云南傣族原发性高血压易感基因的初步研究

发布时间：2017-07-18 09:09

  本文关键词：云南傣族原发性高血压易感基因的初步研究

  更多相关文章： 高血压 易感基因 傣族 上位效应 焦磷酸测序

【摘要】：原发性高血压是一种严重危害人类健康的心血管系统疾病。近35年来高血压在云南傣族中的患病率显著上升,探索云南傣族中原发性高血压的易感基因以及等位基因之间的相互作用,有助于揭示傣族原发性高血压的发病机制、进一步阐明环境选择因素、遗传因素和疾病三者的相互作用和关系。由于原发性高血压高度的遗传异质性,原发性高血压的关联基因在不同群体中会有所不同。其他人群中已报道的候选基因在傣族群体中与高血压的关系还不清楚。对这些基因进行研究有助于我们找出傣族原发性高血压的相关致病基因,揭示发病机制。钠离子作为重要的环境因素与高血压的发生发展密切相关。根据对傣族饮食习惯的了解,对傣族的钠离子敏感候选基因进行研究,是探索傣族近35年来高血压患病率明显增高的分子机制的切入点。原发性高血压是多基因遗传疾病,其遗传机制依赖于多个微效基因的共同作用,基因间存在的上位效应将对高血压发病产生影响,但目前此类研究还较少。分析两个候选基因的上位效应可以为高血压易感基因研究提供更多的线索。根据高血压调节的生物学过程,本研究选择肾素-血管紧张素-醛固酮系统中的基因及与该代谢途径相关的基因进行关联分析及基因位点的上位效应分析。本研究首先对运用DNA池焦磷酸测序法初步筛选候选位点进行方法学研究,然后基于DNA池焦磷酸测序法初步筛选的候选位点,选取云南傣族425例正常对照样本及412例原发性高血压患者样本,采用SNaPshot单碱基延伸测序法、Taqman探针法、PCR-长度多态法和基因测序这几种基因分型方法对ADD1、ACE和CYP11B2三个基因的7个热点多态性位点(ADD1_rs4963、ADD1_rs4961、 ADD1_rs12503220、ACE_rs4291、ACE_rs4343、ACE_I/D、CYP11B2_rs1799998)进行逐一个体基因分型,再进一步研究ACE和ADD1这两个候选基因与高血压的关系及多态性位点之间可能存在的上位效应作用。利用已知频率位点建立优化DNA池焦磷酸测序法并进行高通量基因分型,对所得结果进行统计分析和关联分析,结果显示,DNA池焦磷酸测序法可初步测定群体中高频率及非复杂性的SNPs等位基因频率,与SNaPshot法逐一分型所得频率误差在0.9%-2.3%之间,DNA池焦磷酸测序法对等位基因频率估计较为准确。在傣族群体中,我们所选择的7个高血压候选位点经过χ2检验并进行Bonferroni统计学校正后,没有发现傣族高血压关联位点。进行上位效应分析结果显示,单个位点多态性与高血压相关性不明显,但将功能相关基因进行上位效应分析后,与高血压相关性显著增强。ACE基因缺失(D)与ADD1基因的G等位基因联合出现时,高血压患病风险显著增加(p=0.0014,OR=1.567,95%CI:1.189-2.067);ACE基因缺失(D)与CYP11B2基因的T等位基因联合出现时,高血压风险显著增加(p=1.58E-08,OR=2.320,95%CI:1.728-3.116)。即在显性-显性模式下ACE-D/ADD1-G和ACE-D/CYP11B2-T上位效应均为傣族原发性高血压风险因素。Logist回归分析的研究结果显示年龄、BMI、总胆固醇、饮酒等因素也与高血压发病相关联。排除这些影响因素作用后,本研究中的上位效应仍与高血压关联显著。综上,本研究首先进行了方法学方面的研究,结果显示,DNA池焦磷酸测序法适用于中频和高频的非复杂性SNPs关联分析,运用该方法筛选候选基因,可快速得到混合样本等位基因频率；本研究的7个候选位点：ADD1_rs4963、ADD1_rs4961、 ADD1_rs12503220、ACE_rs4291、ACE_rs4343、ACE_I/D、CYP11B2_rs1799998与傣族原发性高血压没有显著关联性,但ACE-D与ADD1-G及ACE-D与CYP11B2-T间存在上位效应,并且二者的上位效应均与傣族原发性高血压有显著关联性；另外,环境因素如BMI,总胆固醇,饮酒等也与傣族原发性高血压有显著关联性。本研究显示,高血压关联基因有群体差异,不同人群地区高血压发病机制有所不同。在易感基因研究时,由于微效基因的特性,对基因上位分析是一个较好的高血压分析策略。对更多的傣族原发性高血压易感基因进行研究以及综合考虑饮食等环境因素与遗传相互作用将为其发病机制研究提供更多线索。
【关键词】：高血压 易感基因 傣族 上位效应 焦磷酸测序
【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R544.11
【目录】：

• 摘要4-6
• 英文摘要6-8
• 前言8-11
• 一. 实验材料11-15
• 1. 实验对象11-12
• 2. 主要试剂及耗材12-14
• 3. 主要仪器设备14-15
• 二. 研究方法15-27
• 1. 外周血的DNA的提取与定量15-16
• 2. DNA池焦磷酸测序(DNA pooling-PSQ)16-18
• 3. 候选SNPs等位基因频率检测18-26
• 4. 上位效应分析26
• 5. 数据分析26-27
• 三、研究结果27-43
• 1. DNA pooling-PSQ与逐一分型频率比较27-29
• 2. 利用DNA池焦磷酸测序法筛选傣族原发性高血压候选基因29-31
• 3. 候选SNPs真实等位基因频率检测31-39
• 4. 上位效应39-43
• 四、讨论43-50
• 1. 候选基因筛选的策略43-45
• 2. 候选基因ACE、ADD1的关联分析45-47
• 3.上位效应分析47-50
• 五、本文总结与展望50-51
• 小结50
• 展望50-51
• 参考文献51-56
• 附录 缩略语表56-57
• 致谢57-58
• 研究生简历58-59

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 刘英;;醛固酮在心血管疾病中的作用[J];河北医药;2007年07期

2 牛文全;王建炳;李素洁;周文郁;赵景波;邱长春;;北方汉族人群醛固酮合成酶基因多态性与高血压的关系[J];中国医学科学院学报;2007年03期

3 孙浩;杨昭庆;刘舒媛;于亮;林克勤;黄铠;褚嘉yP;黄小琴;;中国傣族及蒙古族群体中3个GWAS阳性转录因子基因与高血压的相关性的验证研究[J];中国优生与遗传杂志;2014年03期

，

本文编号：556962