基于核糖体RNA ITS1-5.8S-ITS2基因序列的十二指肠钩虫分子系统发育分析

发布时间：2017-08-01 07:51

  本文关键词：基于核糖体RNA ITS1-5.8S-ITS2基因序列的十二指肠钩虫分子系统发育分析

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【摘要】：目的通过克隆十二指肠钩虫的ITS1-5.8S-ITS2,初步分析钩口属的系统发育,构建基于ITS1、ITS2的圆线目线虫的系统进化树,为进一步研究其遗传进化关系奠定基础。方法从厦门海沧东孚镇收集标本,分离,形态鉴定为十二指肠钩虫,分别克隆了供试钩虫的ITS1-5.8S-ITS2序列,经NCBI网站的BLAST比对以及基于ITS1和ITS2序列的钩口属的系统发育分析。结果供试钩虫的ITS1、5.8S和ITS2序列,它们的长度分别为366bp、153bp和221bp,登陆http://www.ncbi.nlm.nih.gov进行BLAST,在数据库中没有与之相匹配的序列,将获得的序列作为新的序列上传至GenBank中进行注册,各序列的GenBank登录号分别为:5.8SrRNA基因:EU344796、ITS1-5.8S-ITS2:EU344797。结论从系统进化树中,本实验的供试十二指肠钩虫均与GenBank中已公布的十二指肠钩口线虫自然聚类在一起。
【作者单位】： 厦门市疾病预防控制中心;厦门市海沧区疾病预防控制中心;
【关键词】： 十二指肠钩虫 ITS-.S-ITS基因 系统发育分析
【基金】：厦门市医学中心/重点专科建设项目基金(厦卫科教中医[2012]285号)~~
【分类号】：R383.13
【正文快照】： 厦门市医学中心/重点专科建设项目基金(厦卫科教中医[2012]285号)真核生物细胞核的核糖体RNA基因簇在不同的真核生物中存在于不同的染色体上[1],真核生物细胞核的核糖体RNA基因簇中的串联重复序列,在进化上表现出相当的一致性,并且在种内的独特性序列的同质性相对较高,但其它

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本文编号：603153