用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位

发布时间：2017-06-26 12:01

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【摘要】：目的预测Rv1410c结核分枝杆菌(MTB)的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Editseq软件将Rv1410c MTB氨基酸序列进行编辑保存,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,预测Rv1410c MTB的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位,然后再用BLAST分析其与人类抗原表位的同源性。结果 Rv1410c具有丰富的二级结构,含有较多潜在的B细胞抗原肽表位,主要位于1~10、67~77、129~137、189~205、222~235、253~267、296~306、330~338、359~367、462~467、494~517氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高;也含有较多潜在的T细胞表位,主要位于16~37、84~102、108~115、137~160、202~207、219~222、245~263、321~325、355~362、387~391、417~445、486~494氨基酸残基或其附近。结论 Rv1410c MTB既含有较多潜在的B细胞抗原表位,也含有较多潜在的T细胞抗原表位。
【作者单位】： 河北北方学院;解放军第309医院全军结核病研究所全军结核病防治重点实验室;
【关键词】： 抗原表位 DNAStar软件 结核分枝杆菌 Rvc 二级结构
【基金】：国家重大传染病防治科技重大专项基金(2012ZX10003008002) 军队医学科技“十二五”重点项目(BWS11J050) 北京市科技创新基地培育与发展工程专项(Z141107004414021)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)是第二大致死性感染性疾病的病原体,以呼吸道感染为主要途径,一旦侵入宿主体内即很难被清除,并且由于缺乏准确、快速和具有效益的诊断依据,此病的防治仍然是我国需要解决的重大问题之一。1/3的世界人口有MTB的潜伏感染,5%~10%的

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 黎明;于天飞;;DNAStar软件在动物病毒研究中的应用实例[J];高师理科学刊;2010年03期

2 杨军;刘妮;张婷;赵世平;强磊;苏宝山;康安静;李宗芳;;HBeAg的B细胞线性表位预测及鉴定[J];南方医科大学学报;2013年02期

3 郑小莉;张艺;谢晓东;罗波;刘佳佳;;鼠Mincle蛋白B细胞抗原表位预测及多克隆抗体制备[J];免疫学杂志;2011年08期

4 唱凯;李贤龙;贾延辉;徐泽刚;李晋涛;;T细胞抗原表位预测的研究方法进展[J];生物学杂志;2009年01期

5 李海侠;毛旭虎;;蛋白质抗原表位研究进展[J];微生物学免疫学进展;2007年01期

6 杨霞;刘凯军;申子刚;何海洋;张记;张巧玉;吴玉章;李晋涛;;人Izumo蛋白的二级结构及B细胞抗原表位预测[J];中国免疫学杂志;2010年01期

7 张玉芝;伊正君;付玉荣;;MicroRNA与肺部感染的研究进展[J];细胞与分子免疫学杂志;2012年11期

8 徐前明;李国清;;噬菌体展示技术筛选人隐孢子虫P23抗原表位[J];中国人兽共患病学报;2013年01期

9 李瑞芳;管志玉;付玉荣;伊正君;;结核分枝杆菌与宿主作用相关蛋白研究进展[J];中国人兽共患病学报;2014年03期

10 王海霞;孙燕妮;王u&民;赵亭;平国玲;张力平;;结核分枝杆菌Rv0440 CTL表位肽的免疫原性研究[J];中国人兽共患病学报;2014年05期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 黄星;余为一;仲大莲;;NDV F48E9株与LaSota株HN结构蛋白潜在抗原表位的预测分析[J];安徽农学通报;2008年12期

2 李倩;姚淑霞;;非洲猪瘟病毒VP73蛋白的B细胞表位预测[J];安徽农业科学;2008年18期

3 杨东;刘红艳;张繁荣;余来宁;;尼罗罗非鱼DMRT蛋白B细胞表位的预测[J];安徽农业科学;2008年27期

4 李冰峰;李鑫;;Pla a 1的抗原表位分析[J];安徽农业科学;2009年08期

5 李燕芳;何颖;邹泽红;;应用生物信息学分析大米过敏原RAG1的B细胞表位[J];安徽农业科学;2012年06期

6 申丹;肖婧;孙琳;焦伟伟;苗青;申晨;徐放;吴喜蓉;申阿东;;Ag85B表位多肽对体外单核细胞增殖影响的研究[J];标记免疫分析与临床;2012年02期

7 刘丽娜;潘渠;朱军民;丛延广;刘红美;李程;;2-型猪链球菌保护性抗原RfeA的B细胞表位预测[J];成都医学院学报;2011年02期

8 杨清浩,王祥卫,金燕,张立新;MUC1抗原的表位预测及模拟位的筛选[J];重庆医学;2005年05期

9 吕燕波,万瑛,吴玉章;SARS病毒S蛋白的B细胞表位预测[J];第三军医大学学报;2004年02期

10 杨清浩,王祥卫,金燕,张立新;MUC1抗原的B细胞表位预测[J];第三军医大学学报;2005年05期

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 宋立峰;刘静静;刘月琴;张英杰;;早孕因子蛋白基因的克隆及生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会2014年全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2014年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 刘宾;大豆主要致敏原的免疫检测研究[D];中国农业科学院;2011年

2 杨利华;基于卵泡雌激素受体-FSHR多肽避孕疫苗的优化设计及其抗生育效应的实验研究[D];第三军医大学;2011年

3 常乐;蛋白质的折叠与结合机制研究[D];南京大学;2011年

4 李璀;靶向DPP4和PTP1B的Ⅱ型糖尿病药物设计研究[D];华东理工大学;2011年

5 刘文兴;布鲁氏菌标记疫苗（M5-90-26）的鉴别诊断及其bp26蛋白的免疫原性分析[D];南京农业大学;2011年

6 陶志勇;间日疟原虫特异性抗原的筛选[D];苏州大学;2011年

7 罗小虎;蛋白质—蛋白质骨架柔性对接研究[D];苏州大学;2011年

8 佟平;鸡蛋卵转铁蛋白线性表位定位及热加工对其结构与过敏原性的影响[D];南昌大学;2011年

9 魏化伟;基于抗原抗体立体结构的功能表位研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年

10 王祥卫;P-糖蛋白胞外段的融合表达及其结合肽的筛选研究[D];第三军医大学;2002年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 吕虹;结核杆菌抗原CFP21的CTL表位筛选与改造[D];郑州大学;2010年

2 王媚娘;抗CDK4人源单链抗体作用机制的研究[D];吉林大学;2011年

3 张念章;副猪嗜血杆菌hhdA基因缺失株的构建及胞外丝氨酸蛋白酶免疫原性的研究[D];中国农业科学院;2011年

4 齐佳;利用噬菌体展示技术筛选Cry2Ab毒素受体结合表位的研究[D];中国农业科学院;2011年

5 查智辉;三疣梭子蟹血卵涡鞭虫单克隆抗体研制及其初步应用[D];浙江海洋学院;2011年

6 周小东;β-苦瓜素的结构分析与表位预测[D];重庆医科大学;2011年

7 黄美容;LP-PLA2的原核表达、抗体制备及表位分析[D];重庆医科大学;2011年

8 王鹏;人Ⅰ型丙氨酸氨基转移酶原核表达、表位分析及其抗体制备[D];重庆医科大学;2011年

9 朱慧慧;细粒棘球蚴cDNA文库的构建及诊断靶抗原的筛选[D];中国疾病预防控制中心;2011年

10 王燕群;PCMV DPOL基因的克隆分析及基于此基因PCR检测方法的建立与初步应用[D];四川农业大学;2011年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 吴传勇;娄加陶;蒋廷旺;钱，

本文编号：486022