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松辽黑猪RBP4和RARG基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

发布时间:2020-10-31 17:09
   母猪繁殖性状对养猪业的生产效益和经济利益至关重要,近年来与母猪繁殖性状相关的候选基因及分子标记备受关注。本研究以132头松辽黑猪为研究对象,选取与猪繁殖性状相关的视黄醇结合蛋白4(RBP4)和视黄酸受体γ(RARG)基因为候选基因,采用PCR-HRM分析与DNA测序相结合的方法,检测松辽黑猪RBP4和RARG基因部分外显子的单核苷酸多态性(SNP),并比较分析不同基因型与母猪总产仔数、产活仔数、初生重、3周龄重、断奶重及乳头数的关联性,旨在寻找与松辽黑猪繁殖性状相关的SNP,为松辽黑猪高繁殖力新品系的选育奠定基础。研究结果表明:1.在松辽黑猪RBP4基因第3外显子和第5外显子上各发现一个SNP位点,分别命名为为G45A和C170T,其中在G45A位点检测到GG、GA和AA 3种基因型,在C170T位点检测到CC和CT 2种基因型;在松辽黑猪RARG基因第6外显子及第8外显子上均未检测到SNP位点。2.RBP4基因G45A位点在该松辽黑猪群体中分布较为均匀,遗传变异程度处于中等水平,可提供遗传信息性中等,偏离Hardy-Weinberg定律(P0.05);C170T位点在该实验群体中分布不均匀,遗传变异程度较低,可提供遗传信息性较低,未偏离Hardy-Weinberg定律(P0.05)。3.在RBP4基因G45A位点上,3种基因型的总产仔数及产活仔数均表现为GGGAAA基因型,其中GG基因型的总产仔数、产活仔数显著地高于AA基因型(P0.05);在仔猪3周龄重方面,GG基因型显著低于GA基因型(P0.05);在仔猪断奶重上GG基因型显著低于GA及AA基因型(P0.05);该位点各基因型在仔猪初生重及乳头数上未表现出显著差异(P0.05)。在C170T位点上,不同基因型松辽黑猪的总产仔数、产活仔数、仔猪初生重、3周龄重、断奶重及乳头数均无显著差异(P0.05)。4.综上,RBP4基因G45A位点对松辽黑猪产仔数具有显著影响,今后可将该位点作为选留高产仔数母猪个体的参考之一。但该位点是否可作为松辽黑猪产仔数相关的遗传标记,有待进一步研究。RBP4基因C170T位点可能不是松辽黑猪繁殖性状相关的突变位点,在后期工作中,需扩大群体做进一步验证。目前尚不能确定RBP4基因是否为影响松辽黑猪繁殖性状的主效基因,需要从该基因的功能及作用机制等方面出发加以验证。
【学位单位】:长春师范大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:S828
【部分图文】:

外显子,基因,测序,基因型


D:AA 基因型D: AA genotype图 3.3 RBP4 基因第 3 外显子测序结果Fig.3.3 The sequencing results of Exon 3 of RBP4 gene
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本文编号:2864244

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