基于iTRAQ技术的木薯野生种和栽培种块根蛋白质组学研究

发布时间：2017-12-16 17:27

  本文关键词：基于iTRAQ技术的木薯野生种和栽培种块根蛋白质组学研究

  更多相关文章： 木薯 野生种和栽培种 块根 iTRAQ 蛋白质相互作用网络

【摘要】：木薯(Manihot esculenta Crantz)是大戟科(Euphorbiaceae)木薯属(Manihot)作物,是一种重要的淀粉作物,也是热带、亚热带地区近8亿人赖以生存的主要食物来源。其块根除可作为人类粮食来源外,还可以被用作饲料和重要的工业原料,同时在医药、造纸、纺织、化工等方面均有重要作用。由于木薯淀粉具有巨大的经济价值,因此研究木薯块根中淀粉合成积累调控的分子机制,对改良木薯品质、培育高淀粉木薯品种具有重要意义。本研究以种植10个月的栽培种和野生种块根为试验材料,采用i TRAQ技术对野生橡胶木薯(M.glaziovii(MG))、野生近缘种(M.esculenta ssp flabellifolia(W14))、栽培种华南8号(M.esculenta cv.SC No.8(SC8))和华南205(SC205)4种木薯块根的全蛋白质进行分析,了解木薯野生种和栽培种块根淀粉积累的蛋白质调控机制,挖掘影响野生种和栽培种木薯块根淀粉积累的重要蛋白质,为培育高产高淀粉的木薯优良新品种提供理论基础。主要研究结果如下:1.通过i TRAQ技术对4个木薯品种块根蛋白质组进行相对定量分析,共得到谱图402147张,通过Mascot软件进行分析后,匹配到的谱图数量是45836张,其中Unique谱图数量为33087张,共鉴定到5021个蛋白,21309个肽段,其中含16827个Unique肽段。鉴定到的蛋白质相对分子质量主要集中在10~80 k Da,肽段长度主要集中在7~102个氨基酸残基数。2.将鉴定到的蛋白质和COG数据库进行比对,根据功能分为24类;其中预测到功能蛋白质数量最多为826个,能量生产和转化蛋白质331个,氨基酸运输和代谢蛋白质331个,碳水化合物运输和代谢蛋白质351个,翻译、核糖体结构和生物合成蛋白质361个,转录、翻译后修饰、蛋白质折叠和分子伴O兜鞍字，

本文编号：1296858