番茄SlR1-A-like基因的克隆及功能分析
发布时间：2021-01-26 05:47
番茄是我国农业生产中重要的经济作物,但其在生长过程中经常遭受各种不利环境的威胁,给农业生产造成重大经济损失。随着生物技术的发展,通过基因工程手段提高植物的抗逆性已成为十分可行的方法,而此技术的关键在于对抗逆基因的挖掘与研究。本研究首次从番茄中克隆得到SlR1-A-like基因,成功构建了过表达载体,并获得转基因本氏烟草植株,对转基因植株在冷胁迫及致病疫霉侵染过程中所发挥的作用进行探究,具体研究结果如下:（1）生物信息学分析表明,SlR1-A-like基因全长1701 bp,编码566个氨基酸,所形成的SlR1-A-like蛋白为亲水性、非跨膜蛋白,该蛋白具有NB-ARC功能结构域,蛋白分子量为65.7kDa,等电点为5.69。（2）组织表达分析结果表明,SlR1-A-like基因在番茄叶片中表达量最高。非生物胁迫及激素诱导下SlR1-A-like基因表达模式分析结果表明,该基因在不同处理下均有一定程度的表达响应,以冷胁迫和SA处理后SlR1-A-like基因表达上调效果最明显。亚细胞定位结果表明,SlR1-A-like蛋白定位在细胞核与细胞质。（3）对转基因和野生型本氏烟草进行冷胁迫处...
【文章来源】： 刘海震 山东农业大学
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
SlR1-A-like蛋白亲水性/疏水性预测及跨膜结构域预测
山东农业大学硕士学位论文33图3-2SlR1-A-like蛋白结构分析（A）功能结构域；（B）二级结构；（C）三级结构。Fig.3-2StructuralanalysisofSlR1-A-likeprotein(A)Functionaldomain;(B)Secondarystructure;(C)Tertiarystructure.3.1.3SlR1-A-like蛋白的同源蛋白比对分析通过NCBI网站查找得到不同物种中同源蛋白的氨基酸序列，利用DNAMAN软件对不同氨基酸序列进行比对，比对结果发现，所有同源蛋白均具有NB-ARC保守结构域（图3-3）。利用MEGA5.0软件建立进化关系树，进化树分析表明，SlR1-A-like蛋白在相同物种中与SlMi-1C蛋白亲缘关系最近，在不同物种中与鳞茎茄的SbRpi-blb2蛋白亲缘关系最近（图3-4）。
番茄SlR1-A-like基因的克隆及功能分析34图3-3SlR1-A-like氨基酸多序列比对Fig.3-3MultiplesequencealignmentsofSlR1-A-likeproteins图3-4SlR1-A-like同源蛋白进化树分析Fig.3-4EvolutionarytreeanalysisofSlR1-A-likehomologousproteins
【参考文献】：
期刊论文
[1]宿松地区油茶煤污病的发生及防治[J]. 余英才. 农业灾害研究. 2019(02)
[2]番茄青枯病综合防治研究进展[J]. 谢秀明,沈虹,孙锦. 中国果菜. 2018(11)
[3]耐低温弱光番茄新品种唐粉108的选育[J]. 陈胜萍,周国顺,刘晓光,陈志. 中国蔬菜. 2018(08)
[4]番茄抗晚疫病基因Ph-3的分子标记开发及应用[J]. 胡明瑜,白文钦,潘晓雪,吴红,汝学娟,罗佳,尹贤贵,潘光辉,雷开荣. 植物病理学报. 2018(04)
[5]植物抗寒性研究进展[J]. 李文明,辛建攀,魏驰宇,田如男. 江苏农业科学. 2017(12)
[6]外源水杨酸诱导对番茄幼苗抗冷性的影响[J]. 张帆,李景富,姜景彬,张贺,陈秀玲,许向阳. 江苏农业科学. 2017(03)
[7]番茄褪绿病毒病研究进展[J]. 王志荣,王孝宣,杜永臣,高建昌,国艳梅,黄泽军. 园艺学报. 2016(09)
[8]番茄抗病育种研究进展[J]. 刘健,刘娜. 上海蔬菜. 2016(01)
[9]木本植物低温胁迫生理及分子机制研究进展[J]. 乌凤章,王贺新,徐国辉,张自川. 林业科学. 2015(07)
[10]植物内源激素研究进展[J]. 段娜,贾玉奎,徐军,陈海玲,孙鹏. 中国农学通报. 2015(02)
博士论文
[1]SIGLRs和SICaMs在调控番茄低温抗性中的机制研究[D]. 李卉梓.浙江大学 2019
[2]大麦条纹花叶病毒侵染的本生烟叶绿体的三维结构解析及其组学分析[D]. 靳雪娇.中国农业大学 2017
[3]烟草花叶病毒弱毒疫苗的研制及其分子生物学[D]. 邵碧英.福建农林大学 2001
硕士论文
[1]番茄SlGAMYBL2基因克隆及非生物胁迫中的功能分析[D]. 李姗姗.广西大学 2018
[2]烟草NtR1-A-like基因的克隆和功能分析[D]. 刘斌.山东农业大学 2018
[3]炭疽菌侵染后茶树cDNA-AFLP体系构建和基因差异表达研究[D]. 赖建东.福建农林大学 2016
[4]不同砧木番茄嫁接苗耐冷性生理机制的研究[D]. 程群科.西南大学 2012
本文编号：3000581
【文章来源】： 刘海震 山东农业大学
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
SlR1-A-like蛋白亲水性/疏水性预测及跨膜结构域预测
山东农业大学硕士学位论文33图3-2SlR1-A-like蛋白结构分析（A）功能结构域；（B）二级结构；（C）三级结构。Fig.3-2StructuralanalysisofSlR1-A-likeprotein(A)Functionaldomain;(B)Secondarystructure;(C)Tertiarystructure.3.1.3SlR1-A-like蛋白的同源蛋白比对分析通过NCBI网站查找得到不同物种中同源蛋白的氨基酸序列，利用DNAMAN软件对不同氨基酸序列进行比对，比对结果发现，所有同源蛋白均具有NB-ARC保守结构域（图3-3）。利用MEGA5.0软件建立进化关系树，进化树分析表明，SlR1-A-like蛋白在相同物种中与SlMi-1C蛋白亲缘关系最近，在不同物种中与鳞茎茄的SbRpi-blb2蛋白亲缘关系最近（图3-4）。
番茄SlR1-A-like基因的克隆及功能分析34图3-3SlR1-A-like氨基酸多序列比对Fig.3-3MultiplesequencealignmentsofSlR1-A-likeproteins图3-4SlR1-A-like同源蛋白进化树分析Fig.3-4EvolutionarytreeanalysisofSlR1-A-likehomologousproteins
【参考文献】：
期刊论文
[1]宿松地区油茶煤污病的发生及防治[J]. 余英才. 农业灾害研究. 2019(02)
[2]番茄青枯病综合防治研究进展[J]. 谢秀明,沈虹,孙锦. 中国果菜. 2018(11)
[3]耐低温弱光番茄新品种唐粉108的选育[J]. 陈胜萍,周国顺,刘晓光,陈志. 中国蔬菜. 2018(08)
[4]番茄抗晚疫病基因Ph-3的分子标记开发及应用[J]. 胡明瑜,白文钦,潘晓雪,吴红,汝学娟,罗佳,尹贤贵,潘光辉,雷开荣. 植物病理学报. 2018(04)
[5]植物抗寒性研究进展[J]. 李文明,辛建攀,魏驰宇,田如男. 江苏农业科学. 2017(12)
[6]外源水杨酸诱导对番茄幼苗抗冷性的影响[J]. 张帆,李景富,姜景彬,张贺,陈秀玲,许向阳. 江苏农业科学. 2017(03)
[7]番茄褪绿病毒病研究进展[J]. 王志荣,王孝宣,杜永臣,高建昌,国艳梅,黄泽军. 园艺学报. 2016(09)
[8]番茄抗病育种研究进展[J]. 刘健,刘娜. 上海蔬菜. 2016(01)
[9]木本植物低温胁迫生理及分子机制研究进展[J]. 乌凤章,王贺新,徐国辉,张自川. 林业科学. 2015(07)
[10]植物内源激素研究进展[J]. 段娜,贾玉奎,徐军,陈海玲,孙鹏. 中国农学通报. 2015(02)
博士论文
[1]SIGLRs和SICaMs在调控番茄低温抗性中的机制研究[D]. 李卉梓.浙江大学 2019
[2]大麦条纹花叶病毒侵染的本生烟叶绿体的三维结构解析及其组学分析[D]. 靳雪娇.中国农业大学 2017
[3]烟草花叶病毒弱毒疫苗的研制及其分子生物学[D]. 邵碧英.福建农林大学 2001
硕士论文
[1]番茄SlGAMYBL2基因克隆及非生物胁迫中的功能分析[D]. 李姗姗.广西大学 2018
[2]烟草NtR1-A-like基因的克隆和功能分析[D]. 刘斌.山东农业大学 2018
[3]炭疽菌侵染后茶树cDNA-AFLP体系构建和基因差异表达研究[D]. 赖建东.福建农林大学 2016
[4]不同砧木番茄嫁接苗耐冷性生理机制的研究[D]. 程群科.西南大学 2012
本文编号：3000581
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