淋球菌por,tbpB基因序列变异和系统进化探讨

发布时间：2017-08-13 15:22

  本文关键词：淋球菌por,tbpB基因序列变异和系统进化探讨

  更多相关文章： 淋球菌 por基因 tbpB基因 系统进化

【摘要】：目的分析遵义地区淋球菌por,tbp B基因序列变异及系统进化关系。方法对淋球菌por,tbp B基因进行测序鉴定,利用NG-MAST分型法对por,tbp B基因进行比对编号。用MEGA5.22软件中的邻接法构建系统发育树,并以Kimura 2-parameter模型计算序列间的遗传距离;Felsenstein法计算同义替换率(dS)和非同义替换率(dN)。以RDP3软件对por,tbp B基因中的基因重组事件进行分析。结果 65株淋球菌共鉴定出19种por基因型和22种tbp B基因型。19种por基因型被划分为2个进化簇群,基因间平均遗传距离0.09。22种tbp B基因型被划分为3个进化簇群,基因间平均遗传距离0.13。por,tbp B基因的dNdS。在tbp B基因中检测出8个基因重组事件,而por基因仅有1个。结论本地区淋球菌por基因与tbp B基因的进化速度与方式存在一定差异,其中tbp B基因主要以基因重组的方式参与进化,por基因则可能以突变或缺失的方式参与进化。纯选择作用是维持本地区por,tbp B基因多态性的重要机制。
【作者单位】： 遵义医学院附属医院输血科;遵义医学院附属医院医学检验科;遵义医学院附属医院核医学科;
【关键词】： 淋球菌 por基因 tbpB基因 系统进化
【基金】：国家自然科学基金(NO.81460317) 贵州省科技厅资助项目(黔科合J字LKZ[2012]20号) 遵义市科技局与遵义医学院附属医院联合基金[遵市科合社字(2014)72号]
【分类号】：R378.16
【正文快照】： 表2淋球菌por与tbp B优势等位基因组合情况Tab.2 Combinations of por and tbp B dominant alleles in Neisseria gonorrhoeaepor alleles(n)tbp B alleles(n)1135(22)1132(16)90(5)1053(4)1135(10),1132(4)1132(7),1053(1),1973(1),1793(1)1053(3),1135(1),90(1),581(1),5274

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 毓芩;;印度发现新基因突变[J];国外医学情报;1998年10期

2 Peter D.Issitt,Marilyn J.Telen,刘敬闪,石翠英;D,弱D(D~u)及部分D:分子水平的研究[J];国外医学.输血及血液学分册;1999年06期

3 李俊;;基因突变挽救了欧洲人[J];科学大观园;2007年12期

4 秋水;;一种基因多种疾病[J];百科知识;2012年13期

5 张振东;高基因突变可使人长寿[J];社区;2003年21期

6 董治亚,高雁翎,金烨,王德芬;基因联锁分析早期诊断家族性高胆固醇血症[J];实用儿科临床杂志;2000年01期

7 陈盛强,左斌生,邓维意,方敏华,燕启江;广东汉族人甲基四氢叶酸还原酶基因的多态性[J];中国优生与遗传杂志;2002年04期

8 庞庆丰,郦明芳,胡维诚,陈琪,李晓宇,范乐明;低密度脂蛋白受体功能与基因突变的关系[J];南京医科大学学报(自然科学版);2003年03期

9 ;揭秘10大衰老原因:慢性炎症、基因突变等[J];广州医学院学报;2008年02期

10 耿解萍，戚正武, 陈竺;因子Ⅷ基因突变的研究进展[J];生物化学与生物物理进展;1994年01期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 吴雪琼;张俊仙;李洪敏;梁建琴;钟敏;王巍;;结核分支杆菌耐药基因的研究[A];中国防痨协会全国学术会议大会学术报告[C];2001年

2 李春义;李妍;毛金媛;赵彦艳;;hWNK基因启动子区域顺式作用元件鉴定[A];遗传学进步与人口健康高峰论坛论文集[C];2007年

3 高美华;李冰;李武修;王静;王秋波;;突变的人CD59基因表达蛋白的功能研究[A];山东免疫学会、山东微生物学会医学微生物学专业委员会、山东省医学会微生物学和免疫学专业委员会、山东省医药生物技术学会2001年学术年会论文汇编[C];2001年

4 贾天军;侯丽娟;孙黎;罗强;赵铁军;李润华;石万元;张进顺;;老年人MBL基因ExonⅠ点突变频率及其血浆含量变化研究[A];河北省免疫学会第5次会员代表暨学术大会论文摘要集[C];2006年

5 黄海蓉;马s，

本文编号：667976