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二倍体马铃薯DM及几个野生近缘种染色体识别和比较FISH的分析

发布时间:2017-12-07 02:03

  本文关键词:二倍体马铃薯DM及几个野生近缘种染色体识别和比较FISH的分析


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【摘要】:马铃薯是世界上仅次于小麦、水稻的重要作物。虽然二倍体栽培种富利亚薯(Solanum phureja,2n=24)DM已经完成测序工作,极大地推动了马铃薯基因组研究。然而由于二代测序和组装的局限性,我们对串联重复序列在栽培马铃薯及其野生近缘种染色体上的位置、分布以及丰度等信息不完全清楚。此外,现代细胞生物学染色体精确识别技术已广泛在多物种中建立,相对其他作物,该技术在栽培二倍体马铃薯及其野生近缘种中还未建立。本文利用12个来自S.tuberosum已知连锁群的BAC克隆,结合rDNA重复序列(5SrDNA 和 45SrDNA)、着丝粒重复序列(St18、St49、St57 和 St3-294)和亚端粒重复序列(CL14和CL34)作为探针,与DM有丝分裂中期染色体进行荧光原位杂交,确定了这些重复序列在不同染色体连锁群上的分布、位置和信号强度。建立了二倍体马铃薯DM染色体识别图和遗传连锁图的联系。结合以上重复序列在染色体上的分布特点,选取一个着丝粒重复序列(St3-238)、两个rDNA重复序列(5SrDNA和45SrDNA)以及两个亚端粒重复序列(CL14和CL34)作为探针并进行多色荧光标记,在DM有丝分裂中期同一分裂相上进行两次连续的多色荧光原位杂交,让二倍体DM的每一条染色体都带上不同的信号,达到精确识别DM的不同染色体的目的。建立了二倍体马铃薯一次性染色体辨认技术。此外,将已建立的DM染色体识别体系,推广到其他几个二倍体野生近缘种全套染色体辨认工作和比较FISH的分析中;发现重复序列St49在多个野生种中都有信号,证明它较为保守,在进化中未发生大的变化;亚端粒重复序列CL14和CL34在几个野生种中分布、强弱变化很大,说明在进化中发生了缺失或重组。本研究对增进二倍体马铃薯DM及其野生近缘种基因组的结构的了解有意义,对推动马铃薯现代细胞遗传学的研究有贡献。该马铃薯染色体识别技术的建立将成为马铃薯染色体工程、多倍体进化和细胞遗传等研究的重要工具。
【学位授予单位】:内蒙古大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:S532

【参考文献】

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本文编号:1260731

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