鮸鱼DIGIRR基因特征、功能及调控研究
发布时间：2020-12-13 10:22
TLR-IL-1R（Toll-like receptor-interleukin 1 receptor signaling,TIR）超家族成员在介导的先天性免疫反应中起着重要作用,其家族成员胞内都含有一个保守的TIR结构域。DIGIRR（Double-Ig-IL-1R Related Molecule）是TIL-IL-1R受体超家族成员之一,作为IL-1信号通路的负调控因子,在免疫系统中发挥重要作用。在本研究中,我们鉴定并表征了鮸鱼（Miichthys miiuy）DIGIRR（mmi-DIGIRR）基因的cDNA序列。mmi-DIGIRR cDNA全长1837bp,包括211bp的5’UTR、1575bp的开放阅读框（ORF）,编码524个氨基酸的蛋白质和51bp的3’UTR。mmi-DIGIRR的分子量为59.43 KDa,理论等电点为6.16。mmi-DIGIRR具有IL-IR受体家族共同的特征,其蛋白结构域主要由胞内保守的TIR结构域和胞外的两个免疫蛋白（immunoglobulin,Ig）结构域两个部分组成。除此之外,mmi-DIGIRR在胞外区还有长16个氨基酸的信号肽序列...
【文章来源】：浙江海洋大学浙江省
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
mmi-DIGIRR的基因序列
鮸鱼DIGIRR基因特征、功能及调控研究26图3-2鱼类DIGIRR的基因结构Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.对于哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因的蛋白质结构域进行比较，如图3-3，结果表明，DIGIRR/SIGIRR不仅有TIR家族的特征，也有作为Ig结构域受体亚家族成员的特征。哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因蛋白质结构域主要由胞内保守的TIR结构域和胞外的Ig结构域组成，但Ig结构域的数量不同，哺乳动物SIGIRR基因只含有一个Ig结构域，鱼类DIGIRR基因含有两个Ig结构域，此外，鱼类DIGIRR基因在N-端还有信号肽区域。图3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白结构域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸鱼DIGIRR基因的线性分析和系统发育树的构建我们利用鱼类基因组数据对鮸鱼DIGIRR、其他鱼类SIGIRR/DIGIRR与哺乳动物和鸟类的SIGIRR进行线性分析，结果见图3-4。DIGIRR基因在不同物种中的线性分析进一步证实了DIGIRR基因的位置。从结果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因线性关
鮸鱼DIGIRR基因特征、功能及调控研究26图3-2鱼类DIGIRR的基因结构Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.对于哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因的蛋白质结构域进行比较，如图3-3，结果表明，DIGIRR/SIGIRR不仅有TIR家族的特征，也有作为Ig结构域受体亚家族成员的特征。哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因蛋白质结构域主要由胞内保守的TIR结构域和胞外的Ig结构域组成，但Ig结构域的数量不同，哺乳动物SIGIRR基因只含有一个Ig结构域，鱼类DIGIRR基因含有两个Ig结构域，此外，鱼类DIGIRR基因在N-端还有信号肽区域。图3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白结构域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸鱼DIGIRR基因的线性分析和系统发育树的构建我们利用鱼类基因组数据对鮸鱼DIGIRR、其他鱼类SIGIRR/DIGIRR与哺乳动物和鸟类的SIGIRR进行线性分析，结果见图3-4。DIGIRR基因在不同物种中的线性分析进一步证实了DIGIRR基因的位置。从结果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因线性关
【参考文献】：
期刊论文
[1]IL1R2在肿瘤发生发展中的作用[J]. 刘颖婷,卢斌峰,蒋敬庭. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2018(08)
[2]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 张媛媛,宋理平. 河北渔业. 2018(02)
[3]鱼类免疫应答机制研究进展[J]. 白姗姗,贾智英,石连玉. 水产学杂志. 2017(04)
[4]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 王俊相,李玉萍,孔令富,李莲军. 四川畜牧兽医. 2010(07)
[5]鱼类髓样分化因子88(MyD88)的研究进展[J]. 郑琳琳,张圣强,安利国. 科技信息. 2009(34)
[6]调节IL-1受体转位至焦点附着斑的观察[J]. 黄文燕,朱文渊,罗秀梅,许孟杰,Eva E QWARNSTROM. 免疫学杂志. 2004(01)
[7]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 孙德文,詹勇,许梓荣. 水利渔业. 2002(06)
[8]I型IL-1受体的结构与其转运功能相关的研究[J]. 黄文燕,罗兆明,David Wyllie,Eva E.Qwarnstrom. 中国病理生理杂志. 2001(02)
[9]一个新的信号受体家族——Toll/IL1R家族的研究进展[J]. 陈建,罗向东,杨宗城,张宗梁. 生理科学进展. 2000(04)
[10]鱼类体液免疫因子研究进展[J]. 张永安,聂品. 水产学报. 2000(04)
博士论文
[1]鱼类IL-1R及相关家族成员的分子克隆与功能研究[D]. 顾一峰.浙江大学 2011
硕士论文
[1]鱼类TLR1和DIGIRR基因的克隆和表达研究[D]. 武小媛.浙江大学 2007
[2]IL-1RI、IL-1RII、IL-1RAcP在骨性关节炎滑膜中的表达及其生物学意义[D]. 张青松.华中科技大学 2006
本文编号：2914392
【文章来源】：浙江海洋大学浙江省
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
mmi-DIGIRR的基因序列
鮸鱼DIGIRR基因特征、功能及调控研究26图3-2鱼类DIGIRR的基因结构Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.对于哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因的蛋白质结构域进行比较，如图3-3，结果表明，DIGIRR/SIGIRR不仅有TIR家族的特征，也有作为Ig结构域受体亚家族成员的特征。哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因蛋白质结构域主要由胞内保守的TIR结构域和胞外的Ig结构域组成，但Ig结构域的数量不同，哺乳动物SIGIRR基因只含有一个Ig结构域，鱼类DIGIRR基因含有两个Ig结构域，此外，鱼类DIGIRR基因在N-端还有信号肽区域。图3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白结构域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸鱼DIGIRR基因的线性分析和系统发育树的构建我们利用鱼类基因组数据对鮸鱼DIGIRR、其他鱼类SIGIRR/DIGIRR与哺乳动物和鸟类的SIGIRR进行线性分析，结果见图3-4。DIGIRR基因在不同物种中的线性分析进一步证实了DIGIRR基因的位置。从结果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因线性关
鮸鱼DIGIRR基因特征、功能及调控研究26图3-2鱼类DIGIRR的基因结构Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.对于哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因的蛋白质结构域进行比较，如图3-3，结果表明，DIGIRR/SIGIRR不仅有TIR家族的特征，也有作为Ig结构域受体亚家族成员的特征。哺乳动物SIGIRR基因和鱼类DIGIRR基因蛋白质结构域主要由胞内保守的TIR结构域和胞外的Ig结构域组成，但Ig结构域的数量不同，哺乳动物SIGIRR基因只含有一个Ig结构域，鱼类DIGIRR基因含有两个Ig结构域，此外，鱼类DIGIRR基因在N-端还有信号肽区域。图3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白结构域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸鱼DIGIRR基因的线性分析和系统发育树的构建我们利用鱼类基因组数据对鮸鱼DIGIRR、其他鱼类SIGIRR/DIGIRR与哺乳动物和鸟类的SIGIRR进行线性分析，结果见图3-4。DIGIRR基因在不同物种中的线性分析进一步证实了DIGIRR基因的位置。从结果可以看出，DIGIRR/SIGIRR基因线性关
【参考文献】：
期刊论文
[1]IL1R2在肿瘤发生发展中的作用[J]. 刘颖婷,卢斌峰,蒋敬庭. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2018(08)
[2]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 张媛媛,宋理平. 河北渔业. 2018(02)
[3]鱼类免疫应答机制研究进展[J]. 白姗姗,贾智英,石连玉. 水产学杂志. 2017(04)
[4]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 王俊相,李玉萍,孔令富,李莲军. 四川畜牧兽医. 2010(07)
[5]鱼类髓样分化因子88(MyD88)的研究进展[J]. 郑琳琳,张圣强,安利国. 科技信息. 2009(34)
[6]调节IL-1受体转位至焦点附着斑的观察[J]. 黄文燕,朱文渊,罗秀梅,许孟杰,Eva E QWARNSTROM. 免疫学杂志. 2004(01)
[7]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 孙德文,詹勇,许梓荣. 水利渔业. 2002(06)
[8]I型IL-1受体的结构与其转运功能相关的研究[J]. 黄文燕,罗兆明,David Wyllie,Eva E.Qwarnstrom. 中国病理生理杂志. 2001(02)
[9]一个新的信号受体家族——Toll/IL1R家族的研究进展[J]. 陈建,罗向东,杨宗城,张宗梁. 生理科学进展. 2000(04)
[10]鱼类体液免疫因子研究进展[J]. 张永安,聂品. 水产学报. 2000(04)
博士论文
[1]鱼类IL-1R及相关家族成员的分子克隆与功能研究[D]. 顾一峰.浙江大学 2011
硕士论文
[1]鱼类TLR1和DIGIRR基因的克隆和表达研究[D]. 武小媛.浙江大学 2007
[2]IL-1RI、IL-1RII、IL-1RAcP在骨性关节炎滑膜中的表达及其生物学意义[D]. 张青松.华中科技大学 2006
本文编号：2914392
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