结核分枝杆菌FadD3结构与功能的生物信息学分析

发布时间：2017-10-07 23:17

  本文关键词：结核分枝杆菌FadD3结构与功能的生物信息学分析

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【摘要】：目的应用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶(FadD3)氨基酸序列的结构与功能。方法应用生物信息学在线工具NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、Expasy(http://ca.expasy.org/)、SWISSMODEL(http://swissmodel.expasy.org/)、客户端软件clustalx等进行多重序列比较、同源性分析、同源模建及蛋白功能活性位点分析;应用ProtParam软件(http://web.expasy.org/protparam)预测FadD3基因编码FadD3的蛋白理化性质;采用最小值进化法(the Minimum Evolution method)构建分子进化树。结果 FadD3(Mt-FACS)与其他物种的脂酰辅酶A合成酶(FACS)含相同的保守序列及催化活性位点,第174-185氨基酸残基是AMP结合部位,也是FadD3的保守区域;第422-497氨基酸残基是FACS与底物(脂酸)结合的部位,亦是结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶的C末端。分子进化分析表明结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶(Mt-FACS)与睾丸酮丛毛单胞菌脂酰辅酶A合成酶(CtFACS)的进化关系较近,与黑腹果蝇脂酰辅酶A合成酶(Dm-FACS)的进化关系较远。结论生物信息学预测提示FadD3是结核分枝杆菌脂类代谢及耐药性研究的潜在靶蛋白。
【作者单位】： 昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系;昆明医科大学现代教育技术中心;昆明医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学系;
【关键词】： 结核分枝杆菌 脂酰辅酶A合成酶 结构 功能 生物信息学
【分类号】：R378.911
【正文快照】： *?结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是引起结核病(tuberculosis)的病原菌。目前全世界约有1/3的人受到结核分枝杆菌的感染,每年约有800万新病例发生,至少有200万人死于该病。近年来,由于多耐药性结核分枝杆菌菌株的出现和HIV的协同作用,使得结核病卷土重来,成为世界

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 袁方;陈元晓;Stephanie Dawes;Edward N.Baker;;结核分枝杆菌H37Ra FadD3基因克隆与表达研究[J];云南大学学报(自然科学版);2014年04期

【共引文献】

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1 张婷;杨焕;周维;张庆超;周卫红;;结核杆菌中细胞色素P450蛋白的结构与功能研究进展[J];生物物理学报;2013年08期

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3 袁方;陈元晓;Stephanie Dawes;Edward N.Baker;;结核分枝杆菌H37Ra FadD3基因克隆与表达研究[J];云南大学学报(自然科学版);2014年04期

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本文编号：990642