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血管内皮损伤相关circRNA与原发性高血压的关联性研究

发布时间:2020-06-10 13:46
【摘要】:目的:1.探讨原发性高血压与血管内皮损伤相关的环状RNA(包括circ_0014243、circ_0126991和circ_0041000)之间的关联。2.研究circRNA和性别、吸烟、饮酒等因素之间的关系以及与对应miRNA之间的关系。3.探讨circRNA的相对表达量(以?Ct表示)对原发性高血压的诊断价值,同时探讨circRNA-miRNA对提高原发性高血压诊断正确性的意义。方法:1.根据频数匹配的病例对照研究的设计原则,共选取196名宁波市汉族居民,其中原发性高血压病例98人,正常对照98人。通过统一的调查问卷、体格检查和实验室检查收集研究对象的基线数据。2.提取研究对象血液样品的总RNA,反转录成稳定的cDNA,通过实时荧光定量PCR技术检测研究对象血样中目标circRNA(circ_014243、circ_0126991和circ_0041000)及miRNA(miR-10a-5p和miR-497-5p)的表达水平。3.采用单因素的分析方法比较两组间影响因素和目标circRNA和miRNA的相对表达量的差异,运用非条件logistic回归校正混杂因素,利用受试者工作特征曲线下面积评价circRNA以及circRNA-miRNA联合诊断原发性高血压的临床价值。结果:1.目标circRNA在病例和对照组间的相对表达量分析:(1)circ_0014243:circ_0014243在病例组中的表达水平增高(?Ct值降低)(病例VS.对照:13.86±3.04 VS.15.27±2.06,OR(95%CI)=0.459(0.317-0.665),adjusted P0.0001)。(2)circ_0126991:circ_0126991在病例组中的表达水平增高(?Ct值降低)(病例VS.对照:12.28±2.16 VS.13.36±1.49,OR(95%CI)=0.413(0.279-0.611),adjusted P0.0001)。(3)circ_0041000:circ_0014243在两组间表达水平并无差异(病例VS.对照:12.72±2.26 VS.12.42±1.78,OR(95%CI)=1.058(0.819,1.366),adjusted P=0.6685)。2.目标circRNA分层分析:(1)circ_0014243:以年龄、性别、吸烟、饮酒、BMI、miR-10a-5P等因素作为分层变量,相对于对照组,circ_0014243在以下分层中呈现病例组中高表达(低?Ct值),病例VS对照:≥60岁(13.65±3.36 VS.15.09±1.59,adjusted P0.0001)、男性(13.98±2.79VS.15.68±1.81,adjusted P=0.0001)、不吸烟人群(13.51±3.63 VS.15.10±2.10,adjusted P=0.0022)、饮酒人群(14.41±1.65 VS.15.69±2.25,adjusted P=0.0158)、不饮酒人群(13.52±3.60 VS.15.14±2.00,adjusted P=0.0005)、BMI≤25人群(14.19±1.34 VS.15.02±2.09,adjusted P=0.0033)、miR-10a-5p?Ct3.2的人群(14.19±2.66 VS.15.50±1.79,adjusted P=0.0051)。(2)circ_0126991:以年龄、性别、吸烟、饮酒、BMI、miR-10a-5P等因素作为分层变量,相比于对照组,circ_0126991在以下分层中呈现病例组中高表达(低?Ct值),病例VS对照:≥60岁(12.27±2.19 VS.13.52±1.43,adjusted P=0.0006)、男性(12.72±1.96 VS.13.71±1.30,adjusted P=0.0087)、女性(11.66±2.28 VS.12.85±1.61,adjusted P=0.0008)、不吸烟人群(11.94±2.14 VS.13.25±1.57,adjusted P=0.0002)、不饮酒人群(12.09±2.02 VS.13.32±1.57,adjusted P=0.0003)、BMI≤25人群(12.30±2.34 VS.13.34±1.60,adjusted P=0.0120)、miR-10a-5p?Ct≤3.2的人群(12.00±2.73 VS.13.16±1.65,adjusted P=0.0297)、miR-10a-5p?Ct3.2的人群(12.42±1.80 VS.13.67±1.12,adjusted P=0.0249)。(3)circ_0041000:相比于对照组,circ_0041000在女性和不吸烟人群中,病例组均低表达(高?Ct值),病例VS对照分别为女性(12.61±2.24 VS.11.90±2.05,adjusted P=0.0037)、不吸烟人群(12.63±2.11 VS.12.26±1.71,adjusted P=0.0353)。3.受试者工作特征曲线分析:(1)circ_0014243的相对表达量在原发性高血压中具有一定的诊断价值,其ROC曲线下面积AUC(95%CI):0.675(0.599-0.750),它的灵敏度和特异度分别为0.714和0.612。(2)circ_0126991的相对表达量在原发性高血压中具有一定的诊断价值,其ROC曲线下面积AUC(95%CI):0.699(0.624-0.774),灵敏度和特异度分别为0.724和0.673。(3)miR-10a-5p的相对表达量在原发性高血压中具有一定的诊断价值,其ROC曲线下面积AUC(95%CI):0.684(0.609-0.759),它的灵敏度和特异度分别为0.786和0.551。(4)circRNA及其对应的miRNA联合作用具有一定的诊断价值,circ_0014243和miR-10a-5p的合并ROC曲线下面积AUC(95%CI)提升至0.737(0.667-0.807),circ_0126991和miR-10a-5p的合并ROC曲线下面积AUC(95%CI)提升至0.766(0.699-0.832)。结论:1.血管内皮损伤相关的circ_0014243和circ_0126991在人体内低表达是原发性高血压发病的保护因素。同时与circ_0014243和circ_0126991相互作用的miR-10a-5p在人体内低表达是原发性高血压发病的危险因素。2.从亚组的logistic回归分析来看,circRNA在不同的亚组分层下,其对疾病的效应会随之改变,与所有研究对象的效应相比,在60周岁以上的人群中,circ_0014243和circ_0126991二者低表达的保护效应更强,提示随着年龄的增长,circRNA表达谱的变化与疾病发生发展之间的关系更加紧密;与此同时,在miR-10a-5p?Ct值≤3.2时,circ_0126991低表达的保护效应也得到增强,提示随着miR-10a-5p表达水平的增加能够促进circ_0126991低表达的保护作用。3.circ_0014243和circ_0126991在原发性高血压中具有一定的诊断价值,同时联合与之对应的miRNA能够提高它们的诊断价值,具有重要的临床意义。
【图文】:

查询界面,关键词,剪接体


RNA 的序列数据可以通过circBase,CircNet 和CircInteractome 数据库获取,,而miRNA的相关序列也可以通过 miRbase,miRDB,miRanda等数据库获取,下面介绍下如何通过circBase(http://circrna.org/)以及 miRbase(http://www.mirbase.org/) 分别得到目标circRNA和 miRNA的序列数据:(1) circBase获取目标 circRNA的序列首先进入 circBase 数据库(http://circrna.org/)的首页,以 hsa_circ_0126991 为例,在检索框中输入hsa_circ_0126991 后,点击“Search”,网站将自动检索数据库中相对应的结果,结果中我们可以看到目标circRNA 的基本信息,包括来源基因组的信息,剪接体的信息以及现阶段研究的相关注释。随后我们从结果界面中点击“fasta”进入 circRNA序列下载界面,其中circBase 提供两种 circRNA的下载模式,一种是circRNA 的相对应的来源基因组序列,模式名为“genomic”;另一种是成熟的 circRNA剪接体的序列,模式名为“spliced”,此处我们选择成熟circRNA 剪接体模式,默认其他参数,点击“Search”即可下载。

序列,序列,目标,血管内皮损伤


血管内皮损伤相关circRNA与原发性高血压的关联性研究 miRbase获取目标miRNA 的序列首先输入 miRbase的网址(http://www.mirbase.org/)进入其主页。在主会显示目前 miRbase共收录了 miRNA 的数量,截止目前为止已更新至条,在检索框中我们输入我们的目标 miRNA(以 miR-10a-5p 为例),“Go”,数据库将检索现存数据库中所有物种的miR-10a-5p 的结果,下带有“Hsa”的目标 RNA即为人类中的成熟 miRNA 序列。
【学位授予单位】:宁波大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R544.11

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本文编号:2706374

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