云南地区冠心病患者的肠道菌群特征分析
发布时间:2020-04-30 14:53
【摘要】:目的:人类皮肤和粘膜表面和肠道分布的无数微生物,由细菌、古细菌,病毒,真菌,和其他原生动物组成,统称为微生物群。人类的肠道,大约有1000种微生物定居。细菌倾向于相互关联和互惠共生或寄生的方式。在所有的工业化国家,心血管疾病发病率和死亡率持续居高不下。中国近年来呈明显上升趋势,每年新发至少50万,现患至少200万,许多患者正经历着持续发病,最终发展为心力衰竭,甚至死亡。国内外研究已经证实肠道菌群代谢物磷脂酰胆碱可以促进心血管疾病,同时,磷脂酰胆碱衍生物三甲胺(TMA)可导致动脉粥样硬化,并促进心血管疾病的发生。对冠心病患者肠道菌群多样性、结构、丰度的研究,可明确冠心病患者肠道菌群是否发生了改变。设想以研究所得冠心病患者肠道菌群丰度、分布作为对照,与入院病人肠道菌群对比,相似性较高者,可提示其患冠心病风险较高,可为下一步以肠道微生物作为生物标记物,并且为进一步治疗提供理论依据,对临床应用提供参考。方法:根据2016年WHO的诊断标准纳入云南地区67名急性心肌梗死患者、91名冠心病不稳定型心绞痛患者、47名冠心病稳定型心绞痛患者、37名冠脉粥样硬化患者、64名冠脉无异常者,提取粪便DNA,采用菌属16sr RNA v3、v4序列特异性引物,进行实时荧光定量PCR,进行Illumina测序,对五组各目标的菌属多样性、结构、丰度进行对比。结果:肠道菌群比较1、五组人群细菌分类的比较五组的有效序列数没有显著差异。五组分别在门、纲、目、科、属物种分类上没有显著差异。2、五组人群各自菌属所占总细菌的比例厚壁菌门在五组中阅读丰度最高,拟杆菌门阅读丰度第二高。与对照组(D组)相比,急性心梗患者(A组)的梭杆菌增多。冠心病不稳定心绞痛患者(B组)的拟杆菌减少,变形杆菌、放线菌增多。冠心病稳定心绞痛患者(C组)的拟杆菌减少,变形杆菌、梭杆菌增多。冠脉粥样硬化患者(E组)变形杆菌增多。结论:急性心肌梗死组、冠心病不稳定型心绞痛组、冠心病稳定型心绞痛组、冠脉粥样硬化组与对照组肠道菌群的多样性、结构以及丰度不同。急性心肌梗死患者、冠心病不稳定型心绞痛患者、冠心病稳定型心绞痛患者、冠状动脉粥样硬化患者肠道中存在不同程度的菌群失调。
【图文】:
6 PCR 产物定量和均一化文库质检合格后,使用 Qubit 进行文库定量,并根据每个样品的数据量要,,进行相应比例的混合。7 Illumina 测序使用 Illumina HiSeq PE250 进行上机测序。
生物分析流程图
【学位授予单位】:云南中医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R541.4
本文编号:2645888
【图文】:
6 PCR 产物定量和均一化文库质检合格后,使用 Qubit 进行文库定量,并根据每个样品的数据量要,,进行相应比例的混合。7 Illumina 测序使用 Illumina HiSeq PE250 进行上机测序。
生物分析流程图
【学位授予单位】:云南中医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R541.4
【参考文献】
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1 黄旭东;郑晓鹏;郑赵利;;2型糖尿病患者肠道菌群的研究[J];河北医学;2011年08期
本文编号:2645888
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