儿童哮喘蛋白和microRNAs血清标志物的筛选及其诊断模型的构建
发布时间:2021-01-10 02:34
第一部分采用i TRAQ定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘血清蛋白标志物及建立诊断模型研究背景:支气管哮喘(bronchial asthma)是以持续的气道炎症、气道高反应性和气道重塑为特征的慢性呼吸道疾病。儿童哮喘发病率逐年增高,约有1/3的患儿可发展成为成人哮喘,及时诊断哮喘、准确评估病情是有效防控儿童哮喘的关键。儿童哮喘不同时期以及病理状态下的蛋白质表达水平的不同,可筛选出与儿童哮喘相关的特异性蛋白,作为预测、诊断、评估儿童哮喘病情及预后的生物标志物。蛋白组学技术的发展为从整体水平分析儿童哮喘相关蛋白提供了技术平台,同位素标记相对和绝对定量标记联合二维液相色谱串联质谱技术(isobaric tags for relative and absolute quantification,two-dimensional liquid chromatography,nanoelectrospray ionization and high resolution tandem mass spectrometry using the hybrid quadrupole time-of-flight p...
【文章来源】:杭州师范大学浙江省
【文章页数】:119 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
蛋白样品SDS-PAGE图
杭州师范大学硕士学位论文采用iTRAQ定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘血清蛋白标志物及建立诊断模型362.3.3差异蛋白的GO分析对本研究的78个差异蛋白进行GO分析,包括分子功能分析、生物过程、和细胞成分。根据分子功能注释,66个差异蛋白主要具有分子功能调节器、结合功能、催化活性和转运活性等9种分子功能;根据生物过程分析,68个差异蛋白主要参与代谢过程、细胞过程、单一生物过程、响应刺激、生物调节、多细胞生物过程等22个重要的生物过程;通过细胞成分分析,68个差异蛋白主要定位在细胞器、胞外区域、细胞外基质、大分子复合物等8种不同的细胞结构(图2-2)。图2-2儿童哮喘差异蛋白GO分析图2.3.4差异蛋白的通路富集分析利用通路富集(KEGG)分析显示,78个差异蛋白中41个蛋白主要涉及补体和凝血级联反应通路、朊病毒疾并金黄色葡萄球菌感染等53个通路,其中16个差异蛋白参与补体和凝血级联反应通路(图2-3)。
杭州师范大学硕士学位论文采用iTRAQ定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘血清蛋白标志物及建立诊断模型37图2-3儿童哮喘差异蛋白通路富集KEGG图2.3.5差异蛋白的PPI相互作用网络图运用String软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图(图2-4)。图2-4中各圆圈代表一种蛋白,空间距离越近的蛋白,越有可能归为一类,蛋白之间的线段越粗表示蛋白间相互作用越紧密。图2-4儿童哮喘差异蛋白PPI相互作用网络图2.3.6差异蛋白ELISA验证结合蛋白质差异比值和GO、KEGG、STRING分析结果,从iTRAQ结果中
本文编号:2967887
【文章来源】:杭州师范大学浙江省
【文章页数】:119 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
蛋白样品SDS-PAGE图
杭州师范大学硕士学位论文采用iTRAQ定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘血清蛋白标志物及建立诊断模型362.3.3差异蛋白的GO分析对本研究的78个差异蛋白进行GO分析,包括分子功能分析、生物过程、和细胞成分。根据分子功能注释,66个差异蛋白主要具有分子功能调节器、结合功能、催化活性和转运活性等9种分子功能;根据生物过程分析,68个差异蛋白主要参与代谢过程、细胞过程、单一生物过程、响应刺激、生物调节、多细胞生物过程等22个重要的生物过程;通过细胞成分分析,68个差异蛋白主要定位在细胞器、胞外区域、细胞外基质、大分子复合物等8种不同的细胞结构(图2-2)。图2-2儿童哮喘差异蛋白GO分析图2.3.4差异蛋白的通路富集分析利用通路富集(KEGG)分析显示,78个差异蛋白中41个蛋白主要涉及补体和凝血级联反应通路、朊病毒疾并金黄色葡萄球菌感染等53个通路,其中16个差异蛋白参与补体和凝血级联反应通路(图2-3)。
杭州师范大学硕士学位论文采用iTRAQ定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘血清蛋白标志物及建立诊断模型37图2-3儿童哮喘差异蛋白通路富集KEGG图2.3.5差异蛋白的PPI相互作用网络图运用String软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图(图2-4)。图2-4中各圆圈代表一种蛋白,空间距离越近的蛋白,越有可能归为一类,蛋白之间的线段越粗表示蛋白间相互作用越紧密。图2-4儿童哮喘差异蛋白PPI相互作用网络图2.3.6差异蛋白ELISA验证结合蛋白质差异比值和GO、KEGG、STRING分析结果,从iTRAQ结果中
本文编号:2967887
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