶,于2009年首次报道,可催化DNA中胞嘧啶5位碳上的甲基形成羟甲基。TET酶的该催化功能与DNA去甲基化相关,随后便引起了一阵基于DNA水平上表观遗传学的研究热潮。而近年来,随着诱导性多能干细胞(iPS细胞)技术不断地成熟,体细胞重编程技术也在表观遗传学领域中得到了越来越多的重视。 iPS细胞诱导重编程技术是将Yamanaka四因子OKSM(Oct4、Sox2、Klf4、c-Myc)导入体细胞中,使得体细胞重新回到原始多能性状态。随着人们对于这一过程机制的不断探索,重编程的效率也在不断地提高。小分子化合物与转录因子的联合应用,也是目前科学家们最常用的重编程手段。例如维生素C,又称抗坏血酸,一种小分子化合物,可高效提升重编程的效率。而高效重编程技术的建立,,也为科学家对细胞命运调控中转录因子及信号通路的研究提供了一个新的平台。 研究表明MEF细胞中的羟甲基胞嘧啶水平及TET1表达量均很低,而在mES细胞中羟甲基胞嘧啶及TET1蛋白的表达量均较高。所以猜测在体细胞重编程这一过程中,可能会有TET1蛋白的参与。为阐明TET1蛋白及羟甲基化胞嘧啶相关修饰在体细胞重编程过程中的生物学功能,本论文以鼠源细胞为实验对象,以重编程技术为平台,研究在此过程中,TET1蛋白所扮演的角色。我们通过两种方式来研究TET1在重编程中的功能,第一种方法是用TET1基因敲除的MEF细胞进行重编程,从功能缺失的角度去研究TET1蛋白在重编程过程中的重要性。另一种方法是过表达TET1蛋白的截短型——TET1CD,其本身含有TET1蛋白的催化活性区域,以获得功能性实验判断TET1蛋白在这一过程中发挥的作用。 最后通过对实验结果的分析我们发现,TET1蛋白在重编程中的功能是受到培养条件中维生素C调控的。在没有维生素C的调控时,TET1不依靠MET过程而促进重编程。当体系内含有维生素C时,TET1缺失会提高重编程效率,过表达TET1蛋白会抑制重编程进程。而且TET1蛋白在维生素C介导下特异性调控基因组MET相关位点羟甲基胞嘧啶的形成,阻碍MET过程,进而抑制重编程进程。
【关键词】:TET1 重编程 诱导性多能干细胞 DNA 甲基化 维生素C
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R3416
【目录】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-10
- 第1章 绪论10-20
- 1.1 体细胞重编程10-13
- 1.1.1 干细胞与诱导性多能干细胞10-11
- 1.1.2 体细胞重编程11-12
- 1.1.3 体细胞重编程中的表观遗传调控12-13
- 1.2 表观遗传学概述13-16
- 1.2.1 DNA 甲基化13-14
- 1.2.2 hmC 及 DNA 去甲基化14-16
- 1.3 TET 蛋白研究概况16-19
- 1.4 立题依据及意义19-20
- 第2章 体细胞重编程过程中 TET 蛋白的功能研究20-33
- 2.1 实验目的20
- 2.2 实验材料及方法20-28
- 2.2.1 试剂耗材及仪器设备20-24
- 2.2.2 实验方法24-28
- 2.3 实验结果及讨论28-33
- 2.3.1 体细胞重编程过程中过表达 TETCD 蛋白28-31
- 2.3.2 利用 TET1 基因敲除 MEF 细胞进行体细胞重编程31
- 2.3.3 pre-iPS 体系中探索 TET1 蛋白的功能31-33
- 第3章 重编程过程中 TET1 蛋白功能受维生素 C 调节33-38
- 3.1 实验目的33
- 3.2 实验材料及方法33
- 3.3 实验结果与讨论33-38
- 3.3.1 维生素 C 对 TET1CD 的调节作用33-36
- 3.3.2 维生素 C 对 TET1 蛋白的调节作用36-38
- 第4章 维生素 C 调节 TET1 蛋白抑制重编程的机制研究38-47
- 4.1 实验目的38
- 4.2 实验材料及方法38-41
- 4.2.1 试剂耗材及仪器设备38-39
- 4.2.2 实验方法39-41
- 4.3 实验结果与讨论41-47
- 4.3.1 重编程中过表达 TET1CD 对细胞黏附及上皮分化的影响41-45
- 4.3.2 内源性 TET1 蛋白对 MET 过程的影响45-47
- 第5章 结论与讨论47-49
- 参考文献49-56
- 附表一 本研究中所用引物56
- 附表二 本研究中所用抗体56-58
- 攻读硕士学位期间的科研成果58-59
- 致谢59-60
【共引文献】
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本文编号:379830
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