京海黄鸡生长期胸肌转录组分析及关键基因RAC2功能初步验证
发布时间：2020-12-18 23:17
生长性能对肉鸡生产极为重要,在肉鸡的生长过程中,不同生长阶段基因的表达情况不同,肌肉生长发育的调控机制较为复杂,关于肉鸡生长分子机制的研究依然较少。本试验采集4、8和12周龄京海黄鸡公鸡胸肌进行转录组测序研究,并运用实时荧光定量技术对测序结果进行验证;本试验进一步选取关键差异基因RAC2,采用慢病毒干扰的方法检测其对下游基因的调控情况。主要研究结果如下:1.以Fold Change≥2且FDR≤0.05作为筛选标准,4、8和12周龄三个组两两比较后共获得4608个差异表达基因,其中4周龄与8周龄相比（M4FvsM8F）获得83个差异表达基因,4周龄与12周龄相比（M4FvsM12F）获得3445个差异表达基因,8周龄与12周龄相比（M8FvsM12F）获得3903个差异表达基因。对差异基因进一步分析发现在三个组比较中得到6个共同差异表达基因,其中三个得到了注释,分别为SNCG、MYH1A和ARHGDIB,说明这些基因在京海黄鸡生长前期各个阶段都与生长发育关系密切。2.分别对M4FvsM8F、M4FvsM12F和M8FvsM12F三个组比较得到的83、3445和3903个差异表达基因进行...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１?ＨＩＶ－１病毒基因结构??Ｆｉｕｒｅ?１．１?Ｇｅｎｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＨＩＶ－１??
图２．１总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．１?Ｔｈｅ?ａｇａｒｏｓｅ?ｇｅｌ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ??ｎｏｄｒｏｐ和Ａｇｉｌｅｎｔ２１００对ＲＮＡ样品进一步检测，结果汇总如下，ＮＡ浓度都在正常范围内，通过２８Ｓ／１８Ｓ和０Ｄ值２６０／２８０可知降解现象，每个样本ＲＩＮ（ＲＮＡｉｎｔｅｇｒｉｔｙｎｍｎｂｅｒ）值均大于等于７测序要求。??表２．３?ＲＮＡ检测结果汇总表??Ｔａｂｌｅ?２．３?Ｔｈｅ?ｔａｂｌｅ?ｏｆ?ＲＮＡ?ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ?ｒｅｓｕｌｔｓ??称?浓度（ｎｇ／｜ｉｌ）?ＲＩＮ．ｈ?ＯＤ２６０／２８０?ＯＤ２６０／２３０?２８Ｓ／１８Ｓ?．?．??ａｍｅ?Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ?（ｎｇ／ｕｌ）?ＲＮＡ?ｉｎｔｅｇｒｉｔｙ７０?２．０５９?１．９４４?１．４?８．５??
?ＩＳ??ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ?ｃｈａｎｇｅ）??图２．３差异表达基因火山图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．３?Ｔｈｅ?ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ＤＥＧｓ??Ｍ４ＦｖｓＭ８Ｆ?Ｍ４ＦｖｓＭ１２Ｆ??２５??３１?
【参考文献】：
期刊论文
[1]蝇蛆蛋白对寿光鸡生产性能、屠宰性能和鸡肉品质的影响[J]. 郭瑞萍,肖发沂,李超,郭嫔,田慧丽,李舫. 饲料研究. 2018(01)
[2]广东菜鸡肉香肠的加工工艺研究[J]. 相玉秀,宗焕然,郭玲玲. 肉类工业. 2017(11)
[3]肌球蛋白重链基因在人类遗传性疾病中的研究进展[J]. 何一旻,顾鸣敏. 遗传. 2017(10)
[4]肉种鸡繁殖技术措施[J]. 郭红光. 中国畜禽种业. 2017(01)
[5]慢病毒载体及其研究进展[J]. 孟凡荣,陈琛,万海粟,周清华. 中国肺癌杂志. 2014(12)
[6]黄山黑鸡体尺、屠宰性能和肉品质测定及相关分析[J]. 李俊营,陈丽园,詹凯,刘伟,杨秀娟,张伟,刘盛南,罗联辉,胡成来. 中国家禽. 2014(14)
[7]珍禽贵妃鸡体尺性状与屠宰性能的相关分析[J]. 李乃宾,杨芬霞,杜炳旺,陶林,陈洁波. 南方农业学报. 2014(07)
[8]溧阳鸡体尺测量及屠宰性能测定[J]. 万建洪,张军,池智贤,成艳,龚道清. 畜牧与兽医. 2011(05)
[9]不同性别京海黄鸡体尺及屠宰性能的比较分析[J]. 杨燕,吕慎金,王金玉,王丽云,于佳慧,陈香艳,魏萍. 黑龙江畜牧兽医. 2010(05)
博士论文
[1]PAK3在心肌肥厚中的作用和机制研究[D]. 陈建州.南京大学 2016
[2]鸡生长发育和肌纤维生长的影响因素与相关基因表达研究[D]. 李娟.四川农业大学 2013
[3]肉鸡肌纤维特性与肉质性状的形成规律及日粮营养调控研究[D]. 赵景鹏.中国农业科学院 2010
硕士论文
[1]氯化镧对子代大鼠海马神经元树突棘及Rac1-PAK信号通路的影响[D]. 孙文昌.中国医科大学 2018
[2]复方中草药添加剂的研发及其在肉鸡生产中的应用研究[D]. 孙启.安徽科技学院 2017
[3]高、低产蛋量京海黄鸡卵巢组织转录组学分析[D]. 韩昆鹏.扬州大学 2016
[4]不同饲养方式对优质鸡的生长性能、屠宰性能以及肉质性状的影响[D]. 余鹏.四川农业大学 2012
[5]不同品种鸡的肌纤维发育规律及其与肉质的关系[D]. 刘冰.中国农业大学 2005
本文编号：2924779
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１?ＨＩＶ－１病毒基因结构??Ｆｉｕｒｅ?１．１?Ｇｅｎｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ＨＩＶ－１??
图２．１总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．１?Ｔｈｅ?ａｇａｒｏｓｅ?ｇｅｌ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ??ｎｏｄｒｏｐ和Ａｇｉｌｅｎｔ２１００对ＲＮＡ样品进一步检测，结果汇总如下，ＮＡ浓度都在正常范围内，通过２８Ｓ／１８Ｓ和０Ｄ值２６０／２８０可知降解现象，每个样本ＲＩＮ（ＲＮＡｉｎｔｅｇｒｉｔｙｎｍｎｂｅｒ）值均大于等于７测序要求。??表２．３?ＲＮＡ检测结果汇总表??Ｔａｂｌｅ?２．３?Ｔｈｅ?ｔａｂｌｅ?ｏｆ?ＲＮＡ?ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ?ｒｅｓｕｌｔｓ??称?浓度（ｎｇ／｜ｉｌ）?ＲＩＮ．ｈ?ＯＤ２６０／２８０?ＯＤ２６０／２３０?２８Ｓ／１８Ｓ?．?．??ａｍｅ?Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ?（ｎｇ／ｕｌ）?ＲＮＡ?ｉｎｔｅｇｒｉｔｙ７０?２．０５９?１．９４４?１．４?８．５??
?ＩＳ??ｌｏｇ２（ｆｏｌｄ?ｃｈａｎｇｅ）??图２．３差异表达基因火山图??Ｆｉｇｕｒｅ?２．３?Ｔｈｅ?ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ＤＥＧｓ??Ｍ４ＦｖｓＭ８Ｆ?Ｍ４ＦｖｓＭ１２Ｆ??２５??３１?
【参考文献】：
期刊论文
[1]蝇蛆蛋白对寿光鸡生产性能、屠宰性能和鸡肉品质的影响[J]. 郭瑞萍,肖发沂,李超,郭嫔,田慧丽,李舫. 饲料研究. 2018(01)
[2]广东菜鸡肉香肠的加工工艺研究[J]. 相玉秀,宗焕然,郭玲玲. 肉类工业. 2017(11)
[3]肌球蛋白重链基因在人类遗传性疾病中的研究进展[J]. 何一旻,顾鸣敏. 遗传. 2017(10)
[4]肉种鸡繁殖技术措施[J]. 郭红光. 中国畜禽种业. 2017(01)
[5]慢病毒载体及其研究进展[J]. 孟凡荣,陈琛,万海粟,周清华. 中国肺癌杂志. 2014(12)
[6]黄山黑鸡体尺、屠宰性能和肉品质测定及相关分析[J]. 李俊营,陈丽园,詹凯,刘伟,杨秀娟,张伟,刘盛南,罗联辉,胡成来. 中国家禽. 2014(14)
[7]珍禽贵妃鸡体尺性状与屠宰性能的相关分析[J]. 李乃宾,杨芬霞,杜炳旺,陶林,陈洁波. 南方农业学报. 2014(07)
[8]溧阳鸡体尺测量及屠宰性能测定[J]. 万建洪,张军,池智贤,成艳,龚道清. 畜牧与兽医. 2011(05)
[9]不同性别京海黄鸡体尺及屠宰性能的比较分析[J]. 杨燕,吕慎金,王金玉,王丽云,于佳慧,陈香艳,魏萍. 黑龙江畜牧兽医. 2010(05)
博士论文
[1]PAK3在心肌肥厚中的作用和机制研究[D]. 陈建州.南京大学 2016
[2]鸡生长发育和肌纤维生长的影响因素与相关基因表达研究[D]. 李娟.四川农业大学 2013
[3]肉鸡肌纤维特性与肉质性状的形成规律及日粮营养调控研究[D]. 赵景鹏.中国农业科学院 2010
硕士论文
[1]氯化镧对子代大鼠海马神经元树突棘及Rac1-PAK信号通路的影响[D]. 孙文昌.中国医科大学 2018
[2]复方中草药添加剂的研发及其在肉鸡生产中的应用研究[D]. 孙启.安徽科技学院 2017
[3]高、低产蛋量京海黄鸡卵巢组织转录组学分析[D]. 韩昆鹏.扬州大学 2016
[4]不同饲养方式对优质鸡的生长性能、屠宰性能以及肉质性状的影响[D]. 余鹏.四川农业大学 2012
[5]不同品种鸡的肌纤维发育规律及其与肉质的关系[D]. 刘冰.中国农业大学 2005
本文编号：2924779
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/2924779.html
最近更新
教材专著
