猪德尔塔冠状病毒受体的筛选与鉴定
【学位单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:S852.651
【部分图文】:
冠状病毒(Coronaviruses, CoVs)属于尼多病毒目(Nidovirales)、冠状病毒科(Coronavirinae)该病毒的宿主范围广,包括人、禽类及其他哺乳动物 (Jonassen et al., 2016; Liu et al., 2005; Van dehoek et al., 2004; Woo et al., 2009)。其中,δ-冠状病毒(Delatcoronavirus, DCoV)是2011年国际病毒分类委员会(The International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)新分出的冠状病毒属δ-冠状病毒最早于2007年,从中国白鼬獾和亚洲豹猫中检测得到 (Dong et al., 2007; Woo et al.2012)。而猪δ-冠状病毒(Porcine delatcoronavirus, PDCoV)是2012年新发现的一种猪冠状病毒,现已证实PDCoV具有较强的致病性,能导致母猪、仔猪发生水样腹泻、呕吐等,哺乳仔猪感染后死亡率可达30%~40% (Wang et al., 2014),对我国养猪业造成了严重的经济损失。DCoV不仅感染哺育动物,还感染野禽,对公共安全具有潜在的威胁性,到目前为止DCoV感染宿主细胞的过程尚不清楚。1.1.1 PDCoV 分类地位PDCoV属于尼多病毒目(Nidovirales)、冠状病毒科(Coronaviridae)、冠状病毒亚科(Coronavirus)、δ-冠状病毒属(Deltacoronavirus)的成员,如图1.1所示。
图1.2 PDCoV粒子结构和形态Fig. 1.2 The Architecture and morphology of PDCoV virionA:冠状病毒粒子结构;B:PDCoV粒子形态(PDCoV NH株,负染染色)rchitecture of coronavirus particles (Sandrineet et al., 2012); B: The morphology of PDCoV virion (NHCoV 基因组结构oV基因组长度是所有冠状病毒家族中最小的,约为25 kb (方谱县等,2016),其基到3′端依次为:5′非编码区(UTR)、开放阅读框1a/1b(ORF1a/1b)、S基因、非结构蛋白6(nsp6)、N基因、非结构蛋白7(nsp7)和3′UTR,如图1.3所示 (′端2/3的基因组,编码两个较大重叠的开放阅读框ORF1a和ORF1b,其编码两个pp1ab。根据对其他冠状病毒的研究,PDCoV的多聚蛋白pp1a和pp1ab通常被病毒割、加工形成16个成熟的非结构蛋白,其主要与病毒复制转录有关 (Hurst et al., 2后1/3编码四个结构蛋白,依次是纤突蛋白(Spike, S)、小膜蛋白(Small memberaMemberane, M)以及核衣壳蛋白(Nucleocapsid, N),以及辅助蛋白(Accessory pNS7,预计NS6位于在基因组中的M和N之间,而NS7则位于N基因内的一个ORF广泛分布于冠状病毒基因组中 (Riffault et al., 1997; Surjit et al., 2006; Woo et al
易感细胞表面的特异性受体结合完成的 (Brierley et al., 1989)。研究表明,病毒受体大多属于蛋白质,也有脂类或糖脂 (Adriaan, 2017)。冠状病毒感染宿主细胞的过程,以SARS冠状病毒为例,如图1.4所示 (Adriaan, 2017)。冠状病毒复制周期是从翻译病毒基因组的5'端ORF开始(ORF1a和ORF1b),其合成两个多聚蛋白pp1a和pp1ab,通过两个或三个ORF1a编码的蛋白酶的切割,蛋白水解后,从pp1a和pp1ab释放15或16个复制酶蛋白 (Brierley and Dos Ramos, 2006)。在复制酶的作用下,病毒基因组通过不连续转录模式,转录生成新的基因组RNA和亚基因组mRNA,接着进入细胞质,开始翻译过程:基因组RNA首先开始翻译,产生病毒RNA复制所需的蛋白酶;其次是亚基因组翻译
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本文编号:2884712
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