2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析

发布时间：2017-10-31 00:24

  本文关键词：2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析

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【摘要】：目的分析近年湖北省麻疹病毒流行株基因型别以及血凝素蛋白(H)基因特性。方法对2012-2013年麻疹病毒核酸检测阳性的患者标本,直接提取核酸,采用one-step逆转录—聚合酶链反应方法扩增核蛋白(N)和血凝素蛋白(H)基因,测序后进行同源性和进化分析。结果湖北省麻疹病毒流行株主要为H1基因型的H1a亚型,发现一株D8基因亚型。与中国麻疹疫苗株上海191株的N和H基因比较,其核苷酸同源性分别为91.6%~92.4%和94.6%~94.8%。对湖北省H1a亚型麻疹病毒H基因进化分析发现均属lineage 3b,H蛋白序列分析发现第240和第397位氨基酸分别发生Ser→Asn、Pro→Leu的变异。运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计H1a基因亚型H基因核苷酸的平均碱基替代率为7.619×10-4取代/位点/年,估算其共同祖先大约出现在1980年。结论湖北省2012-2013年麻疹病毒流行株主要H1a基因型,仅1例D8亚型;与中国疫苗株沪191株相比较,两者在基因特性上存在明显差异,需进一步加强对麻疹病毒基因型别和变异程度的监测。
【作者单位】： 湖北省疾病预防控制中心传染病防治研究所病原微生物检测中心;
【关键词】： 麻疹病毒 核蛋白 血凝素蛋白 基因进化
【基金】：“十二五”国家科技重大专项(2012ZX10004207) 湖北省医学领军人才培养工程(2014年)
【分类号】：R373.11
【正文快照】： (Chin J Dis Control Prev 2015,19(8):760-764)物学。麻疹是常见的高传染性急性呼吸系统传染病,其病原体麻疹病毒(measles virus,MV)属于副黏病毒科麻疹病毒属,仅1个血清型。麻疹病毒基因遗传性较稳定,但从20世纪80年代初以来,国内外陆续发现新分离的麻疹病毒野毒株,这些野毒

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本文编号：1120007