静原鸡ELOVL2和ELOVL5基因组织表达特性及生物信息学分析
发布时间：2021-01-02 01:18
极长链脂肪酸延伸酶家族基因（ELOVLs）是哺乳动物脂肪酸合成的起始酶和限速酶,其中ELOVL2和ELOVL5主要参与合成对人体有特殊营养价值的多不饱和脂肪酸。为了研究鸡ELOVLs基因家族的遗传多态性、组织表达特性及编码蛋白的特性和高级结构,本研究以宁夏地方优良品种静原鸡为研究对象,采用PCR-SSCP及DNA测序技术对静原鸡ELOVL2和ELOVL5基因所有外显子和部分内含子序列进行遗传多态性检测,利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术对静原鸡肝脏、肌肉、心脏、睾丸、卵巢、腹脂6个组织中ELOVL2和ELOVL5基因的mRNA表达量进行检测、分析,通过生物信息学方法对ELOVL2和ELOVL5基因CDS区的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亲水性/疏水性、二级结构以及磷酸化位点等进行预测分析,研究结果表明:1.静原鸡ELOVL2和ELOVL5基因遗传多态性 静原鸡ELOVL2基因外显子7、8和内含子2、4、6上均存在多态性,其中ELOVL2基因外显子7（E2e7）和外显子8（E2e8）分别存在c.708G>A和c.888T>C的突变,均属于同义突变,两个突变位点均未偏...
【文章来源】：宁夏大学宁夏回族自治区 211工程院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１静原鸡全基因组ＤＮＡ提取??Ｆｉｇ?２－１?ｔｈｅ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｊｉｎｇｙｕａｎ?ｃｈｉｃｋｅｎ??
２．２．４．２静原鸡基因内含子２、内含子４和内含子６序列比对分析??与ＮＣＢＩ公布的原鸡基因序列（ＮＣ＿００６０８９．４）比对后发现，静原鸡Ｅ２Ｉ６引物扩??增片段多态性是由内含子６上的核苷酸点突变造成的，等位基因序列比对如图２－６，等位基??因Ｂ４存在ｇ．６３３８８０００＋７４８Ｇ＞Ｃ的颠换。静原鸡Ｅ２Ｉ２引物扩增片段多态性是由内含子２上??的核苷酸点突变造成的，等位基因序列比对如图２－７，其中等位基因Ｂ３存在??ｇ．６３３７２２２８＋４９１８Ｇ＞Ａ的转换和ｇ．６３３７２２２８＋５０２４Ｔ＞Ｃ的转换，等位基因Ａ３存在??ｇ．６３３７２２２８＋５０２４Ｔ＞Ｃ?的转换，等位基因?Ｄ３?存在?ｇ．６３３７２２２８＋４９１８Ｇ＞Ａ?的转换、??ｇ．６３３７２２２８＋４９２８Ｃ＞Ａ的颠换和ｇ．６３３７２２２８＋５０２５Ｔ＞Ｃ的转换。静原鸡Ｅ２Ｉ４引物扩增片段多??态性是由内含子区的核苷酸点突变造成的，其中等位基因Ｂ５存在ｇ．６３３８６５０２＋２１１Ａ＞Ｇ的转??换，等位基因Ｃ５存在ｇ．?６３３８６５０２＋１６５Ｔ＞Ｃ的转换和ｇ．?６３３８６５０２＋２１１Ａ＞Ｇ的转换（图２－８）。??２．２．４．３静原鸡基因内含子２序列比对分析??与ＮＣＢＩ公布的原鸡说ＯＦＺ５基因序列（ＮＣ＿００６０９０．４）进行比对，静原鸡Ｅ５Ｉ２引物扩??增片段多态性是由第二内含子的核苷酸点突变造成的
论文?第三章静原鸡ＥＬ０ＶＬ２及ＥＬＯＶＬ５基因ｍＲ析??度分析??ＮＡ利用２％琼脂糖凝胶电泳进行检测，结果如图３－１所示，２８Ｓ、１８Ｓ、５Ｓ，无明显降解。总ＲＮＡ的纯度通过分光光度ＯＤ２６０／ＯＤ２８０在１．８？２．０之间，说明提取的ＲＮＡ纯度较高，
【参考文献】：
期刊论文
[1]牛妊娠相关糖蛋白BoPAG1的制备及生物信息学分析[J]. 杨亚军,王震,张洁,徐明国,陈创夫. 生物技术. 2019(01)
[2]油酸和亚油酸对山羊乳腺细胞甘油三酯含量及乳脂合成相关基因表达的影响[J]. 李君,杨文卓,候霞飞,王笑笑,姬向波,李新锋,权凯. 中国畜牧兽医. 2019(02)
[3]论生物信息学在动物遗传育种中的应用[J]. 朱淼. 南方农机. 2018(23)
[4]静宁鸡PPARα基因克隆及生物信息学分析[J]. 李萌楠,江婷,宋爱娟,杨悦,杨妍梅. 甘肃畜牧兽医. 2018(11)
[5]固原鸡生肌调节因子MyoD基因克隆及其组织表达分析[J]. 张久盘,王锦,张娟,魏大为. 中国家禽. 2018(21)
[6]ELOVL6基因研究现状[J]. 胡忠昌,曹阳,秦立红,吴健,赵玉民. 黑龙江畜牧兽医. 2018(19)
[7]静宁鸡肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性筛查及生物信息学分析[J]. 张丽,刘丽霞,戴洪伟,陈红,王瑞,岳炳辉. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2018(05)
[8]生物类专业生物信息学课程教学探索——华南农业大学生物类专业生物信息学课程的教改实践与思考[J]. 易继财. 安徽农业科学. 2018(26)
[9]鸡基因组育种和保种用SNP芯片研发及应用[J]. 刘冉冉,赵桂苹,文杰. 中国家禽. 2018(15)
[10]浅析生物信息学在动物遗传育种中的应用[J]. 黄晶. 农民致富之友. 2018(13)
博士论文
[1]静宁鸡肌肉发育调控机理[D]. 安锋利.兰州大学 2013
硕士论文
[1]牛EL0VL5基因核心启动子的确定及其启动子多态性影响乳质性状的分子机制[D]. 郭鹏程.吉林大学 2017
[2]兰州鲇生长性状相关基因的分离、序列特征及组织特异性表达分析[D]. 俞兆曦.甘肃农业大学 2016
[3]固原鸡不同群体生产性能及鸡肉营养成分的试验研究[D]. 王晓薇.宁夏大学 2013
[4]小鼠elovl2与△6 desaturase及线虫sfat1三基因共转促进EPA向DHA转化的研究[D]. 孙晓艳.陕西师范大学 2012
[5]不同饲养方式下二郎山山地鸡脂肪酸含量及ELOVL2、ELOVL5基因的组织表达研究[D]. 杨琴.四川农业大学 2011
本文编号：2952363
【文章来源】：宁夏大学宁夏回族自治区 211工程院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１静原鸡全基因组ＤＮＡ提取??Ｆｉｇ?２－１?ｔｈｅ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｊｉｎｇｙｕａｎ?ｃｈｉｃｋｅｎ??
２．２．４．２静原鸡基因内含子２、内含子４和内含子６序列比对分析??与ＮＣＢＩ公布的原鸡基因序列（ＮＣ＿００６０８９．４）比对后发现，静原鸡Ｅ２Ｉ６引物扩??增片段多态性是由内含子６上的核苷酸点突变造成的，等位基因序列比对如图２－６，等位基??因Ｂ４存在ｇ．６３３８８０００＋７４８Ｇ＞Ｃ的颠换。静原鸡Ｅ２Ｉ２引物扩增片段多态性是由内含子２上??的核苷酸点突变造成的，等位基因序列比对如图２－７，其中等位基因Ｂ３存在??ｇ．６３３７２２２８＋４９１８Ｇ＞Ａ的转换和ｇ．６３３７２２２８＋５０２４Ｔ＞Ｃ的转换，等位基因Ａ３存在??ｇ．６３３７２２２８＋５０２４Ｔ＞Ｃ?的转换，等位基因?Ｄ３?存在?ｇ．６３３７２２２８＋４９１８Ｇ＞Ａ?的转换、??ｇ．６３３７２２２８＋４９２８Ｃ＞Ａ的颠换和ｇ．６３３７２２２８＋５０２５Ｔ＞Ｃ的转换。静原鸡Ｅ２Ｉ４引物扩增片段多??态性是由内含子区的核苷酸点突变造成的，其中等位基因Ｂ５存在ｇ．６３３８６５０２＋２１１Ａ＞Ｇ的转??换，等位基因Ｃ５存在ｇ．?６３３８６５０２＋１６５Ｔ＞Ｃ的转换和ｇ．?６３３８６５０２＋２１１Ａ＞Ｇ的转换（图２－８）。??２．２．４．３静原鸡基因内含子２序列比对分析??与ＮＣＢＩ公布的原鸡说ＯＦＺ５基因序列（ＮＣ＿００６０９０．４）进行比对，静原鸡Ｅ５Ｉ２引物扩??增片段多态性是由第二内含子的核苷酸点突变造成的
论文?第三章静原鸡ＥＬ０ＶＬ２及ＥＬＯＶＬ５基因ｍＲ析??度分析??ＮＡ利用２％琼脂糖凝胶电泳进行检测，结果如图３－１所示，２８Ｓ、１８Ｓ、５Ｓ，无明显降解。总ＲＮＡ的纯度通过分光光度ＯＤ２６０／ＯＤ２８０在１．８？２．０之间，说明提取的ＲＮＡ纯度较高，
【参考文献】：
期刊论文
[1]牛妊娠相关糖蛋白BoPAG1的制备及生物信息学分析[J]. 杨亚军,王震,张洁,徐明国,陈创夫. 生物技术. 2019(01)
[2]油酸和亚油酸对山羊乳腺细胞甘油三酯含量及乳脂合成相关基因表达的影响[J]. 李君,杨文卓,候霞飞,王笑笑,姬向波,李新锋,权凯. 中国畜牧兽医. 2019(02)
[3]论生物信息学在动物遗传育种中的应用[J]. 朱淼. 南方农机. 2018(23)
[4]静宁鸡PPARα基因克隆及生物信息学分析[J]. 李萌楠,江婷,宋爱娟,杨悦,杨妍梅. 甘肃畜牧兽医. 2018(11)
[5]固原鸡生肌调节因子MyoD基因克隆及其组织表达分析[J]. 张久盘,王锦,张娟,魏大为. 中国家禽. 2018(21)
[6]ELOVL6基因研究现状[J]. 胡忠昌,曹阳,秦立红,吴健,赵玉民. 黑龙江畜牧兽医. 2018(19)
[7]静宁鸡肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性筛查及生物信息学分析[J]. 张丽,刘丽霞,戴洪伟,陈红,王瑞,岳炳辉. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2018(05)
[8]生物类专业生物信息学课程教学探索——华南农业大学生物类专业生物信息学课程的教改实践与思考[J]. 易继财. 安徽农业科学. 2018(26)
[9]鸡基因组育种和保种用SNP芯片研发及应用[J]. 刘冉冉,赵桂苹,文杰. 中国家禽. 2018(15)
[10]浅析生物信息学在动物遗传育种中的应用[J]. 黄晶. 农民致富之友. 2018(13)
博士论文
[1]静宁鸡肌肉发育调控机理[D]. 安锋利.兰州大学 2013
硕士论文
[1]牛EL0VL5基因核心启动子的确定及其启动子多态性影响乳质性状的分子机制[D]. 郭鹏程.吉林大学 2017
[2]兰州鲇生长性状相关基因的分离、序列特征及组织特异性表达分析[D]. 俞兆曦.甘肃农业大学 2016
[3]固原鸡不同群体生产性能及鸡肉营养成分的试验研究[D]. 王晓薇.宁夏大学 2013
[4]小鼠elovl2与△6 desaturase及线虫sfat1三基因共转促进EPA向DHA转化的研究[D]. 孙晓艳.陕西师范大学 2012
[5]不同饲养方式下二郎山山地鸡脂肪酸含量及ELOVL2、ELOVL5基因的组织表达研究[D]. 杨琴.四川农业大学 2011
本文编号：2952363
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