白屈菜（Chelidonium majus）油质体和种子转录组测序及脂肪酸合成分析
发布时间：2021-01-19 00:03
油质体（elaiosomes）是由蚂蚁散布的一种特殊的肉质的可食用的种子附属物,同时也是种子上吸引蚂蚁的主要结构,其主要成分为油脂,油脂主要由脂肪酸构成。白屈菜（Chelidonium majus L.）是一种习见的多年生草本植物,广泛分布于欧亚大陆,是典型的蚁播植物,其种子上含有油质体作为种子附属物,且由蚂蚁传播。前人通过对白屈菜的研究已经确定了其油质体的主要成分为脂肪酸,且其中主要脂肪酸棕榈酸水平与昆虫的棕榈酸水平相近。然而,油质体中的脂肪酸生物合成的分子机制尚不清楚。在前期对白屈菜种子和油质体发育观察研究的基础上,本研究选择白屈菜花和种子生长发育的四个时期,即花蕾期（Ch01）、盛花期（Ch02）、近成熟种子期（Ch03）和成熟种子期（Ch04）,采集相应时期的样本,对每个时期的样本做三个生物学重复,通过RNA-seq技术对所获全部材料进行高通量转录组测序并对结果进行分析。拟通过白屈菜油质体和种子在不同生长时期的转录组测序结果,对油质体中饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸生物合成及代谢的主要时期进行探究,同时通过分析不同时期的基因差异表达情况,筛选调控脂肪酸合成的关键基因。本研究取得的结果...
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１白屈菜
?４结果与分析???４结果与分析??４．１转录组测序注释结果??４．１．１?ＲＮＡ质量及浓度检测??以１％的琼脂糖凝胶电泳对１２个白屈菜油质体和种子样本的ＲＮＡ进行完整??性检测，发现提取的总ＲＮＡ均呈现两条清晰、无明显拖尾现象的条带，无杂质??污染，如色素、糖类、蛋白等，ＯＤ２６０／２３０２１．５，ＯＤ２６０／２８０２１．８，２８／２３Ｓ?亮度??大于１８／１６Ｓ，?ＲＩＮ值２８．０，总量满足白屈菜物种建库需求，可以进行后续上机测??序实验。说明获得的总ＲＮＡ样本完整性良好。高质量的ＲＮＡ是ＲＮＡ－ｓｅｑ测序??的基础，低质量的ＲＮＡ可能影响ＲＮＡ－ｓｅｑ中ＧＥ磁珠分离ｍＲＮＡ及反转录效??率，可能造成全基因组表达谱分析方法测定不准或ＲＮＡ－ｓｅｑ文库随机性差异，??重复比例高，甚至建库失败。??
??图４－２白屈菜ｕｍｇｅｎｅｓ比对到ＮＲ数据库的同源特性图??Ａ：?Ｅ－ｖａｌｕｅ值统计图；Ｂ：相似度统计图；Ｃ：比对物种分布图。??Ｆｉｇ．４－２?Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ?ｏｆ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｈｏｍｏｌｏｇｙ?ｏｆ?Ｃ．?ｍａｊｕｓ?ｕｎｉｇｅｎｅｓ?ａｇａｉｎｓｔ?ｔｈｅ?ＮＲ?ｄａｔａｂａｓｅ??（Ａ）?Ｅ－ｖａｌｕｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ＢＬＡＳＴ?ｈｉｔｓ?ｆｏｒ?ｅａｃｈ?ｕｎｉｇｅｎｅｓ．?（Ｂ）?Ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ??ｔｏｐ?ＢＬＡＳＴ?ｈｉｔｓ?ｆｏｒ?ｅａｃｈ?ｕｎｉｇｅｎｅ．?（Ｃ）?Ｓｐｅｃｉｅｓ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｔｏｐ?ＢＬＡＳＴ?ｈｉｔｓ．??１００????２５８??〇?，?，，—ｉ—ｉｆＬ?５??Ｓ?４４?十｝山２?丨??Ｉ?ｉ??丨Ｈ??ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｃｉｉＩＩｉｉＩｈｉ?ｃｏｍｐｏｎｅｎ首?ｍｏｔｅｃｕｌａｉ?ｌｕｉｉｃｔｉｏｎ??图４－３?ＧＯ数据库注释情况分类图??Ｆｉｇ．４－３?ＧＯ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ａｓｓｅｍｂｌｅｄ?ｕｎｉｇｅｎｅｓ．??在ＢＰ分类中，大部分基因编码的蛋白质参与到代谢过程中，包括１７７个??ｕｎｉｇｅｎｅｓ，占总：注释的６８．６％；其次是参与到细胞过程的基因，包括１６９个ｕｎｉｇｅｎｅｓ，??占总注释数的６５．５％；以及参与到单一组织过程的基因，包括１５６个ｕｎｉｇｅｎｅｓ，??占总注释数的６０．４７％。在ＭＦ分类中，注释到的基因被分到了?９个功能分类中，??其中以催化活性功能（１６５个ｕｎｉｇｅｎｅｓ
本文编号：2985926
【文章来源】：北京林业大学北京市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１白屈菜
?４结果与分析???４结果与分析??４．１转录组测序注释结果??４．１．１?ＲＮＡ质量及浓度检测??以１％的琼脂糖凝胶电泳对１２个白屈菜油质体和种子样本的ＲＮＡ进行完整??性检测，发现提取的总ＲＮＡ均呈现两条清晰、无明显拖尾现象的条带，无杂质??污染，如色素、糖类、蛋白等，ＯＤ２６０／２３０２１．５，ＯＤ２６０／２８０２１．８，２８／２３Ｓ?亮度??大于１８／１６Ｓ，?ＲＩＮ值２８．０，总量满足白屈菜物种建库需求，可以进行后续上机测??序实验。说明获得的总ＲＮＡ样本完整性良好。高质量的ＲＮＡ是ＲＮＡ－ｓｅｑ测序??的基础，低质量的ＲＮＡ可能影响ＲＮＡ－ｓｅｑ中ＧＥ磁珠分离ｍＲＮＡ及反转录效??率，可能造成全基因组表达谱分析方法测定不准或ＲＮＡ－ｓｅｑ文库随机性差异，??重复比例高，甚至建库失败。??
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