马立克氏肿瘤的泛素化组分析及CDK1泛素化的鉴定
发布时间：2020-12-05 10:29
马立克氏病（MD）是由血清1型马立克氏病毒（MDV-1）引起的鸡淋巴组织增生性传染病。鸡CD4+T细胞最易被MDV感染转化,可经浸润在外周神经和内脏器官中形成T淋巴瘤并引起免疫抑制。MDV编码的基因参与MD肿瘤发生、MDV的感染与复制等过程,一些有关MD肿瘤的转录组和蛋白质组分析也揭示MDV可通过改变宿主细胞的组学促进致病。本实验的前期研究发现MDV编码的被膜蛋白UL36具有去泛素化酶活性,并在MD肿瘤细胞中高水平表达,此蛋白在MDV的复制、致瘤及传播中发挥重要作用。由于动物细胞内的蛋白质泛素化参与细胞周期、增殖、分化、凋亡和病毒感染等过程,我们推测MDV可能改变鸡CD4+T淋巴细胞的泛素化组以促进肿瘤发生及免疫功能异常。因此,本研究对MD肿瘤细胞与鸡正常CD4+T细胞的泛素化组差异进行了分析。本研究应用抗泛素化肽段（K-ε-GG）的单克隆抗体分离MD肿瘤细胞系MDCC-MSB1细胞和CD4+T淋巴细胞中的泛素化多肽,然后应用质谱对多肽进行定量和定性分析,并应用生物信息学分析泛素化基序、结构域以及蛋...
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：112 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
纯化的鸡CD4+T淋巴细胞的纯度鉴定Fig.1.1VerificationofthepurifiedchickenCD4+Tlymphocytes
图 1.3 MS 数据的质量控制分析Fig. 1.3 Quality control and validation of MS dataA. 鉴定到的多肽的质量误差分布。B. 不同长度多肽的个数. The mass error distribution of the identified peptides. B. Number of peptidesdifferent lengths.本实验中，一共鉴定到了 2880 个蛋白质和这些蛋白质中的 10024 个泛。除去 MDCC-MSB1/T cells（M/T 比值）定量比值中的无效的统计结有 2350 个蛋白和其中的 7097 个泛素化多肽定量检测比值具有统计<0.05）。在此基础上，M/T 比值≥2.0 认为是泛素化显著上调，而 T/M 比值为是泛素化显著下调。每个样品均进行三次平行重复实验，检测数据的果如图 1.4，x/y 的值接近 1 则表示数据有很好的再现性，图中可知所得展现了良好的重复性。最终，检测到有 717 个蛋白质及其 1638 个肽段
图 1.4 使用散点图对三次重复实验的再现性分析Fig. 1.4 Reproducibility analysis of three repeated measures using a scatter diagramA. 横轴表示 LOG2（M-1 / T-1 比率）的值，纵轴表示 LOG2（M-2 / T-2 比率）的值。 B. 横轴表示 LOG2（M-2 / T-2 比率）的值，纵轴表示 LOG2（M-3 / T-3比率）的值。C. 横轴表示 LOG2（M-1 / T-1 比率）值，纵轴表示 LOG2（M-3 / T-3比率）值A. The x-axis presents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents theLOG2 (M-2/T-2 ratio) values. B. The x-axis presents the LOG2 (M-2/T-2 ratio)values, and the y-axis presents the LOG2 (M-3/T-3 ratio) values. C. The x-axispresents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents the LOG2(M-3/T-3 ratio) values.1.3.3.2 ‘RD.K..N’基序更容易受 MDV 的泛素化或去泛素化调节
【参考文献】：
期刊论文
[1]马立克氏病毒UL36蛋白的表达及其去泛素化酶活性分析[J]. 王梦云,周宏达,韦美甜,吕岩,吴山力,艾永兴. 畜牧与兽医. 2017(05)
本文编号：2899310
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：112 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
纯化的鸡CD4+T淋巴细胞的纯度鉴定Fig.1.1VerificationofthepurifiedchickenCD4+Tlymphocytes
图 1.3 MS 数据的质量控制分析Fig. 1.3 Quality control and validation of MS dataA. 鉴定到的多肽的质量误差分布。B. 不同长度多肽的个数. The mass error distribution of the identified peptides. B. Number of peptidesdifferent lengths.本实验中，一共鉴定到了 2880 个蛋白质和这些蛋白质中的 10024 个泛。除去 MDCC-MSB1/T cells（M/T 比值）定量比值中的无效的统计结有 2350 个蛋白和其中的 7097 个泛素化多肽定量检测比值具有统计<0.05）。在此基础上，M/T 比值≥2.0 认为是泛素化显著上调，而 T/M 比值为是泛素化显著下调。每个样品均进行三次平行重复实验，检测数据的果如图 1.4，x/y 的值接近 1 则表示数据有很好的再现性，图中可知所得展现了良好的重复性。最终，检测到有 717 个蛋白质及其 1638 个肽段
图 1.4 使用散点图对三次重复实验的再现性分析Fig. 1.4 Reproducibility analysis of three repeated measures using a scatter diagramA. 横轴表示 LOG2（M-1 / T-1 比率）的值，纵轴表示 LOG2（M-2 / T-2 比率）的值。 B. 横轴表示 LOG2（M-2 / T-2 比率）的值，纵轴表示 LOG2（M-3 / T-3比率）的值。C. 横轴表示 LOG2（M-1 / T-1 比率）值，纵轴表示 LOG2（M-3 / T-3比率）值A. The x-axis presents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents theLOG2 (M-2/T-2 ratio) values. B. The x-axis presents the LOG2 (M-2/T-2 ratio)values, and the y-axis presents the LOG2 (M-3/T-3 ratio) values. C. The x-axispresents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents the LOG2(M-3/T-3 ratio) values.1.3.3.2 ‘RD.K..N’基序更容易受 MDV 的泛素化或去泛素化调节
【参考文献】：
期刊论文
[1]马立克氏病毒UL36蛋白的表达及其去泛素化酶活性分析[J]. 王梦云,周宏达,韦美甜,吕岩,吴山力,艾永兴. 畜牧与兽医. 2017(05)
本文编号：2899310
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/2899310.html
最近更新
教材专著
