基于转录组数据的意大利蝗微卫星位点分析与分子标记开发

发布时间：2023-11-27 20:06

　　【目的】意大利蝗Calliptamus italicus (L.)是新疆荒漠半荒漠草原重要害虫。本研究利用已获得的意大利蝗转录组数据,鉴定其微卫星位点。【方法】使用MISA筛选SSR位点,利用Primer Premier 5设计引物,通过PCR扩增对引物进行验证。【结果】在意大利蝗转录组数据库中,共检测出156500个SSR位点,分布在126369条unigene中。其中,单核苷酸重复为60.88%,二核苷酸重复为23.58%,三核苷酸重复和四核苷酸重复分别为12.99%和2.04%。单核苷酸重复主要为A/T(44.38%),二核苷酸重复主要为AC/GT(12.99%)和AG/CT(8.05%)。基于筛选的SSR位点设计引物,随机挑选24对引物,对10个不同地理种群意大利蝗成虫DNA样品进行PCR扩增,共有6对引物扩增成功。【结论】本研究利用转录组数据发掘意大利蝗SSR位点,为意大利蝗分子标记、种群遗传及功能基因等研究奠定基础。

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 意大利蝗转录组数据来源
    1.2 供试虫源及DNA提取
    1.3 SSR鉴定
    1.4 SSR引物设计及验证
2 结果与分析
    2.1 意大利蝗转录组中SSR位点的分布特征
    2.2 意大利蝗成虫SSR引物设计与PCR扩增
3 讨论与结论



本文编号：3868488