基于图元向量的差异共表达分析研究

发布时间：2017-08-02 21:27

  本文关键词：基于图元向量的差异共表达分析研究

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【摘要】：差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点.Przulj提出的图元及图元向量作为一描述网络局部结构信息的方法,已经在网络分析方法面取得了很多重要的结果.本文在图元向量的基础上提出了二种节点变化的差距度量方法,通过聚类可以分别挖掘网络中模块内变化基因簇和模块间变化基因簇.应用AGEMAP数据库中12个小鼠组织基因表达数据的结果表明:大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的CO条目.
【作者单位】： 温州大学物理与电子信息工程学院;
【关键词】： 图元向量 差异网络 小鼠衰老
【基金】：国家自然科学基金(No.61572367,No.61272018) 浙江省自然科学基金(No.R1110261) 浙江省新苗人才计划(No.2012R424051)
【分类号】：TP311.13;R339.38
【正文快照】： j 差异分析确定小鼠受辐射影响的基因簇[5],Oldham等比对人类和黑猩猩差异网络的拓扑重叠,挖掘出与进化系统生物学的研究表明·■生命体的生长、发育、衰老有关的基因集合[6],Zhang提出差异相关子网络(DDN),过程以及疾病的发生与基因之间相互作用的变化密切检测两个差异转录网

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 覃桂敏;高琳;周晓锋;;非树型网络模体发现算法[J];电子学报;2009年11期

2 赵建邦;董安国;高琳;;一种用于生物网络数据的频繁模式挖掘算法[J];电子学报;2010年08期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前5条

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2 尹建芹;田国会;魏军;李金屏;林佳本;;特征的支持度与其分类能力的关系研究[J];电子学报;2015年02期

3 田旷;杜宁林;;基于多尺度骨干网的网络比较算法——面向药物配伍分析[J];电子科学技术;2015年02期

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中国博士学位论文全文数据库 前4条

1 赵建邦;基于代谢网络的功能模式发现及系统发生分析研究[D];西安电子科技大学;2011年

2 郭杏莉;基于网络模型的基因相关预测问题算法研究[D];西安电子科技大学;2013年

3 陈t，

本文编号：611292