我国部分地区猪瘟E2及HeN2F16株的基因测定与分析

发布时间：2023-06-27 22:18

　　猪瘟(Classical swine fever, CSF)是由黄病毒科(Flaviviridae)瘟病毒属(Pestivirus)的猪瘟病毒(Classical swine fever Virus, CSFV)所引起的一种急性、热性和高度接触性传染病。曾对我国的畜牧养殖业造成严重影响,因其发病迅速、病死率高且有垂直感染等特点,已被国际兽疫防治局(OIE)列为重大动物疫病一类动物传染病。在我国已采取强制免疫措施,近些年来,由于全国范围内进行CSFV强制免疫工作,猪瘟的阳性率一直维持在10%～15%,尚不能彻底消灭,更多以伴发或者以温和型猪瘟的形式为表现。故此,有学者认为传统的猪瘟疫苗可能对我国当前流行的猪瘟病毒免疫保护作用有限。 本研究主要通过现有流行毒株,参照传统疫苗进行分子序列比对,从分子层面对比现有流行毒株与传统疫苗株之间的差异。为分析我国CSFV遗传变异情况,本研究根据己发表的文献设计合成E2主要抗原区基因的引物,采用RT-PCR方法,对2012-2013年我国12个省收集到的组织样品进行E2基因扩增与序列测定,并利用MEGA和DNAstar进行遗传进化分析。试验结果如下： 结...

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

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CONTENTS
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 CSFV基因的结构和功能
        1.1.1 5’端非编码区(5’-NTR)
        1.1.2 CSFV编码区(ORF)
        1.1.3 3’端非编码区(3’-NTR)
    1.2 CSFV分子流行病学研究进展
        1.2.1 CSFV基因亚群研究进展
        1.2.2 CSFV抗原表位研究进展
    1.3 CSFV全基因研究
        1.3.1 国际CSFV全基因研究
        1.3.2 我国CSFV全序列研究
    1.4 研究的目的和意义
2 材料与方法
    2.1 材料
        2.1.1 样品来源
        2.1.2 主要仪器
        2.1.3 主要试剂
        2.1.4 主要试验细胞
    2.2 试验方法
        2.2.1 试剂配制
        2.2.2 引物合成
        2.2.3 病料处理
        2.2.4 病料检测
        2.2.5 CSFV流行毒株的分离
        2.2.6 全基因克隆
        2.2.7 序列测定拼接及结果分析
        2.2.8 CSFV的E2蛋白结构预测
3 结果与分析
    3.1 PCR扩增结果
        3.1.1 CSFV的检测及RT-PCR扩增情况
        3.1.2 全基因10段RTPCR扩增结果
        3.1.3 HeN2F16序列拼接结果
    3.2 CSFV E2 B/C区遗传变异情况
        3.2.1 CSFV亚群分布
        3.2.2 CSFV核苷酸同源性
        3.2.3 CSFV氨基酸同源性
        3.2.4 B/C区氨基酸位点变异
        3.2.5 HeN2F16全基因克隆
    3.3 分析与讨论
        3.3.1 我国CSFV流行毒株分群特点
        3.3.2 B/C区氨基酸位点变异分析
        3.3.3 CSFV基因序列及蛋白质分析
4 结论
致谢
参考文献
附录
攻读硕士学位期间发表的学术论文



本文编号：3835440