新型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定及其σC基因遗传进化分析

发布时间：2025-01-14 18:16

　　 新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)病,是一种以肝脾不规则坏死、出血斑/点和心肌、腔上囊出血为主要特征的新疫病。为研究某养鸭企业不同年份分离的NDRV病株的生物学特性,本研究将2019年从25份樱桃谷鸭脏器组织中分离的3株病毒以及2016年和2017年分离的2株病毒同时进行了生物学特性比较研究。RT-PCR及基因测序结果表明,该5株分离病毒均为NDRV,且纯净性良好。体外复制研究表明,该5株分离病毒均能100%致死鸡胚,且在Vero细胞中增殖良好;除2017年的分离株外,其余4株分离病毒均能在CEF中产生明显的细胞病变。σC基因同源性及遗传进化分析显示,5株NDRV分离株与其它NDRV病毒株之间具有较高的同源性(90.0%～98.2%),而与番鸭呼肠孤病毒(MDRV)同源性较低(29.6%～46.1%),再次证明5株分离病毒均为NDRV,但2017年分离株NDRV-SD19/6202与其余4株病毒的遗传距离稍远。σC基因编码氨基酸序列分析结果显示,以CEF适应病毒为代表的NDRV-SD19/6201株与CEF非适应病毒NDRV-SD19/6202株之间存在13个氨基酸差异位点,但这些差异位点是...

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【部分图文】：

图1 NDRV分离病毒体外感染细胞后的CPE观察

分别将5株NDRV分离病毒接种原代CEF及传代Vero细胞，观察其CPE。结果显示，NDRV-SD19/6304、NDRV-SD19/6307、NDRV-SD19/7304及NDRV-SD19/6201株病毒在两种细胞中均可增殖，产生明显CPE（图1）。而NDRV-SD19/62....

图2 5株分离病毒的σC基因的RT-PCR扩增结果

利用本研究设计合成的NDRVσC基因的特异性引物，对上述5株分离病毒进行RT-PCR扩增。结果显示均可获得约1000bp的目的条带，与预期一致（图2）。以上结果进一步表明，分离的5株病毒均为NDRV。2.7分离病毒σC基因同源性及遗传进化分析

图4 两株NDRV分离病毒σC基因编码氨基酸序列的比对分析

为进一步探究造成上述分离株在CEF中复制差异产生的原因，本研究选取NDRV-SD19/6201作为适应CEF增殖的代表株，与非适应CEF增殖的NDRV-SD19/6202株的σC蛋白氨基酸序列进行比对，结果显示两株病毒之间共存在13个差异位点。有研究报道显示，σCC端的aa15....

图3 NDRV分离株的σC基因核苷酸序列遗传进化分析

利用Multalin在线软件对在CEF中复制特性不同的两株分离病毒NDRV-SD19/6201与NDRV-SD19/6202的σC基因编码氨基酸序列进行比对分析，结果显示两者之间存在13个氨基酸差异位点，分别位于第P9L、Y16C、T25K、I64T、E65D、L66M、G74S....

本文编号：4026999