荷斯坦奶牛CXCL8基因SNPs检测及其与乳房炎和产奶性状的关联分析

发布时间：2017-08-08 11:36

  本文关键词：荷斯坦奶牛CXCL8基因SNPs检测及其与乳房炎和产奶性状的关联分析

  更多相关文章： CXCL8 荷斯坦奶牛 乳房炎 SNPs 关联分析

【摘要】：白介素8(interkeukin8,IL8)作为一种中性粒细胞趋化因子是趋化因子大家族的一员。曾有试验CXCL8在乳腺炎患者的血清中的分泌量高于健康对照者的血清分泌量。CXCL8的研究主要集中在人类的乳腺癌上,本试验以CXCL8基因作为影响奶牛生产性状及乳房炎的候选基因,探索其与奶牛的生产性能及乳房炎的相关性。本研究先利用DNAMAN软件、在线软件Ex PASy及在线软件PSORT II Prediction等生物软件对奶牛CXCL8基因进行生物信息学分析。提取446份经产奶牛的颈静脉血样中的DNA,用PCR技术扩增目的基因,使用直接测序检测该基因中的多态位点。采用PCR-RFLP和四引物法技术对多态性位点进行基因分型,最后与荷斯坦奶牛乳腺炎和产奶性状进行关联分析,旨在筛查与奶牛多种产奶性状及乳房炎相关的多态位点,为对于中国荷斯坦奶牛种质资源选育和高效养殖提供遗传基础。本次测试的主要结果如下:1.CXCL8基因的生物信息学分析对CXCL8进行奶牛、绵羊、猪、家犬、兔子、人和野马之间的核苷酸同源性分析,得出奶牛的CXCL8和绵羊、猪之间的同源性在90%以上,说明该基因在奶牛,猪,绵羊这三个物种间有很高的保守性。对奶牛CXCL8基因编码的蛋白质进行结构和功能预测,结果表明CXCL8蛋白为亲水性蛋白,在细胞内质网有少量存在。2.CXCL8基因遗传变异检测本研究对CXCL8基因进行测序检测,最终检测到4个SNPs位点。CXCL8基因的C202T、C264T、A302G和A2471G均位于内含子区。3.CXCL8基因群体遗传学分析对CXCL8基因进行群体遗传学分析发现,其中三个SNP位点C202T、C264T和A302G均处于中度多态,只有A2471G位点为低度多态。CXCL8基因的C202T、A302G两个突变位点均处于Hard-Weinberg平衡(P0.05),C264T、A2471G两个突变位点均不处于Hard-Weinberg平衡(P0.05)。4.CXCL8基因与奶牛的生产性状及乳房炎的关联分析利用SPSS 20.0进行最小二乘均值分析表明CXCL8基因A2471G位点与奶牛的乳脂率显著相关(P0.05),AG基因型具有较低的乳脂率。中国荷斯坦奶牛CXCL8基因的生物信息学分析、多态位点检测及其与产奶性状和乳房炎的关联分析,为进一步研究CXCL8基因的生物学功能提供了理论依据,为了解其在乳房炎抗性中的作用机理提供一定的理论基础。
【关键词】：CXCL8 荷斯坦奶牛 乳房炎 SNPs 关联分析
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S823;S858.23
【目录】：

• 摘要6-8
• ABSTRACT8-12
• 第一章 综述12-22
• 1.1 奶牛乳房炎12
• 1.2 乳房炎的分类12-14
• 1.2.1 隐性乳房炎12-13
• 1.2.2 临床性乳房炎13
• 1.2.3 慢性乳房炎13-14
• 1.3 SNP概述14-17
• 1.3.1 SNP概念14
• 1.3.2 SNP主要检测方法14-17
• 1.4 CXCL8简介及研究现状17-21
• 1.4.1 白介素17-18
• 1.4.2 白介素8及其研究现状18-21
• 1.5 研究目的及意义21-22
• 第二章 CXCL8基因的生物信息学分析22-27
• 2.1 材料与方法22-23
• 2.1.1 材料22
• 2.1.2 试验方法22-23
• 2.2 结果与分析23-26
• 2.2.1 奶牛CXCL8基因序列相似性比较23
• 2.2.2 奶牛CXCL8基因的系统进化树分析23-24
• 2.2.3 奶牛CXCL8蛋白理化性质分析24-25
• 2.2.4 奶牛CXCL8蛋白的亚细胞定位25
• 2.2.5 奶牛CXCL8蛋白的结构域分析25-26
• 2.3 小结26-27
• 第三章 CXCL8基因遗传变异检测及其与乳房炎和产奶性状的关联分析27-37
• 3.1 试验材料27-28
• 3.1.1 奶牛血样采集27
• 3.1.2 仪器和设备27
• 3.1.3 药品和试剂27-28
• 3.2 试验步骤28-30
• 3.2.1 血样采集28
• 3.2.2 血样中DNA的提取28
• 3.2.3. 提取的血样DNA检测28
• 3.2.4 引物的设计28-29
• 3.2.5 PCR扩增、测序与酶切，，四引物检测29-30
• 3.3 试验结果30-33
• 3.3.1 CXCL8基因SNP位点检测30-32
• 3.3.2 CXCL8基因SNP位点分型32-33
• 3.3.3 CXCL8基因SNP位点分布33
• 3.4 结果分析33-35
• 3.4.1 CXCL8基因的群体遗传学分析33-34
• 3.4.2 CXCL8基因多态性与产奶性状、乳房炎的关联分析34-35
• 3.5 CXCL8基因在荷斯坦奶牛分子育种中的应用理论35-36
• 3.5.1 荷斯坦奶牛生产性状相关的CXCL8基因标记理论研究方案35
• 3.5.2 荷斯坦奶牛的本品种选育35-36
• 3.6 讨论36
• 3.7 小结36-37
• 结论与创新点37-38
• 参考文献38-44
• 附录44-51
• 致谢51-52
• 作者简介52

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 管学文,陈凯,徐淑红;中药“乳炎散”治疗慢性乳房炎效果好[J];中国奶牛;2001年05期

2 张双德;如何防治母羊乳房炎[J];农业科技与信息;2001年06期

3 李有业;治疗乳房炎新型敷贴剂——乌别尔桑[J];兽药与饲料添加剂;2001年01期

4 张生科;狗乳房炎的治疗[J];特种经济动植物;2001年09期

5 王震,王柏生;封闭式治疗长毛兔乳房炎的体会[J];中国养兔;2001年05期

6 张国红,王永忠;乳炎必治注射液对母畜乳房炎的疗效观察[J];湖北畜牧兽医;2002年04期

7 张国拥;;告诉您一个治疗乳房炎的好方法[J];北方牧业;2003年02期

8 张双德;母羊乳房炎防治[J];农村养殖技术;2004年13期

9 陈昌建;乳房炎的控制与挤奶管理[J];中国乳业;2005年08期

10 谷魁菊,张影英;中西医结合治疗牛慢性乳房炎[J];黑龙江畜牧兽医;2005年08期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 任改仙;高健;刘修权;史为民;苏敬良;韩博;;北京牛场不同月份乳房炎发病变化的调查[A];中国畜牧兽医学会2010年学术年会——第二届中国兽医临床大会论文集(上册)[C];2010年

2 孙莉颖;;犬乳房炎的诊治[A];中国畜牧兽医学会养犬学分会第十二次全国养犬学术研讨会论文集[C];2007年

3 罗飞;;牛(隐性)乳房炎四种常见诊断方法的对比及建议[A];第三届中国奶牛发展大会论文集[C];2008年

4 李宗方;;集约化牧场乳房炎防控体系的建立[A];第四届中国奶业大会论文集[C];2013年

5 董和平;张健;;一例犬急性乳房炎的诊断和治疗[A];中国畜牧兽医学会小动物医学分会第四次学术研讨会、中国畜牧兽医学会兽医外科学分会第十六次学术研讨会论文集（2）[C];2009年

6 林藩平;;维生素Ｅ和微量元素硒在营养和免疫上的重要作用──二者可用于预防乳牛乳房炎[A];福建省畜牧兽医学会第七次会员代表大会暨学术研讨会论文集[C];1994年

7 韩永麟;;抗菌弹性牛床垫与乳房炎的研究[A];中国奶业协会年会论文集2009（下册）[C];2009年

8 韩超;;规模牛场乳房炎防治综合措施[A];第四届全国牛病防制及产业发展大会论文集[C];2012年

9 时乃林;;奶山羊乳房炎的预防[A];《2008中国羊业进展》论文集[C];2008年

10 刘利;许尚忠;李俊雅;高雪;高会江;;浅谈奶牛金黄色葡萄球菌性乳房炎[A];中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会论文集[C];2011年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 ;美科学家发现绿色治疗乳房炎方法[N];中国畜牧兽医报;2006年

2 苏传胜;能自愈的乳房炎[N];家庭医生报;2007年

3 ;乳房炎的诊断与防治[N];中国畜牧水产报;2001年

4 王力波;奶牛乳房炎的发生、分类与防治措施[N];中国畜牧兽医报;2006年

5 ;大动物乳房炎的介绍与防治[N];中国畜牧水产报;2000年

6 ;大动物乳房炎的介绍与防治（完）[N];中国畜牧水产报;2000年

7 ;乳康灵奶畜乳房炎的发生及治疗[N];中国畜牧水产报;2001年

8 陕西省畜牧兽医研究所 吕亚军;畜禽乳房炎与“乳康灵”[N];中国畜牧报;2002年

9 山东荷斯坦奶牛繁育中心 王海涛 刘晓飞 尉景宝;乳房炎的治疗与预防[N];中国畜牧报;2004年

10 周岩;浅谈临床乳房炎的防治[N];中国畜牧兽医报;2009年

中国博士学位论文全文数据库 前5条

1 许金俊;奶牛γ-干扰素基因的表达及其在乳房炎防治中的初步应用[D];扬州大学;2004年

2 刘利;牛外周血单个核细胞的免疫研究[D];中国农业科学院;2012年

3 张锦霞;抗菌肽在动物乳腺中的表达及对乳房炎主要病原菌的抑制效应研究[D];吉林大学;2006年

4 陈仁金;中国荷斯坦牛乳房炎相关基因遗传效应、IL8和CXCR1基因聚合效应及表达规律的研究[D];扬州大学;2011年

5 王兴平;奶牛TLR4及其信号转导基因的克隆、SNPs检测与乳房炎的关联分析[D];西北农林科技大学;2007年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 杨春合;奶牛乳区温度影响因素及与乳房炎的关系研究[D];中国农业科学院;2015年

2 黄龙;奶牛临床乳房炎源大肠杆菌主要毒力基因的克隆与序列分析[D];宁夏大学;2015年

3 李婧;乳房炎患牛乳腺组织来源的成纤维细胞对正常乳腺上皮细胞生物学特性和β-酪蛋白分泌的影响[D];西北农林科技大学;2015年

4 闫川;“隐乳净”对奶牛隐性乳房炎治疗效果的研究[D];山东农业大学;2014年

5 苟丽萍;粒细胞集落刺激因子水平对围产期奶牛乳房炎发生的影响研究[D];四川农业大学;2015年

6 陈富强;TLR2、TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺组织中表达的研究[D];甘肃农业大学;2016年

7 吴肖肖;荷斯坦奶牛CXCL8基因SNPs检测及其与乳房炎和产奶性状的关联分析[D];西北农林科技大学;2016年

8 张亚琴;运用多座位外显方差法分析荷斯坦牛候选基因与乳房炎易感性的关系[D];扬州大学;2012年

9 杨庆丽;奶山羊乳房炎的淋巴细胞与乳腺上皮细胞凋亡规律[D];东北农业大学;2007年

10 刘莉莉;奶山羊乳房炎的氧化损伤及其机理[D];东北农业大学;2007年

本文编号：639816