基于转录组测序分析中国西门塔尔牛和安格斯牛脂肪沉积相关基因的差异表达

发布时间：2024-11-02 16:57

　　中国西门塔尔牛和安格斯牛的肉用性能良好,是内蒙古通辽地区饲养的主要肉牛品种。牛肉背部脂肪沉积情况是衡量牛肉营养价值和生产机能的主要指标。对屠宰试验所得的肉质数据进行独立样本T检验,发现中国西门塔尔牛和安格斯牛在剪切力、滴水损失、熟肉率和背膘厚度都存在极显著差异(p<0.01)。并对相关数据进行聚类分析,筛选出中国西门塔尔牛和安格斯牛各三头牛的背膘组织进行送样测序。通过BGISEQ-500平台获取了 6个背膘样品的转录组测序数据,结果显示样品比对基因组的平均比对率为92.32%,比对基因集的平均比对率为80.69%。一共检测到21,970个基因,检测出19,747个新转录本,其中16,576个是预测编码的转录本,15,643个属于已知蛋白编码基因的新的可变剪接亚型,933个属于新的蛋白编码基因的转录本,剩下的3,171个属于长链非编码RNA。GO功能分类注释到生物学过程的差异表达基因为3,149个、细胞组成的差异表达基因为2204个和分子功能数据库中的差异表达基因890个,并将三大功能类进行了单独的的分类和富集分析。通过KEGG代谢通路分析牛背膘组织的Unigene,参与了 6大类共...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

?方面差异??不显著；Ｆｂｆｔ＝１３．４７８，ＰＢＦＴ＝０．０４＜０．０５，方差不齐，ＰＢＦＴ＝０．００７＜０．０１，表明两品种牛??在背膘厚度方面差异极显著；ＦＥＭａ＝０．０６２，ＰＥＭａ＝０．８０８＞０．０５，方差齐，Ｐｅｍａ＝〇．３５９＞０．０５，??表明两品种牛在眼肌面积....

ｔｔｅｒ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ＤＥＧｓ．??注：Ｘ、Ｙ轴均代表基因表达量的对数值。??３．?２．?７样品间及组间的基因表达情况??对于多个样品的表达量数据，利用维恩图展示了基因在不同样品间及组间的表达??情况。安格斯牛的转录组测序数据中共有１９１４７个基因，中国西门塔尔牛中有１８９３....

２２?基于转录组测序分析中国西门塔尔牛和安格斯牛脂肪沉积相关基因的差异表达??ＤＥＧｓ?Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?Ｔｈｅ?Ｍｏｓｔ?Ｅｎｒｉｃｈｅｄ?ＧＯＴｅｒｍ???ｂ？〇？〇ｇｉｃａ？＿ｐｆ〇ｃｅｓｓ??ｃｅ？ｕ？ａｆ＿ｃｏｍｐ〇ｎｅｎｔ??ｍｏｔｅｃｕｔａｒ?Ｊｕｎｃｔｉｏｎ??....

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本文编号：4009835