冠心病候选基因的分子遗传学研究

发布时间：2017-07-18 21:10

  本文关键词：冠心病候选基因的分子遗传学研究

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【摘要】：目的:冠心病(coronary heart disease,CHD)已成为危害人类健康的众多元凶之一。本研究主要通过对CHD易感基因进行单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)荟萃分析以及基因分型检测来寻找降低冠心病易感性的生物标志物。材料与方法:荟萃分析是将前人的研究整合在一起以减少个体性研究存在的不确定性的一种分析方法。我们的荟萃分析系统地检索了包括万方、中国知网和PubMed等国内外生物医学数据库。运用Revman 5.0和Stata 11.0软件对APOA5rs662799,GPX1 rs1050450和ALOX15 rs34210653三个位点进行荟萃分析;收集宁波汉族人群CHD患者病例组及对照组外周血样本共1530例,采用MassARRAY分型技术对43个CHD候选基因位点进行SNP分型检测。结果:通过荟萃分析发现GPX1 rs1050450-C(OR=1.61,P=0.0002),ALOX15rs34210653-C(OR=1.42,P=0.02)和APOA5 rs662799-G(OR=1.36,P0.0001)均能够增加36%以上的CHD患病风险。病例对照研究发现在宁波汉族人群中APOE rs7259620-G(P=0.025,OR=1.20)可以使得患CHD的风险增加20%,尤其在男性中该位点的突变能增加26%的患病风险(P=0.023,OR=1.26)。APOA5 rs662799位点的突变在病例组与对照组之间存在显著的统计学差异(P=0.002,OR=1.28),并且在男性中发现rs662799的突变使CHD患病风险增加到33%(P=0.005,OR=1.33)。PPAP2B rs72664392位点在女性中与CHD显著相关(P=0.007)。PLA2G7 rs9395208-G能够减少19%的患病风险(P=0.040,OR=0.81)。CD40 rs1800686-G能够增加20%的CHD患病风险(P=0.020,OR=1.20),在女性中呈现出更高的患病风险(P=0.022,OR=1.35)。FAM5C rs12732361-G在男性中能够增加27%的患病风险(P=0.031,OR=1.27)。CD36 rs2065666-G在男性中能够降低19%的患病风险(P=0.046,OR=0.81)。F7 rs510317在男性中与CHD患病相关联(P=0.027)。结论:1.通过荟萃分析我们发现GPX1 rs1050450,ALOX15 rs34210653和APOA5rs662799三个位点均与CHD存在显著相关性(发表在Gene,2013,531(1):71-77;IF=2.2)。2.通过病例对照研究我们发现APOE rs7259620,APOA5 rs662799,PLA2G7 rs9395208,CD40 rs1800686,CD36 rs2065666,PPAP2B rs72664392,FAM5C rs12732361和F7 rs510317八个位点与CHD发病风险均存在关联性(已被BiomedicinePharmacotherapy接收)。3.APOE rs7259620-G,APOA5 rs662799-G和CD40 rs1800686-G可能是CHD的风险性因素,而PLA2G7 rs9395208-G可能是CHD的保护性因素。4.CD40 rs1800686-G在女性中可以增加CHD的患病风险。5.APOE rs7259620-G,APOA5 rs662799-G和FAM5C rs12732361-G的突变在男性中表现为CHD患病风险因素,而CD36 rs2065666的突变在男性中表现为CHD患病保护因素。6.CETP rs4783961,APOA5 rs10750097,MLXIPL rs35493868,ADIPOR1 rs7523903,PCSK9 rs2479409,SCARB1 rs59358115,PRKAG1 rs2293446,PON3 rs11770903,LEP rs13228377,ANGPTL4 rs4076317,LEPR rs6656451,ANGPTL3 rs11207997,PON2rs12704976,VLDLR rs7852409,ADIPOQ rs266729,SELP rs3917655,SAA1 rs1829575,CRP rs3093059,SELL rs2205849,TGFB1 rs2317130,IL12RB2 rs12142823,IL1B rs16944,CARD8 rs7248320,TLR2 rs7682814,CXCL12 rs11239027,IL1R2 rs2071008,ACE rs4316,AGTR1 rs275653,CST3 rs3827143,VEGFA rs1005230,THBS4 rs17878919,P2RY12 rs1491974,CYP2C19 rs12773342,ITGA2 rs26680和FGB rs222738935个位点的多态性与CHD不存在相关性。
【关键词】：冠心病 单核苷酸多态性 荟萃分析
【学位授予单位】：宁波大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R541.4
【目录】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 引言10-12
• 第一部分：易感基因多态性与 CHD 患病风险相关性的荟萃分析12-26
• 1 荟萃分析的目的12
• 2 材料与方法12-14
• 2.1 检索文献12
• 2.2 文献纳入分析标准12-13
• 2.3 纳入文献资料收集13
• 2.4 统计分析13-14
• 3 结果14-23
• 3.1 GPX1 rs1050450荟萃分析14-15
• 3.1.1 文献检索结果14
• 3.1.2 荟萃分析结果14-15
• 3.1.3 偏倚性分析15
• 3.2 ALOX15 rs34210653荟萃分析15-17
• 3.2.1 文献检索结果15-16
• 3.2.2 荟萃分析结果16-17
• 3.2.3 偏倚性分析17
• 3.3 APOA5 rs662799荟萃分析17-23
• 3.3.1 文献检索结果17-18
• 3.3.2 荟萃分析结果18-21
• 3.3.3 偏倚性分析21-23
• 4 讨论23-26
• 第二部分：易感基因多态性与 CHD 相关性26-47
• 1 实验目的26
• 2 实验方法26-36
• 2.1 实验试剂26
• 2.2 实验主要仪器26-27
• 2.3 研究对象27
• 2.4 临床资料收集27
• 2.5 提取血液全基因组DNA（核酸自动提取仪 ---磁珠法）27-28
• 2.6 候选基因多态性位点的选取28-30
• 2.7 MASSARRAY平台SNP检测30-36
• 2.7.1 分型原理30
• 2.7.2 引物设计30-33
• 2.7.3 实验步骤33-36
• 2.8 统计分析36
• 3 结果36-43
• 3.1 基因型Hardy-Weinberg平衡分析36
• 3.2 病例对照组基因型和等位基因的比较及相关风险性分析36-43
• 3.2.1 脂类相关基因SNP分型结果36-39
• 3.2.2 炎症相关基因SNP分型结果39-41
• 3.2.3 血管生成相关基因SNP分型结果41-42
• 3.2.4 血栓形成相关基因SNP分型结果42-43
• 4 讨论43-47
• 结论47-48
• 参考文献48-57
• 附录A 中英文对照表57-58
• 附录B 文献综述58-73
• 参考文献67-73
• 在学研究成果73-75
• 致谢75

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前5条

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本文编号：559764