一株新的沙门菌烈性噬菌体IME-SAL1的分离、全基因组测序和比较基因组分析
本文关键词:一株新的沙门菌烈性噬菌体IME-SAL1的分离、全基因组测序和比较基因组分析
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【摘要】:目的:分离鉴定一株沙门菌的烈性噬菌体,观察其形态大小,完成全基因组测序,分析其基因组结构和进化关系,为治疗沙门菌感染提供新的策略和实验依据。方法:以沙门菌SAL95作为指示菌从医院废水中分离噬菌体,分离到的噬菌体经浓缩和纯化后采用透射电镜观察其形态大小,提取噬菌体的基因核酸并完成全基因组高通量测序,分析其全基因组的结构特征,通过比较基因组分析研究其进化关系。结果:从解放军307医院未经消毒处理的废水中分离到一株烈性沙门菌噬菌体。电镜观察显示,该噬菌体头部呈立体对称,有一不收缩的长尾。其基因组全长113 183 bp,比较基因组分析确定该噬菌体为一株新的沙门菌噬菌体,命名为IME-SAL1。结论:从医院废水中分离到一株烈性沙门菌噬菌体IME-SAL1,研究了该噬菌体的分类、基因组结构、进化关系,可为其实际应用提供参考。
【作者单位】: 中南大学基础医学院;军事医学科学院微生物流行病研究所;
【关键词】: 沙门菌 烈性噬菌体 全基因组测序 比较基因组分析
【基金】:国家科技重大专项(2011ZX10004001;2013ZX10004607-004;2013ZX10004217-002-003) 国家高技术研究发展计划(2012AA022003,2014AA021402)
【分类号】:R378.22;Q78
【正文快照】: 沙门菌归类于肠杆菌科沙门菌属,在自然界分布极为广泛,几乎能从所有脊椎动物及昆虫体内分离到[1]。绝大多数沙门菌对人有致病性,引起发热、肠胃炎、腹泻和败血症等[2]。沙门菌主要传播途径为消化道,是世界上引起食物中毒最多的病原菌[3]。从20世纪70年代第一次报道多重耐药(MD
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,本文编号:724334
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