肠道病原菌gyrB基因系统发育分析

发布时间：2017-07-27 02:14

  本文关键词：肠道病原菌gyrB基因系统发育分析

  更多相关文章： 肠杆菌科 弧菌科 gyrB基因 系统发育分析

【摘要】：[目的]探讨gyrB基因区分鉴别肠道病原菌的能力,为临床快速鉴定病原菌提供依据。[方法]通过PCR扩增及测序方法,获得肠杆菌科和弧菌科的14种临床常见肠道病原菌gyrB基因序列,合并采集来自GenBank的标准菌株序列,采用距离法构建系统发育树。[结果]在系统发育树的拓扑结构中,除志贺氏菌、大肠杆菌、嗜水气单胞菌外,同一菌种的不同菌株均聚类形成具有较高的自举支持率单系类群。大肠杆菌演化支内混杂有志贺氏菌分支;嗜水气单胞菌的临床分离株与标准菌株相距较远,未能聚类成单系类群。另外,除乙型副伤寒沙门氏菌外,其余沙门氏菌gyrB序列在血清型水平呈现高度同源性,使得5种血清型各自聚类区分。[结论]采用gyrB基因作为肠道病原菌系统发育分析靶基因是合适的,其可以在菌种水平区分包含肠杆菌与弧菌科的肠道病原菌。
【作者单位】： 浙江中医药大学分析测试中心;
【关键词】： 肠杆菌科 弧菌科 gyrB基因 系统发育分析
【基金】：国家自然科学基金项目(81102580) 浙江省教育厅科研项目(Y200805821,Y201017092)~~
【分类号】：R378
【正文快照】： gyr B基因,一种蛋白质编码基因,编码DNA促旋酶(DNA gyrase)B亚单位[1]。该分子与DNA复制及超螺旋结构的维持密切相关。近年来,在细菌分型鉴别研究中,蛋白质编码基因构建系统发育树的优点逐渐显现[2-3]。主要是因为该类基因在保持其编码的氨基酸序列相对保守的同时,依据遗传密

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 毛欣茹;尹小毛;郑磊;王前;;建立基于gyrB基因检测结核分枝杆菌复合物的荧光定量PCR法[J];临床检验杂志;2013年12期

2 侯晓丽,陈智;分类及鉴别细菌的新靶标——gyrB基因[J];国外医学.流行病学传染病学分册;2005年01期

3 张诗蒙;尹小毛;刘非;郑磊;王前;;基于gyrB序列Taqman实时荧光PCR检测在MTC鉴定中的应用[J];实用医学杂志;2014年03期

4 ;[J];;年期

中国硕士学位论文全文数据库 前1条

1 梁倩华;8株微囊藻gyrB和rpoC1基因序列分析及其系统发育研究[D];暨南大学;2006年

，

本文编号：579388