RhD抗体ssDNA适配体结构分析
本文关键词:RhD抗体ssDNA适配体结构分析
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【摘要】:目的预测RhD抗体核酸适配体序列库中优势适配体,为实验室验证做准备。方法对以RhD抗体为目标靶分子而筛选出的适配体序列库做克隆测序;使用ClustalⅩ软件对阳性克隆子序列做同源性分析;使用DNA folding form在线分析工具对阳性克隆子碱基序列做最小自由能及二级结构分析。结果 RhD抗体28个阳性克隆子碱基序列按照基序的不同可分为3个家族,家族1和2中的适配体又可分为不同的亚家族;可形成由2-4个多分支环组成的二级结构,最小自由能在(-7.47--5.09)kcal/mol。结论 RhD家族1中的亚家族3和4适配体二级结构较为稳定,最小自由能较低,是RhD抗体适配体库中的优势适配体。
【作者单位】: 深圳市血液中心;陕西省血液中心;广州中医药大学第二附属医院输血科;
【基金】:深圳市科技计划项目(JCYJ20140403092619633)
【分类号】:R392
【正文快照】: 核酸适配体(Aptamer)是通过指数富集的配体系统进化(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX)技术筛选获得的单链寡核苷酸,可与目标靶分子特异性结合,具有抗体的性质[1]。近年来核酸适配体的研究在临床诊断及靶向药物研究等方面得以广泛应用[2]。Rh
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,本文编号:1247391
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